《中国科学院海洋研究所在模式海洋贝类创建研究中取得重要进展》

  • 来源专题:中国科学院文献情报系统—海洋科技情报网
  • 编译者: liguiju
  • 发布时间:2023-10-12
  • 贝类(Mollusca)是种类最多的海洋动物类群。从系统演化的角度,其属于冠轮动物(Spiralia),与蜕皮动物(Ecdysozoa)及后口动物(Deuterostomia)共同构成现生主要动物(即两侧对称动物,Bilateria)的三大分支。贝类发育过程中经历独特的担轮幼虫阶段,蕴含着独特的发育机制及演化历史,对于理解发育演化及两侧对称动物起源有重大意义。与此同时,作为重要的水产类群,解析贝类早期发育机制对于新种质创制具有重要支撑作用。

    模式生物是生物学研究的关键工具,对模式生物的研究可以揭示某些类群生物的共有规律,对于整个研究领域具有显著的支撑和推进作用。目前广泛使用的模式生物如果蝇、线虫、海鞘、小鼠等,均属于蜕皮动物或后口动物,而冠轮动物研究则长期缺乏模式生物。2000年以后,冠轮动物的研究蓬勃开展,涌现了多种可能成为模式贝类的潜力物种,如腹足类的Ilyanassa obsoleta, Lymnaea stagnalis, Crepidula fornicata以及双壳类的侏儒蛤(Mulinia lateralis)等,针对其研究发现了贝类发育中的诸多独特规律。

    美中不足的是,已有的几个潜在模式腹足类在演化过程中均出现了特化,发育过程不经历担轮幼虫阶段,缺失了早期发育中的关键一环。而隶属于笠形腹足亚纲(Patellogastropoda)的笠贝类则不存在这个问题,经历典型的担轮幼虫阶段,是研究担轮幼虫模式建成的理想材料。然而,研究基础较好的笠贝类动物如Patella vulgata等只分布在欧美海域,在东亚无分布,限制了其在全球范围内开展广泛研究的可能。而且随着研究人员的更迭,近年来笠贝类研究也逐渐萎缩。开发一个天然分布于东亚海域的笠贝类模式物种,可以凸显笠贝在贝类早期发育方面的独特材料优势,揭示贝类发育关键机制。

    中国科学院海洋研究所刘保忠团队聚焦贝类早期发育研究,针对这一重要科学问题开展了系统研究和持续攻关。自2016年起,团队采集并测试了青岛海域的多个本地物种,最终选定了北戴河笠贝(Lottia peitaihoensis)为研究对象。基于团队已有研究基础,在该物种中先后建立了细胞谱系分析、显微注射、基因敲降、转基因、基因编辑等全套的早期发育研究技术体系。迄今为止,北戴河笠贝是世界上为数不多的成功实现了胚胎基因敲降和基因编辑的贝类,也是少数明确了早期细胞谱系的贝类。同时,团队克服诸多难题,成功建立了北戴河笠贝的实验室培育体系,实现了全周年繁育,为其发展为模式贝类奠定了坚实的材料基础。

    以上述技术平台和材料保障为基础,团队对北戴河笠贝早期发育机制开展了深入研究,取得了若干重要原创性发现,如Hox基因的背腹分离表达规律(PNAS, 2020),组织者细胞信号传递机制及背腹轴形成机制(Molecular Biology and Evolution, 2022),中胚层细胞的起源和早期分化模式(Evolutionary Applications, 2022)等,在该研究领域国内外同行中产生了重要反响。代表性研究论文受到F1000Prime推荐,部分研究结论作为贝类发育演化研究的主要代表成果写入国际无脊椎动物学教科书《Invertebrate Zoology: A Tree of Life Approach》。随着研究结论的日渐丰富和技术平台的不断完善,北戴河笠贝已经成为研究腹足贝类早期发育的理想模式物种。 

    由于团队取得的系列重要成果,刘保忠研究员受邀为发育和演化领域专门期刊Evolution & Development撰写了关于北戴河笠贝作为早期发育模式贝类的综述论文。论文由郇聘研究员和刘保忠研究员联合完成,日前已正式在线发表。

