美洲出现寨卡病毒正好出现出生小头畸形婴儿报道增多。2016年2月1日，世卫组织宣布寨卡病毒和小头畸形之间存在关联被定为国际关注的突发公共卫生事件。2016年3月《柳叶刀》杂志上刊登的一项对2013-15年法属波利尼西亚寨卡疫情的回顾性评估研究显示，孕妇在孕期前３月感染寨卡病毒后，出现小头症等出生缺陷的风险约为１％，大大高于通常情况。法国巴斯德研究所的研究人员对2013-15年间法属波利尼西亚暴发的寨卡疫情进行了回顾性分析。研究人员使用血清学和监测数据来估计每周感染寨卡病毒疫情的可能性，并对当时的孕妇感染者及新生儿情况进行追踪调查，以估计在怀孕期感染寨卡病毒可能会增加小头畸形的风险。寨卡病毒爆发开始于2013年10月，并于2014年4月结束，66％和总人口（95％CI 62-70）感染。在23个月的研究期间确定的8个小头畸形病例中，7例（88％）发生在2014年年3月1日到7日10日的4个月内，这些病例给出了怀孕的第一段前三个月是风险期的最好的解释。研究人员经过比对和建模，估计孕期前三个月感染寨卡的妇女诞下小头症婴儿的风险约为1%。但是其他孕期无法从感染排除畸形的增加风险，这个模型尚不支持数据分析。研究结果提供了小头畸形的胎儿和新生儿的母亲感染了寨卡病毒风险的定量估计。
