《中国科学院海洋研究所发现深海非光合细菌通过蓝光感受器感知蓝光》

  • 来源专题:中国科学院文献情报系统—海洋科技情报网
  • 编译者: liguiju
  • 发布时间:2022-02-23
  • 近日,国际学术期刊mSystems刊发了题为“A deep sea bacterium senses blue light via a BLUF dependent pathway”的文章,报道了中国科学院海洋研究所孙超岷课题组关于深海冷泉非光合细菌通过蓝光感受蛋白感知蓝光并激发能量合成的研究成果,为深海微生物能感知并利用光能提供了又一例证。

    众所周知,万物生长靠太阳,大量研究也证实了真光层生物的生长或多或少的都会受到光的影响。但对于深海生境,长期以来,研究人员普遍认为是一个黑暗的、由化学能支撑维系的生态系统。但越来越多的证据表明,不仅深海热液区,其它深海生境(如冷泉)也存在不同形式地质光或生物发光。研究表明,有接近80%的深海动物能够发光,发光形式以蓝光为主。很多微生物学家也一直在探究深海微生物是否能够感受乃至利用蓝光或其它波长的光。但受制于深海样品采集的难度以及深海微生物的难培养特性,上述问题一直没有得到有效解决。

    围绕如上科学问题,孙超岷研究团队基于“科学”号2017年从我国南海深海海域一处冷泉喷口附近采集的沉积物,采用蓝光富集培养技术从沉积物样品中获得了一株海绵杆菌。研究发现,相比于其它类型的光,该菌株在蓝光(470 nm)照射下可获得最快生长速度。但基因组测序表明,该菌株不包含叶绿素合成通路及视紫红质编码基因,不属于常见的光能利用类型。蛋白质组结果表明,该细菌蓝光感受蛋白BLUF在感受蓝光过程中发挥着重要作用,研究人员通过分子遗传学手段把编码BLUF的基因敲除掉,发现该细菌感知蓝光的能力明显减弱,进一步验证了蛋白组的结果;与体内实验的结果一致,体外表达的蓝光蛋白也显示了明显的蓝光感受活性。以上蛋白组学、遗传学及生物化学实验结果综合证实了蓝光感受蛋白BLUF介导了深海细菌对蓝光的感知,并进一步激活了乙酰辅酶A的合成通路,进而显著增强了三羧酸循环通路及能量产生,最终促进了菌株的快速生长。值得注意的是,蓝光感受器BLUF的同源蛋白广泛分布于深海微生物中,表明了很多深海来源的微生物也能通过类似的途径感受并利用蓝光,也提示微生物学家在今后的研究中需要考虑微生物介导的光能代谢对深海生态系统能量循环的贡献。

    实验海洋生物学重点实验室博士研究生单业奇为第一作者,孙超岷研究员为通讯作者。研究得到了中国科学院战略性先导科技专项、中国科学院海洋大科学中心前沿重点部署等项目联合资助。

    相关论文:

    Yeqi Shan, Ge Liu, Ruining Cai, Rui Liu, Rikuan Zheng, Chaomin Sun*. A deep-sea bacterium senses blue light via a BLUF-dependent pathway. mSystems, 2022, 7(1): e01279-21. Doi: 10.1128/msystems.01279-21.

    论文链接:https://journals.asm.org/doi/10.1128/msystems.01279-21.

  • 原文来源:http://www.qdio.cas.cn/2019Ver/News/kyjz/202202/t20220214_6354498.html
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    • 近日,国际期刊Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences (Nature Index) 刊发海洋所徐奎栋研究组关于营养盐与蓝细菌-异养细菌互作关系的最新研究成果,揭示了寡营养大洋区域营养盐浓度对蓝细菌-异养细菌相互作用关系的调控作用,从生物相互作用的角度强调了全球变化对细菌多样性和功能的潜在负面影响。 由于全球变暖,全球海洋上层的热分层现象有所加强,阻碍向透光层的垂直营养供应,从而直接影响海洋初级生产力及碳汇。海洋浮游光合生物贡献了地球近50%的初级生产力。其中,蓝细菌是海洋最主要的初级生产者之一,贡献了海洋净初级生产力的约25%。海洋蓝细菌和异养细菌参与复杂的生态相互作用,可直接或间接影响海洋生物地球化学循环。要了解全球变化下细菌在海洋生物地球化学循环中的作用,就必须厘清蓝细菌和异养细菌互作网络与营养盐供应的关系。在共培养系统中,蓝细菌与异养细菌之间可形成一种互利关系,使蓝细菌能够在没有营养盐额外供应的寡营养环境中生存和生长。这种互利关系易受营养盐浓度的影响,在高营养环境下互利关系受到破坏。然而,自然条件下,营养盐如何驱动蓝细菌和异养细菌的相互作用关系,仍不清楚。 徐奎栋研究组选择寡营养大洋中海山作为研究区域,同时结合Tara Oceans全球海洋调查数据,对不同营养盐浓度下的蓝细菌-异养细菌相互作用关系开展研究,分析了营养盐浓度对蓝细菌-异养细菌互利关系的影响,并探讨了蓝细菌-异养细菌响应营养盐浓度变化的机制。 结果表明,营养盐垂直输送增强的海山区叶绿素最大层(DCM)细菌互作关系的复杂程度远高于营养盐垂直输送较弱的区域。营养盐在调节细菌互作关系中发挥重要作用;受营养盐影响的类群主要为原绿球藻和α变形菌SRA11类群。在全球尺度下,硝酸盐浓度与蓝细菌-异养细菌相互作用的比例呈显著正相关关系。研究表明,蓝细菌-异养细菌合作关系可调节细菌的相对丰度,改善细菌群落的均匀性,进而提高群落的稳定性。在一定阈值下,升高的营养盐浓度增加了原绿球藻的丰度和多样性,进而使得与蓝细菌存在代谢关系的类群得以与之建立更多的互利关系。 研究指出,全球气候变化导致表层海水温度逐渐升高,这一过程将加剧海水分层,阻碍深层海水向表层的营养输送。在寡营养海洋中,营养盐供应的减弱可能会导致蓝细菌的相对丰度和多样性下降,蓝细菌与异养细菌之间的相互作用减少,从而对海洋初级生产力和生物地球化学循环产生潜在的负面影响。而在营养物质丰富的沿岸地区,与人类活动有关的营养物质供应的急剧变化可能会进一步扰乱蓝细菌与异养细菌之间的相互作用。 论文第一作者为博士研究生刘巍岳,通讯作者为赵峰研究员和徐奎栋研究员,研究得到了国家自然科学基金重点项目、中国科学院战略性先导科技专项、崂山实验室、中国科学院青年创新促进会联合资助。 文章信息如下: Liu W, Zhao F, Li X, Zheng S, Li L, Zhao R, Xu K. 2024. Enhanced nutrient supply promotes mutualistic interactions between cyanobacteria and bacteria in oligotrophic ocean. Proc. R. Soc. B 291: 20240788. https://doi.org/10.1098/rspb.2024.0788
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