《确定了导致SARS-CoV-2感染的人类基因――CIART - 生物通》

  • 来源专题:新发突发疾病(新型冠状病毒感染)
  • 编译者: 张玢
  • 发布时间:2023-03-20
  •    根据威尔康奈尔医学院和纽约大学格罗斯曼学院研究人员的一项研究,一种名为CIART的基因的活性是引发COVID-19病毒感染的关键因素。
     一个识别SARS-CoV-2感染相关基因的多器官类平台。根据威尔康奈尔医学院和纽约大学格罗斯曼医学院研究人员的一项研究,一种名为CIART的基因的活性是引发COVID-19病毒感染的关键因素。
    在3月13日发表在《 Nature Cell Biology 》杂志上的这项研究中,研究人员使用了多个被称为类器官的人体组织小三维团块模型,来寻找影响SARS-CoV-2感染的一般宿主因素,SARS-CoV-2是导致COVID-19的冠状病毒。
    他们在肺和心脏组织建模的类器官中发现CIART是一种强的SARS-CoV-使能因子。研究人员将CIART对SARS-CoV-2感染的允许作用追溯到它刺激被称为脂肪酸的小分子的合成。
    该研究的共同通讯作者Shuibing Chen教授说:“这一发现揭示了多器官类方法的力量,揭示了一种未来药物可以靶向治疗或预防跨多器官系统的SARS-CoV-2感染的途径。”
    与其他呼吸道病毒一样,SARS-CoV-2通常在喉咙和鼻窦引发感染。但它经常从呼吸道扩散到身体的其他部位,如肠道、肝脏、心脏、肾脏、大脑、血管和胰腺。这些组织感染常见于重症COVID-19,可导致致命并发症,包括血凝块和器官衰竭。
    不同的器官对SARS-CoV-2感染的反应往往不同。在这项研究中,科学家门想寻找多个器官相关的因素。研究人员从人类干细胞开始,培养出类器官来模拟支气管气道组织、肺深处的气体交换“肺泡”组织和心肌,这些组织都可以被SARS-CoV-2感染。在纽约大学格罗斯曼分校的一个高级生物安全设施中,研究人员将这些类器官暴露于不同数量的病毒中,并确定了18个基因,这些基因在感染期间,在多个类器官和不同的病毒剂量下变得更加活跃。
    科学家们一个接一个地从类器官中删除了这些基因,以观察它们对病毒水平的影响。结果表明,虽然其中13个基因似乎在使SARS-CoV-2成为可能方面发挥了一定作用,因此当它们不存在时,病毒水平会降低,但迄今为止最强的使能者是CIART。后者编码一种转录因子蛋白,这种蛋白通常在细胞核中工作,以调节其他基因的活性。它以前从未与疾病联系在一起。
    进一步的测试表明,CIART基因通常通过一种被称为RXR途径的途径,通过促进某些脂肪酸的产生来增强SARS-CoV-2的繁殖能力。在接触SARS-CoV-2之前,用实验性RXR抑制剂化合物处理类器官,有效地阻止了病毒在组织中建立感染的能力。研究结果表明,靶向RXR或其上游控制器CIART蛋白可能是治疗SARS-CoV-2感染的有效方法,甚至可以在短期内预防它。
    研究人员说,这种方法的一个巨大优势是它改变了病毒-宿主相互作用的宿主方面。“大多数针对SARS-CoV-2的抗病毒方法都集中在针对病毒本身的某些成分,但病毒通常可以围绕这些成分快速进化。病毒要适应宿主端的变化要困难得多。”
    研究人员现在正在继续研究CIART如何影响病毒的生命周期,以及如何最好地阻止其增强感染的效果。

  • 原文来源:http://www.ebiotrade.com/newsf/2023-3/20230317065423945.htm
相关报告
  • 《EMBO J:生物标志物帮助预测 SARS-CoV-2感染》

    • 来源专题:生物安全知识资源中心 | 领域情报网
    • 编译者:hujm
    • 发布时间:2020-12-21
    • 在最近一项研究中,科学家们发现了血液中的特殊分子标记物,这些分子标记物可预测SARS-CoV-2冠状病毒感染是否会导致的严重结果。该研究结果扩展了对COVID-19的病理生理学和临床进展的了解,并有潜力在感染过程的早期识别出哪些个体最有可能出现严重疾病并需要住院治疗。 除肺炎和败血综合症外,一小部分患者在SARS-COV-2感染后还出现了严重的胃肠道和/或心血管症状以及神经系统症状。 这项研究采用了多组学方法,整合了来自不同组学学科的数据,包括前沿的转录组学,蛋白质组学和代谢组学技术,以鉴定COVID-19患者(尤其是重症患者)的显著相关分子改变。这项工作评估了三组中83名患者的数据,其中16名严重病例,50名轻度病例和17名无病毒的健康对照组。 从所有参与者收集连续的血液和咽拭子样本,并确定COVID-19病理生理是否与特定的分子变化有关,共有23,373个表达基因,9,439个蛋白质,327个代谢物和769个胞外RNA分子片段。 在轻度和重度病例之间,各种免疫标记物(例如1型干扰素和炎性细胞因子)之间存在显著差异,后者在后者中升高,而前者显示出强大的T细胞反应,可能有助于阻止疾病进展。 此外,多组学数据与经典诊断性血液或生化参数之间存在显著相关性。这尤其体现在蛋白质组学分析中,与健康对照组相比,在轻度和重度患者中,三羧酸循环(TCA)和糖酵解途径显著下调。相反,在患有COVID-19的患者中,宿主防御途径(例如T细胞受体信号传导途径)表达活性升高。 对于将来的临床应用而言,另一个潜在的有价值的发现是严重COVID-19患者的病毒载量与疾病预后之间存在关联。不幸的是,有6名严重症状的患者死亡,他们入院之前在喉咙中采样获得的SARS-CoV-2 RNA负荷明显高于幸存者。在此值得注意的发现是,在幸存的严重患者中,参与抗病毒过程的蛋白质(包括T细胞和B细胞受体信号传导途径)与病毒载量变化呈正相关。
  • 《Stem Cell Reports人类肺和脑类器官对SARS-CoV-2感染的不同反应》

