《Science | 利用语言模型模拟5亿年的进化》

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  • 编译者: 朱晓琳
  • 发布时间:2025-02-25
  •   2025年2月21日,Evolutionary Scale PBC的Alexander Rives等研究人员在《Science》发表论文“Simulating 500 million years of evolution with a language model”,研究提出了前沿多模态生成语言模型ESM3,可以对蛋白质的序列、结构和功能进行推理。研究促使了ESM3生成荧光蛋白,在合成的世代中发现了一种与已知荧光蛋白相距很远的明亮荧光蛋白,估计这相当于模拟 5 亿年的进化。

      这篇文章入选《Science》第387卷第6732期封面文章,封面插图描述了用户在连接到代表语言模型的机器的控制台上排队输入提示。三个大漏斗代表来自蛋白质序列、结构和功能注释的公共数据库的输入。


  • 原文来源:https://www.science.org/doi/10.1126/science.ads0018
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    • 2月18日_武汉市COVID-19疫情干预措施效果的模型模拟研究 1.时间:2020年2月18日 2.机构或团队:北京大学第一医院 3. 事件概要: 2月18日,medRxiv预印平台发表了北京大学第一医院的论文“A model simulation study on effects of intervention measures in Wuhan COVID-19 epidemic”,对武汉市COVID-19疫情干预措施效果进行了模型模拟研究,旨在帮助人们了解传染病如何传播以及基于模拟模型分析下这些努力将产生目的和效果。 利用已知参数建立了模型。R0设置为3,平均潜伏时间为7.5天。根据媒体报道和武汉市政府的公告,2019-nCOV疫情可分为3个时期。第一个时期:自由传染期(1天-50天);第二个时期:封锁城市期(51天-70天);第三个时期:加强控制期(71天-90天),模型运行50次以模拟不同的病人状态。个人活动指数用来模拟不同水平的控制措施。创建了141427709个模拟患者。第1期(第50天)末累计患者数为2868.7±1739.0,在第2期(第70天)末,自由传播状态下感染总人数估计为913396.5±559099.9。第90天,总病例数为913396.5±559099.9。 研究人员表示,COVID -19是一种新型的严重呼吸道疾病,给医疗工作者以及医疗硬件和医疗补给带来沉重的负担。目前严格的控制措施有助于控制疾病的传播。而长期效果则关系到武汉能否很好地完成这一任务。社会仍需要建立早期检测、报告和快速反应系统,以预防未来未知的传染病。 *注,本文为预印本论文手稿,是未经同行评审的初步报告,其观点仅供科研同行交流,并不是结论性内容,请使用者谨慎使用。 4.附件: 原文链接:https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.02.14.20023168v1
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