2023年4月，PLOS推出了新的开放科学指标（Open Science Indicators，OSIs），这是一个大型的公共数据集，主要用于识别和量化PLOS文章中的预印本发布、数据共享和代码共享等开放科学实践。根据最新发布的2022年下半年数据，可见2019-2022年，这三个领域都在逐步增长。有关该项目的更多详细信息如下。
1 开放科学指标的原因和方式
PLOS的创始使命是打破出版、阅读和重用可信的学术研究的障碍，总体目标是加速整个科学和医学的进步。我们通过让全世界所有学科的所有研究人员更容易获得开放存取的出版资源和开放科学的最佳实践来实现这一目标。
在这项工作中，我们并不孤单：在整个学术生态系统中，研究人员、资助者、机构、图书馆员、专业组织和其他开放存取出版商都在拥抱开放实践，支持公平和包容、研究完整性和可重复性，以及跨地域和跨学科的合作。但是要了解我们是否在提高采用率方面取得了进展，首先必须了解研究人员目前的情况。开放科学指标使我们能够建立基准，并跟踪一段时间内的变化。
在制定一套开放科学实践的原则和定义之后，PLOS与DataSeer合作创建了“指标”，用于识别和衡量已发表的研究文章中特定的开放科学实践。2022年12月，我们推出了首批三个指标：数据共享、代码共享和预印本发布。我们目前正在为协议共享制定第四个指标。在未来，我们的目标是继续完善我们的方法并扩展数据集。我们感谢您的意见和反馈，包括最新的数据，您是如何使用它的，以及您认为在未来最有价值的数据点和功能。
2 近距离观察最新的开放科学指标
（1）关于数据集
2023年3月的数据集包括2019年1月至2022年12月这4年间发表的71,109篇PLOS研究文章，以及来自PubMed Central的7,635篇可公开获取的研究文章，比之前的数据集增加了16%。
有几点需要注意的是：开放科学指标只报告机器可检测到的特征。不清晰的标签或缺失的元数据可能意味着一些实践在数据集中代表性不足。在第二版中，对数据集的准确率进行了更新和扩展，为高级用户提供了更细致入微的数据集视图。
（2）到2022年底的更新
截至2022年底，开放科学指标的结果继续遵循既定模式，特别是针对PLOS文章，如图1所示。
数据存储库使用率持续上升，从2021年的26%上升到2022年的28%。总体数据共享率也上升至75%。
与2021年相比，2022年的代码共享率略有上升，2022年发表的所有文章的代码共享率达到15%。
与已发表文章相关的预印本发布率在2021年和2022年期间稳定在24%。
3 近距离观察预印本发布情况
为了补充第一次发布的数据和代码共享结果，在此对预印本的发布进行更深入研究。
虽然在2021年和2022年，带有相关预印本的已发表文章的比例保持不变，但如果我们根据预印本发布日期而不是相关文章发布日期来观察预印本发布情况，就会发现一个不同的模式。就PLOS文章而言，2020年第二季度发布的预印本比上一季度增加了57%，部分原因可能是为了应对Sars-CoV-2大流行。自从那时起，增长率逐渐恢复正常，直到2021年第四季度，略高于大流行前的水平，与前几年观察到的逐渐上升的趋势一致。对比数据显示，大流行的增长幅度不太明显，整个2021年的水平仍然比较稳定（尽管这是一个比较小的样本量）。数据集的未来迭代将更清楚地说明预印本的持续趋势。如图2所示。
开放科学指标数据集的一个好处是，它提供了一个比以往PLOS更全面的预印本发布视图。在PLOS和比较机构中，最受欢迎的预印本平台是社区/学科特定平台bioRxiv和medRxiv（见表1和表2）。PLOS和比较机构之间平台使用的差异可能与不同的出版商最紧密合作的预印本平台有关。
预印的流行程度也因地区而异。如图3所示，从广泛的地理区域来看，美洲的预印本发布率最高（27%）。非洲（不包括北非）、欧洲和大洋洲的预印本发布率都差不多（21%-23%），而亚洲和北非/中东（MENA）的预印本发布率较低，分别为15%和17%。到目前为止，我们还没有试图解释为什么各地区在预印本发布方面存在这些差异，但欢迎提出意见。这些最新的 “开放科学指标 ”结果可以为其他已经开始在科学出版的公平性方面研究区域预印本采用率的工作提供参考。
4 使用开放科学指标
有很多方法可以查看和分析开放科学指标：仔细观察数据，确定最流行的数据和代码库，寻找研究人员如何使用资源库与支持信息文件来分享数据的模式，或者交叉参考以调查学科或区域规范的差异。伦敦帝国理工学院的罗宾·普莱斯(Robyn Price)在The Bibliomagician上撰文，探讨了机构如何使用指标来更好地了解研究人员的出版模式，同时对特定机构的数据进行更深入的研究。
