《COVID-19的流行病学参数:来自七个国家的1155例病例的公开报告数据的汇总分析》

  • 来源专题:生物安全知识资源中心 | 领域情报网
  • 编译者: hujm
  • 发布时间:2020-04-07
  • medRxiv预印平台于3月24日发表了中南大学等的题为“Epidemiological parameters of coronavirus disease 2019: a pooled analysis of publicly reported individual data of 1155 cases from seven countries”的文章,该文章旨在获得对COVID-19潜伏期,潜伏期上限(感染者与被感染者之间的暴露间隔),连续时间间隔,暴露时间点和基本再生数(R0)的可靠估计。研究人员2020年2月下旬至3月上旬,从中国和国外卫生部门发布的10728份公开报告中以及在PubMed和CNKI中鉴定的1790篇出版物中检索实验室确诊的COVID-19病例的个人数据。为了符合条件,报告必须包含允许估计至少一个参数的数据。由于相关数据主要来自聚类案例,因此没有证据可用于确定传播顺序的聚类都被排除在外,以确保估计的准确性。此外,仅将暴露时间跨度为3天或更短的病例包括在涉及暴露日期的参数估计中,并且采用一种确定暴露日期的简单方法来确保估计误差很小(<0.3天)。根据特定的参数,将三个或四个正态分布,对数正态分布,威布尔分布和伽玛分布拟合到数据集,并显示来自适当模型的结果。总共包括来自中国、日本、新加坡、韩国、越南、德国和马来西亚的1155例病例进行了最终分析。
    该研究发现,潜伏期的平均值和标准差为7.44天和4.39天,潜伏期上限的平均值和标准差为2.52天和3.95天,连续间隔的平均值和标准差为6.70天和5.20天,以及暴露时间点的平均值和标准差为-0.19天(即感染者症状发作前的0.19天)和3.32天。根据两个不同的公式,R0估计为1.70和1.78。39例(6.64%)的潜伏期超过14天。在102对(43.78%)传染者-被感染者对中,传播发生在传染者症状发作之前。在27对(3.92%)传染者-被感染者对中,被感染者的症状发作先于传染者。分层分析表明,对于那些病情较轻的患者和原发病例病情较轻的患者,潜伏期和连续间隔时间更长。还观察到无症状传播。
    文章指出,该项研究获得了COVID-19几个关键流行病学参数的可靠估计。这些发现支持了对潜在接触者进行14天隔离的当前做法,但也表明对选定的人群可能需要更长的监测时间。连续间隔、暴露时间点和潜伏期的估计为症状发生前的传播提供了一致的证据。再加上无症状的传播以及不太严重的病例通常较长的潜伏期和连续的间隔时间,提示在缺乏适当控制措施的情况下长期流行的高风险。
    *注,本文为预印本论文手稿,是未经同行评审的初步报告,其观点仅供科研同行交流,并不是结论性内容,请使用者谨慎使用。

  • 原文来源:https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.03.21.20040329v1
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    • 编译者:zhangmin
    • 发布时间:2020-03-26
    • 1.时间:2020年3月24日 2.机构或团队:中南大学、北京大学深圳医院、北京大学、中南大学湘雅医院、香港中文大学 3. 事件概要: medRxiv预印平台于3月24日发表了中南大学等的题为“Epidemiological parameters of coronavirus disease 2019: a pooled analysis of publicly reported individual data of 1155 cases from seven countries”的文章,该文章旨在获得对COVID-19潜伏期,潜伏期上限(感染者与被感染者之间的暴露间隔),连续时间间隔,暴露时间点和基本再生数(R0)的可靠估计。研究人员2020年2月下旬至3月上旬,从中国和国外卫生部门发布的10728份公开报告中以及在PubMed和CNKI中鉴定的1790篇出版物中检索实验室确诊的COVID-19病例的个人数据。为了符合条件,报告必须包含允许估计至少一个参数的数据。由于相关数据主要来自聚类案例,因此没有证据可用于确定传播顺序的聚类都被排除在外,以确保估计的准确性。此外,仅将暴露时间跨度为3天或更短的病例包括在涉及暴露日期的参数估计中,并且采用一种确定暴露日期的简单方法来确保估计误差很小(<0.3天)。根据特定的参数,将三个或四个正态分布,对数正态分布,威布尔分布和伽玛分布拟合到数据集,并显示来自适当模型的结果。总共包括来自中国、日本、新加坡、韩国、越南、德国和马来西亚的1155例病例进行了最终分析。 该研究发现,潜伏期的平均值和标准差为7.44天和4.39天,潜伏期上限的平均值和标准差为2.52天和3.95天,连续间隔的平均值和标准差为6.70天和5.20天,以及暴露时间点的平均值和标准差为-0.19天(即感染者症状发作前的0.19天)和3.32天。根据两个不同的公式,R0估计为1.70和1.78。39例(6.64%)的潜伏期超过14天。在102对(43.78%)传染者-被感染者对中,传播发生在传染者症状发作之前。在27对(3.92%)传染者-被感染者对中,被感染者的症状发作先于传染者。分层分析表明,对于那些病情较轻的患者和原发病例病情较轻的患者,潜伏期和连续间隔时间更长。还观察到无症状传播。 文章指出,该项研究获得了COVID-19几个关键流行病学参数的可靠估计。这些发现支持了对潜在接触者进行14天隔离的当前做法,但也表明对选定的人群可能需要更长的监测时间。连续间隔、暴露时间点和潜伏期的估计为症状发生前的传播提供了一致的证据。再加上无症状的传播以及不太严重的病例通常较长的潜伏期和连续的间隔时间,提示在缺乏适当控制措施的情况下长期流行的高风险。 *注,本文为预印本论文手稿,是未经同行评审的初步报告,其观点仅供科研同行交流,并不是结论性内容,请使用者谨慎使用。 4.附件: 原文链接:https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.03.21.20040329v1
  • 《开放获取的COVID-19疫情流行病学数据》

    • 来源专题:生物安全知识资源中心 | 领域情报网
    • 编译者:hujm
    • 发布时间:2020-02-24
    • 牛津大学的研究人员于2020年2月19日在The Lancet Infectious Diseases发表题为“Open access epidemiological data from the COVID-19 outbreak”的通讯文章。 2019年冠状病毒病(COVID-19)在中国迅速蔓延。在流行病早期,获得准确和可靠的流行病学、临床和实验室数据,对于指导公共卫生决策非常重要。流行病学信息的记录,了解传染性、地理传播风险、传播途径和感染风险因素,可为流行病学建模提供基线,为应对规划和控制措施提供信息。疫情爆发期间,很少能公开实时数据,使用各种模型和假设进行多种分析,有助于达成共识。这与基因组数据的开放共享存在相似之处。 研究人员建立了个人信息库,用于收集实验室确诊的COVID-19患者(在中国,通过在市和省疾病预防控制中心检测病毒核酸确认)病理信息,包括出行历史、位置(可用的最高分辨率和相应的经纬度)、症状和报告的发病日期,以及确认日期和基本人口统计数据。信息有多种来源,包括世卫组织、卫生部以及中国地方、省和国家卫生部门的官方报告。数据公开并定期更新(大约每天两次)。这些数据可为规划、建模和流行病学研究建立证据,更好地向公众、决策者、国际组织和资助者通报所处位置以及如何改进监测、应对工作和资源提供,这是控制COVID-19流行病的关键因素。 COVID-19流行病正在迅速蔓延,有必要建立计算基础设施,以应付的病例报告大量增加。数据共享对于评估和维持准确的病例报告至关重要。