    中国科学院海洋研究所张均龙研究员和张素萍研究员在北戴河笠贝的野外采集和物种鉴定环节提供了关键支持。团队成员谭素建博士、王倩(硕士生)、杨伟红(硕士生)、崔梦露(硕士生)、孙德慧(博士生)、刘新雨(博士生)等在笠贝发育机理研究方面做出了重要贡献。

    综述链接:

    Huan, P., Liu, B. (2023). The gastropod Lottia peitaihoensis as a model to study the body patterning of trochophore larvae. Evolution & Development, 1–21. https://doi.org/10.1111/ede.12456

  • 原文来源:http://www.qdio.cas.cn/2019Ver/News/kyjz/202309/t20230925_6886103.html
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    • 近日,中国科学院海洋研究所王凡团队在Nature Communications发文揭示海洋次表层混合对中部型(CP)厄尔尼诺和南方涛动(ENSO)的非绝热正反馈机制。 ENSO是海洋-大气系统最显著的年际变化,但21世纪以来,伴随着CP?ENSO的增多,人们对ENSO的预测技巧却减弱。这表明,人们对ENSO的一些关键热动力学认知还存在不足。海洋次表层湍流混合以非绝热方式将热量从混合层底向下传递,是影响海表温度的一个重要过程。然而,由于直接观测资料匮乏,次表层混合对ENSO的影响,尤其是其对CP?ENSO和东部型(EP)ENSO多样性的作用,从未得到确认。 本研究创新性提出了一种基于Argo剖面观测数据的赤道太平洋混合层底湍流混合参数化方案,从而首次提供了大量的混合层底垂向扩散系数以及湍流热通量估算数据。据此,进一步揭示了由湍流热通量导致的非绝热效应与CP ENSO循环存在显著的正反馈关系:一方面,次表层湍流混合主导了El Ni?o和La Ni?a生长期的海面温度变化,另一方面,其强度又被El Ni?o和La Ni?a相应的风应力及次表层不稳定条件所控制。相反,由湍流热通量导致的非绝热效应不能明显促进EP ENSO的发展,也不能被EP ENSO显著决定。 本研究提出的非绝热机制是促进CP ENSO发展的一个主要机制,是对传统绝热ENSO理论的重要补充。该结果提示,为提高ENSO预报水平,次表层湍流混合必须在气候预报模式中得到准确的表征。 该成果发表在Nature Communications。第一、二作者分别为中国科学院海洋研究所刘传玉和王凡研究员(也是共同通讯作者),合作作者包括汉堡大学海洋研究所Armin K?hl博士、中国科学院海洋研究所王晓玮助理研究员、中国科学院南海海洋研究所王春在研究员,以及夏威夷大学Kelvin J. Richards教授等。该研究受到中国科学院B类先导专项、国家重点研发计划及国家自然科学基金等项目的资助。 论文信息: Liu, C., Wang, F., K?hl, A.?et al.?Subsurface ocean turbulent mixing enhances central Pacific ENSO.?Nat Commun?16, 2315 (2025). https://doi.org/10.1038/s41467-025-57058-4
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    • 编译者:liguiju
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    • 近日,中国科学院海洋研究所藻类与藻类生物技术团队在红球藻虾青素资源开发领域取得重要进展,发现无氧呼吸糖酵解(EMP)、有氧呼吸三羧酸循环(TCA)、戊糖磷酸途径(PPP)和线粒体呼吸交替氧化酶途径(AOX)等多种非光依赖型代谢途径都对红球藻虾青素的合成积累产生重要调节作用。相关理论成果以3篇研究论文在国际Top期刊生物资源工程技术类一区《Bioresource Technology》(IF=9.642)发表,衍生出的相关技术成果分别申报了4项国家发明专利,其中2项已获专利授权。 虾青素呈鲜红色,具有非常强的着色、抗氧化能力和多种生物学功能,在营养健康食品、医药保健和化妆品等领域都有广阔的应用前景。而红球藻是一种富含虾青素的单细胞绿藻,也是国际上生产天然虾青素的最好生物资源。以往认为,红球藻虾青素的生物合成过程主要受强光驱动和营养亏缺诱导,国内外研究大多侧重于光依赖型合成代谢过程(如光合作用、光保护和细胞生长等),很少关注分解消耗性的呼吸作用。