2023年12月5日,加州大学圣地亚哥分校等机构的研究人员在Nature发表题为Reverse metabolomics for the discovery of chemical structures from humans的文章。
确定在非靶向代谢组学实验中检测到的分子的结构和表型背景仍然具有挑战性。该研究将反向代谢组学作为一种发现策略,其中从新合成的化合物中获取MS/MS谱,并在公共代谢组学数据中进行搜索以发现表型关联。为了证明该概念,研究人员广泛地合成并探索了人类中的多种代谢物-N-酰基酰胺,羟基脂肪酸的脂肪酸酯,胆汁酸酯和共轭胆汁酸。
使用库规模分析,研究人员发现一些结合胆汁酸与炎症性肠病 (IBD) 有关。使用四个不同的人IBD队列进行验证,研究人员发现在克罗恩病中Glu、Ile/Leu、Phe、Thr、Trp和Tyr缀合的胆酸升高。这些化合物和相关结构中的几种已显示出影响与炎症性肠病相关的途径,例如CD4 T细胞和PXR激动剂中的干扰素-γ 产生。属于双歧杆菌,梭菌属和肠球菌属的细菌能够在培养时产生这些胆汁酰胺化物。因为用MS/MS谱搜索储存库最近才成为可能,所以现在可以采用反向代谢组学方法作为从人类和动物生态系统中发现其他分子的一般策略。