《11月20日_简化的SARS-CoV-2失活、扩增和基于Cas-13的检测》

  • 来源专题:COVID-19科研动态监测
  • 编译者: zhangmin
  • 发布时间:2020-12-21
  • 麻省理工学院和哈佛大学等机构的研究人员11月20日在期刊Nature Communications上在线发表了题为“Streamlined inactivation, amplification, and Cas13-based detection of SARS-CoV-2”的文章。
    文章称,新的诊断技术对于控制COVID-19传播至关重要,研究人员开发了一种灵敏而特异的诊断工具SHINE,可以检测未提取样品中的SARS-CoV-2的RNA。研究人员确定了检测的最佳条件,仅需一个步骤就可以同时实现基于RPA的扩增和基于Cas13的检测,简化了实验准备流程并减少了运行时间。研究人员改进了HUDSON,以在10分钟内快速灭活鼻咽拭子和唾液中的病毒。SHINE可通过管内荧光反应实现结果可视化,其扩增反应管保持密封状态,降低了污染风险。使用者可以通过智能手机应用程序查看分析的结果。研究人员对比了50个鼻咽样本的RT-qPCR检测结果和SHINE检测结果,结果显示SHINE具有90%的灵敏度和100%的特异性。SHINE有潜力在医院和临床实验室之外使用,可大大提高了SARS-CoV-2诊断能力。
    原文链接:https://www.nature.com/articles/s41467-020-19097-x

  • 原文来源:https://www.nature.com/articles/s41467-020-19097-x
相关报告
  • 《8月26日_基于Cas13的SARS-CoV-2 检测方法的临床验证》

    • 来源专题:COVID-19科研动态监测
    • 编译者:zhangmin
    • 发布时间:2020-09-02
    • Nature Biomedical Engineering于8月26日出版了泰国Vidyasirimedhi科学技术研究所(VISTEC)以及张锋团队参与的研究文章“Clinical validation of a Cas13-based assay for the detection of SARS-CoV-2 RNA”。文章指出,通过等温扩增以及CRISPR相关酶对报告分子的裂解的核酸检测是定量PCR的一种有前途的替代方法。该文章中,研究人员报告了使用Leptotrichia wadei的Cas13a酶的特定高灵敏度酶报告基因解锁(SHERLOCK)分析对从泰国Siriraj医院收集的154份鼻咽和咽拭子样本进行SARS-CoV-2检测。在每个反应42个RNA拷贝的检测限内,SHERLOCK的荧光读数为100%特异性和100%灵敏性,而横向流读数为100%特异性和97%灵敏性。在临床样品中病毒载量的全部范围内,荧光读数为100%特异性和96%灵敏性。对于来自手术患者的380份SARS-CoV-2阴性术前样品,SHERLOCK与反转录定量PCR的一致性为100%。研究表示,该检测方法适合于在单个横向流动带中进行多重检测,并结合了核糖核酸酶污染的内参对照,该方法应有助于在资源有限的情况下进行SARS-CoV-2检测。 原文链接:https://www.nature.com/articles/s41551-020-00603-x
  • 《5月22日_德国团队在母乳检测到SARS-CoV-2》

    • 来源专题:COVID-19科研动态监测
    • 编译者:zhangmin
    • 发布时间:2020-05-23
    • 1.时间:2020年5月22日 2.机构或团队:德国乌尔姆大学医学院、德国海登海姆县公共卫生办公室 3.时间概要: 《柳叶刀》于5月22日发表了德国乌尔姆大学医学院等机构的通讯文章“Detection of SARS-CoV-2 in human breastmilk”。 文章指出,尚不清楚SARS-CoV-2是否可以扩散入母乳中并通过母乳喂养传染给孩子。最近的调查未发现人类母乳中出现SARS-CoV-2的证据,但样本量很小。本文中,研究人员检查了两名感染SARS-CoV-2,处于哺乳期的女性的母乳。 结果发现,入院和分娩后(第0天),母亲1的四个样本呈阴性。相比之下,在第10天(左右乳房)、第12天和第13天,来自母亲2的母乳中检测到SARS-CoV-2 RNA,随后采集的样品为阴性。研究数据还表明母亲2的全脂母乳中的实际病毒载量甚至可能比检测到的还要高。母亲2的母乳中病毒RNA的检测与新生儿(新生儿2)的轻度COVID-19症状和SARS-CoV-2阳性诊断测试相吻合。自症状发作以来,母亲2一直戴口罩,并在处理或喂养新生儿时遵循安全预防措施(包括适当的手和乳房消毒,严格的清洗以及对吸奶泵和管道的消毒)。但是,尚不清楚新生儿2是否是通过母乳喂养还是其他传播方式感染。需要对哺乳期女性的母乳样本以及可能通过母乳喂养传播病毒进行进一步研究,以得出关于患有COVID-19的母亲是否应该母乳喂养的建议。 4.附件: 原文链接:https://www.thelancet.com/journals/lancet/article/PIIS0140-6736(20)31181-8/fulltext