牧区水利科学研究所原直属水利部。于1979年3月经国务院批准成立。牧区水利科学研究所的专业研究领域目前主要涉及牧区水利基础理论和技术研究.牧区水利技术的应用与示范研究.牧区水利产业化与以水为中心的畜牧业经济研究.牧区水利科技管理、产业化经济管理.以及政策、法规等软科学研究。重点研究领域有:水资源评价与开发,水环境评价与水质改良.草原灌溉与排水,牧场供水与牧区水利装备技术.草场建设与管理,清洁能源(太阳能、风能等)开发与利用.水土保持与荒漠化治理,水利经济与灾害评价,牧区水利技术政策与宏观战略等10多个学科领域。