《SARS-CoV-2与人和蝙蝠冠状病毒暗蛋白质组的比较分析》

  • 来源专题:生物安全知识资源中心 | 领域情报网
  • 编译者: hujm
  • 发布时间:2020-03-22
  • 3月14日,bioRxiv预印本发表了来自印度理工学院曼迪校区研究团队的题为“Dark proteome of Newly Emerged SARS-CoV-2 in Comparison with Human and Bat Coronaviruses”的文章。
    新型冠状病毒SARS-CoV-2(COVID-19)正在全球迅速传播。与已发表的SARS-CoV-2相关的多序列比对数据表明,它与蝙蝠SARS样病毒(Bat-CoV-SARS-like)和已充分研究的人类SARS病毒密切相关。文章中,作者利用互补的方法,以蝙蝠SARS样病毒和人类SARS病毒为对照模型,研究了SARS-CoV-2蛋白质组的内在无序序列区域。文章称,研究发现,SARS-CoV-2蛋白质组除了核衣壳蛋白、Nsp8和ORF6外,还含有大量的有序蛋白序列;此外,发现病毒1ab复制酶多聚蛋白的裂解位点高度无序。文章指出,对SARS-CoV-2中的暗蛋白质组(Dark proteome)进行的广泛研究,将对SARS或类SARS病毒的结构和非结构生物学研究有一定的意义。

  • 原文来源:https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.03.13.990598v1
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    • 信息名称:SARS-CoV-2与人和蝙蝠冠状病毒暗蛋白质组的比较分析 1.时间:2020年3月14日 2.机构或团队:印度理工学院曼迪校区 3.事件概要: 3月14日,bioRxiv预印本发表了来自印度理工学院曼迪校区研究团队的题为“Dark proteome of Newly Emerged SARS-CoV-2 in Comparison with Human and Bat Coronaviruses”的文章。 新型冠状病毒SARS-CoV-2(COVID-19)正在全球迅速传播。与已发表的SARS-CoV-2相关的多序列比对数据表明,它与蝙蝠SARS样病毒(Bat-CoV-SARS-like)和已充分研究的人类SARS病毒密切相关。文章中,作者利用互补的方法,以蝙蝠SARS样病毒和人类SARS病毒为对照模型,研究了SARS-CoV-2蛋白质组的内在无序序列区域。文章称,研究发现,SARS-CoV-2蛋白质组除了核衣壳蛋白、Nsp8和ORF6外,还含有大量的有序蛋白序列;此外,发现病毒1ab复制酶多聚蛋白的裂解位点高度无序。文章指出,对SARS-CoV-2中的暗蛋白质组(Dark proteome)进行的广泛研究,将对SARS或类SARS病毒的结构和非结构生物学研究有一定的意义。 *注,本文为预印本论文手稿,是未经同行评审的初步报告,其观点仅供科研同行交流,并不是结论性内容,请使用者谨慎使用. 4.附件: 原文链接 https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.03.13.990598v1
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    • 2月4日_2019-nCoV冠状病毒的系统生物学分析发现2019-nCoV与蝙蝠冠状病毒的蛋白质序列同一性为91.1% 1.时间:2020年2月4日 2.机构或团队:博洛尼亚大学 3.事件概要: 意大利博洛尼亚大学的研究人员在bioRxiv预印版平台发表论文“Phylogenomic analysis of the 2019-nCoV coronavirus”,该研究对2019-nCoV冠状病毒进行了系统生物学分析。 文章指出,最近出现的新型冠状病毒(2019-nCoV)引起了全球关注。为了了解这种病毒的进化起源和分子特征,全球科学界在最近几周内发布了完整的基因组序列。利用当前可用的所有基因组信息,科研人员构建了系统发育树,其中包括其他冠状病毒科的代表,例如蝙蝠冠状病毒(BCoV)和SARS,其鉴定了特定的BCoV基因组,这些基因组似乎相对于新病毒最接近,蛋白质序列同一性为91.1%,为2019-nCoV的人畜共患病起源提供了进一步的证据。尽管基因组中有一些高变区,但还检测到了2019-nCoV标本中可用的保守区域。此外,科研人员还与其他冠状病毒科进行了完整的蛋白质组学比较,确定了关键的氨基酸差异以建立抗病毒策略的模型。 *注,本文为预印本论文手稿,是未经同行评审的初步报告,其观点仅供科研同行交流,并不是结论性内容,请使用者谨慎使用。 4.附件: 原文链接: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.02.02.931162v1