《自然变异识别基因对干旱诱导拟南芥脱落酸积累的影响》

  • 来源专题:转基因生物新品种培育
  • 编译者: Zhao
  • 发布时间:2017-11-03
  • 应激激素脱落酸(ABA)在干旱和低水量下的积累控制了许多下游适应机制。然而,控制拟南芥体内脱落酸(ABA)积累的机制尚不清楚。在约300个品种的拟南芥中,当其暴露于相同的低水量下,其中的脱落酸(ABA)水平的变化范围近乎有10倍。通过全基因组关联分析(GWAS),鉴定了含有ABA相关SNP簇的基因组区域,而这些区域内的候选基因包括已知压力或与脱落酸(ABA)相关功能的少数基因。(GWAS)的数据被用于指导反向遗传分析,其过程中发现了造成脱落酸(ABA)积累的效应物。这些效应物包括质膜定位信号蛋白(如受体样激酶、天冬氨酸蛋白酶),普遍认为与脂质结合启动相关的域蛋白,以及其他未知功能的膜蛋白如环U-box蛋白以及可能对脱落酸(ABA)积累有影响的液泡膜运输。其中,脂质启动(START)域蛋白中的功能缺失型的多态性与原始位点的气候因素有关,表明其可能进行了干旱适应。总体而言,利用脱落酸(ABA)积累作为结合全基因组关联分析(GWAS)反向遗传策略的基础,揭示了低水量下诱导的脱落酸(ABA)积累的广义自然变异,同时成功地验证了影响脱落酸(ABA)水平的基因,并且这也可能在上游干旱相关感应和信号传递机制中起作用。脱落酸(ABA)效应位点仅当在每个效应位点发生增量效应时才会被鉴定出来,并且这与脱落酸(ABA)在各分支代谢或是由具有部分多余功能基因介导作用下的累积分布是相一致的。

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    • 编译者:刘小燕
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    • 来源专题:转基因生物新品种培育
    • 编译者:zhangyi8606
    • 发布时间:2018-11-30
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