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《9月8日_快速开发和验证SARS-CoV-2临床自动诊断》

  • 来源专题：COVID-19科研动态监测
  • 编译者： zhangmin
  • 发布时间：2020-09-16

  • 英国帝国理工学院等机构的研究人员9月8日在Nature Communications期刊在线发表题为“A role for Biofoundries in rapid development and validation of automated SARS-CoV-2 clinical diagnostics”的文章。
    文章指出，对SARS-CoV-2患者和社区样本检测的需求迅速上升，使得全球的检测能力不堪重负。由于大多数诊断基础设施依赖于专用仪器，因此专用试剂供应很快成为瓶颈，迫切需要采取措施提高检测能力。为了应对这一挑战，研究人员开发了一个与试剂无关的自动化SARS-CoV-2测试平台，该平台可以快速部署和扩展。研究人员设计并表征了MS2病毒样颗粒作为模拟SARS-CoV-2的标准品。研究人员验证了RNA提取和RT-qPCR工作流程以及基于CRISPR-Cas13a和RT环介导等温扩增（RT-LAMP）的检测方法。在与NHS（英国国家医疗服务体系）的诊断检测实验室的合作中，研究人员报告了使用RT-qPCR、CRISPR-Cas13a和RT-LAMP在患者样本中检测SARS-CoV-2的整个工作流程的性能。NHS诊断实验室已安装和验证有效的RNA提取和RT-qPCR平台，每天可增加1000个样本的检测能力。
    原文链接：https://www.nature.com/articles/s41467-020-18130-3

  • 原文来源：https://www.nature.com/articles/s41467-020-18130-3
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    • 1.时间：2020年2月25日 2.团队或机构：首都医科大学附属北京朝阳医院、乔治敦大学医学中心 3.事件概要： 2月25日，Journal of Medical Virology 出版了首都医科大学附属北京朝阳医院和乔治敦大学医学中心的评论文章“Combination of RT‐qPCR Testing and Clinical Features For Diagnosis of COVID‐19 facilitates management of SARS‐CoV‐2 Outbreak”，讨论了关于COVID-19的诊断手段。 研究人员指出，急需快速优化检测试剂盒和标准操作程序的质量，以最好地检测SARS-CoV-2感染。基于SARS-CoV-2序列分析以及ACE2作为病毒受体，研究人员紧急建议从患者下呼吸道（包括痰液和支气管肺泡灌洗液）采集的样品用于检测病毒感染，尽管鼻咽拭子更常用更方便。应该考虑进一步降低高假阳性率的其他因素或方法包括样品试剂（例如，已证明TRIZOL具有RNA样品的稳定性并且可以灭活病毒）、样品运输条件和实验室操作标准。开发基于血清的测试方法，例如从患者血清中检测SARS-CoV-2特异性IgM。 随着人们对SARS-CoV-2和COVID-19的更多了解，开始认识到仅基于病毒核酸检测的诊断不足，将RT-qPCT或下一代测序检测与临床标准相结合的诊断可能更加重要。作者认为中国政府对所有诊断为COVID-19的患者启动了一项紧急政策，COVID-19的所有治疗都无需花费任何费用。这一变化将大大促进SARS-CoV-2暴发的充分管理，尤其是提高患者对检疫和治疗的依从性。 4.附件： 原文链接：https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1002/jmv.25721
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    • 发布时间：2020-02-29
    • 福建省立医院于2020年2月25日在medRxiv上发表题为“Epidemiological and clinical characteristics of SARS-CoV-2 and SARS-CoV: a system review”的文章。 研究人员通过搜索pubmed，分析和比较了疫情爆发初期不同国家SARS和COVID-19的典型病例。回顾性分析这些病例的临床记录、实验室检查结果、影像学诊断和病理状况。结果显示，有6篇SARS相关文章（N=337名参与者）和12篇COVID-19相关文章（N=50,096名参与者）符合此系统分析的条件。发热、咳嗽和不适/疲劳是SARS和COVID-19中最常见的症状。但总体而言，COVID-19的临床症状和特征并不明显。与SARS相比，COVID-19的传播方式更加多样，人传人、无症状感染者以及可能的粪口传播都为其大规模传播创造了条件。 SARS和COVID-19的死亡率分别为7.7%和2.2%，但医护人员COVID-19的总体感染率（3.9%）低于SARS（40.0%）。研究人员还总结了有关COVID-19病理的最新报道，发现COVID-19的病理特征与SARS非常相似，后者表现为急性呼吸窘迫综合征（ARDS）。研究人员指出，中国SARS和COVID-19的流行病学和临床特征非常相似，但也有差异。COVID-19的传播途径更加多样且更具传染性，因此医护人员和患者对疾病的早期识别非常重要。必须采取积极有效的隔离措施，以应对疑似病例和近距离接触者。
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