即便近年来关注呼吸,也仅涉及光依赖型的光呼吸与叶绿体呼吸作用。例如刘建国研究员团队发现光呼吸对虾青素合成具重要调控作用(Algal Research,2019,41: 101520),证实叶绿体呼吸途径并非通过减少过剩激发能、降低对光合机构的直接破坏,而是通过缓解活性氧等抑制的光损伤修复、实现保护绿色游动细胞免受光损伤的(Algal Research,2021,54:102140)。至于非光依赖型呼吸代谢途径对红球藻虾青素合成积累的作用,国内外却鲜有报道。 刘建国研究团队发现并证实多种非光依赖型呼吸代谢途径可有效调控红球藻虾青素合成积累。其中,张立涛副研究员为第一作者、刘建国研究员为通讯作者的研究论文发现,线粒体呼吸的交替氧化酶途径活性与红球藻虾青素积累呈明显负相关,当交替氧化酶途径受到抑制后,与呼吸作用密切相关的中间代谢产物丙酮酸和三磷酸甘油醛含量均显著提高,同时促进能量物质NADPH的产生,并刺激了活性氧的积累,从而有利于促进虾青素合成。由此提出调节呼吸作用可促进红球藻虾青素生物合成积累的新观点。 博士研究生于文杰为第一作者,刘建国研究员为通讯作者的另外两篇文章,主要通过外源添加呼吸作用中间代谢产物的方法,进一步证实非光依赖性呼吸作用的能量代谢中心枢纽——TCA循环,可为虾青素合成过程提供碳骨架,促进虾青素在细胞内的大量积累。其调节机制具体为:中间代谢产物延胡索酸可提高呼吸代谢的EMP、TCA和PPP三条主要途径,使得丙酮酸和三磷酸甘油醛水平显著提高,一方面通过促进虾青素合成前体异戊烯焦磷酸的生成,直接促进虾青素合成,另一方面还促进了脂肪酸的合成,进而加速虾青素酯化过程,间接促进虾青素合成。TCA循环的另一代谢产物草酰乙酸可通过提高底物和NADPH水平,直接促进红球藻虾青素合成。相对而言,草酰乙酸的促进作用比延胡索酸更快,效果也更显著,主要得益于草酰乙酸更高效的跨膜机制。 上述成果完善了红球藻虾青素规模化开发的基础理论和开发技术体系,将有利于完善基于细胞周期调控和大型封闭式光生物反应器构建等技术的红球藻开发模式,使植物细胞光合工厂的运转更加高效,推动该产业开发水平再上新台阶。同时研究成果还对其它微藻类胡萝卜素等次生代谢物质的研究与资源开发都具有明显的启发和借鉴价值。 上述研究工作得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金面上基金和联合基金等项目资助。 论文链接: (1) Zhang LT, Zhang CH, Xu R, Yu WJ, Liu JG (2021) A strategy for promoting carbon flux into fatty acid and astaxanthin biosynthesis by inhibiting the alternative oxidase respiratory pathway in Haematococcus pluvialis. Bioresource Technology, 344: 126275. https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0960852421016175?via%3Dihub (2) Yu WJ, Zhang LT, Zhao J, Liu JG (2021) Exogenous sodium fumarate enhances astaxanthin accumulation in Haematococcus pluvialis by enhancing the respiratory metabolic pathway. Bioresource Technology, 341: 125788. https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0960852421011299?via%3Dihub (3) Yu WJ, Zhang LT, Zhao J, Liu JG (2021) Enhancement of astaxanthin accumulation in Haematococcus pluvialis by exogenous oxaloacetate combined with nitrogen deficiency. Bioresource Technology, https://doi.org/10.1016/j.biortech.2021.126484. https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0960852421018265