    • 来源专题:中国科学院病毒学领域知识资源中心
    • 编译者:malili
    • 发布时间:2021-03-01
    • COVID-19是由大流行的SARS-CoV-2冠状病毒引起的疾病,主要被认为是呼吸道感染。然而,这种病毒也因其对身体其他部位的影响而闻名,其影响方式还不为人所知,有时会产生长期的后果,如心律失常,疲劳和“脑雾”。 加州大学圣地亚哥医学院的研究人员正在利用干细胞衍生的类器官——人体细胞的小球,在实验室培养皿中看起来和起作用都像微型器官——来研究病毒如何与各种器官系统相互作用,并开发阻断感染的疗法。 “我们正在研究发现SARS-CoV-2不会以同样的方式感染整个身体,”加州大学圣地亚哥医学院和摩尔癌症中心儿科教授兼遗传科主任塔里克·拉纳博士说在不同的细胞类型中,病毒触发了不同基因的表达,我们看到了不同的结果。” 拉纳的研究小组于2021年2月11日在《干细胞报告》中发表了他们的发现,与许多器官一样,研究小组的肺和脑类器官产生了分子ACE2和TMPRSS2,它们像门把手一样位于外表面细胞数量。SARS-CoV-2通过其刺突蛋白抓住这些门把手,作为进入细胞和建立感染的手段。 Rana和他的团队开发了一种假病毒——一种非传染性的SARS-CoV-2——并用绿色荧光蛋白(GFP)标记它,一种从水母中提取的明亮分子,有助于研究人员观察细胞的内部运作。荧光标记使他们能够量化病毒的刺突蛋白与人类肺和脑类器官中ACE2受体的结合,并评估细胞的反应。 研究小组惊讶地发现,ACE2和TMPRSS2受体增加了约10倍,相应地,肺类器官中的病毒感染也增加了很多,与大脑类器官相比。用病毒刺突蛋白或TMPRSS2抑制剂治疗可降低两类器官的感染水平。 “我们在脑类器官中看到了荧光点,但真正发光的是肺类器官,”Rana说。 除了感染水平不同外,肺和脑类器官对病毒的反应也不同。SARS-CoV-2感染的肺部类器官泵出的分子旨在寻求免疫系统的帮助——干扰素、细胞因子和趋化因子。另一方面,受感染的大脑类器官增加了其他分子的产生,如TLR3,TLR3是toll样受体家族的一员,在病原体识别和激活先天免疫中起着重要作用,虽然一开始似乎大脑类器官反应只是免疫反应的另一种形式,但这些分子也可以帮助细胞程序性死亡。Rana的研究小组此前也发现了类似的脑细胞对寨卡病毒的反应,寨卡病毒是一种已知的阻碍新生儿大脑发育的病毒感染。 “我们观察到的脑细胞对病毒的反应方式可能有助于解释COVID-19患者所报告的一些神经效应,”Rana说。 当然,类器官并不是人体器官的精确复制品。例如,它们缺乏血管和免疫细胞。但它们为研究疾病和测试潜在疗法提供了重要工具。根据Rana的说法,类器官比细胞系或动物模型更能准确地模拟现实世界中的人类状况,这些细胞系或动物模型被设计成过度表达人类ACE2和TMPRSS2。 “在过度表达ACE2受体的动物身上,你会看到所有的东西都因感染而发光,甚至是大脑,所以每个人都认为这是真实的情况,”Rana说。“但我们发现情况可能并非如此。” 除了他们对假病毒的研究外,研究小组还通过在生物安全3级实验室(一个专门设计和认证用于安全研究高风险微生物的设施)将活的传染性SARS-CoV-2应用于肺和脑类器官,验证了他们的发现。 现在,Rana及其合作者正在开发SARS-CoV-2抑制剂,并测试它们在来自不同种族和种族背景的人的类器官模型中的工作情况,这些人代表了加州不同的人群。他们最近获得了加州再生医学研究所(California Institute for Regenerative Medicine)的新资助,以支持这项研究。 这项研究的共同作者包括:Shashi Kant Tiwari、Shaobo Wang、Davey Smith和Aaron Carlin,所有这些都在加州大学圣地亚哥分校进行。 披露:塔里克·拉纳是ViRx制药公司的创始人,拥有该公司的股权。加州大学圣地亚哥分校已根据其利益冲突政策审查并批准了该协议的条款。 Journal Reference: Shashi Kant Tiwari, Shaobo Wang, Davey Smith, Aaron F. Carlin, Tariq M. Rana. Revealing tissue-specific SARS-CoV-2 infection and host responses using human stem cell-derived lung and cerebral organoids. Stem Cell Reports, 2021; DOI: 10.1016/j.stemcr.2021.02.005