《长读长测序成功揭示罕见病的遗传原因》

  • 来源专题:新药创制
  • 编译者: 杜慧
  • 发布时间:2025-01-21
  • 根据《美国人类遗传学杂志》2025年发表的一项研究,Christian Gilissen、Lisenka Vissers及其同事发现了一种基于长读段(long reads)的新基因测序技术,该技术在检测复杂罕见病原因方面更加有效。传统的短读段(short reads)测序方法将DNA切割成约300个碱基长度的小片段进行分析,虽然这种方法已经帮助确定了许多罕见病的遗传原因,但它在重组非常长的重复DNA序列或处理被删除、插入或重排的DNA片段时存在局限性。

    相比之下,长读段技术,例如PacBio HiFi测序,能够读取长达20,000个碱基的DNA片段,这不仅提高了准确性,还降低了成本。研究人员对100个使用短读段和多种补充测试难以识别遗传原因的样本进行了重新分析,仅使用长读段技术就立即确认了83%的原因,并且进一步检查后又发现了额外10%的原因。对于剩下的7%,可能需要更先进的技术改进来识别。因此,对于这些挑战性的病例,长读段技术现在可以捕捉到93%的原因,而这些原因用当前的短读段技术很难或无法检测到。

    此外,长读段技术还有一个优势,它可以直接绘制甲基化图谱,这是一种通过化学变化来开启或关闭基因的过程,而短读段则需要额外的测试来完成这一过程。研究中包括了一个复杂的例子,展示了长读段技术如何立即识别出由于母亲提供的两个基因都是非活性而导致的罕见疾病。

  • 原文来源:https://medicalxpress.com/news/2025-01-sequencing-successfully-uncovers-genetic-rare.html
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