《4月8日_SARS-CoV-2基因组的系统发育网络分析》

  • 来源专题:COVID-19科研动态监测
  • 编译者: zhangmin
  • 发布时间:2020-04-10
  • 1.时间:2020年4月8日

    2.机构或团队:德国法医遗传学研究所、剑桥大学麦克唐纳考古研究所、Fluxus Technology有限公司,英国Lakeside Healthcare Group at Cedar House Surgery、德国基尔大学

    3.事件概要:

    德国法医遗传学研究所和剑桥大学麦克唐纳考古研究所等机构的研究人员在PNAS期刊在线发表题为“Phylogenetic network analysis of SARS-CoV-2 genomes”的文章。

    文章提到,在对160个完整的人类SARS-Cov-2基因组进行的系统发育网络分析中,研究人员发现了3个由氨基酸变化所区分的主要变异体,将其命名为A、B和C,根据蝙蝠外群冠状病毒,A是祖先型。A型和C型在东亚以外地区(即欧洲人和美国人中)的比例很高。相比之下,B型是东亚最常见的类型,其祖先基因组似乎如果没有先突变成衍生B型,就不会扩散到东亚以外的地区,这表明在亚洲以外地区对该类型有创始效应或免疫或环境抗性。该网络如实地追踪了记录在案的COVID-19病例的感染路径,这表明系统发育网络同样可以成功用于帮助追踪未记录的COVID-19感染源,然后可以对其进行隔离以防止疾病在世界范围内的反复传播。

    4.附件:

    原文链接:https://www.pnas.org/content/early/2020/04/07/2004999117

  • 原文来源:https://www.pnas.org/content/early/2020/04/07/2004999117
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