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《从不同临床 COVID-19 患者中分离出的 SARS-CoV-2 的 RdRp 基因分型》

  • 来源专题：新发突发传染病
  • 编译者： 张玢
  • 发布时间：2024-03-15

  • 自从抗击COVID-19开始以来，人们就观察到了SARS-CoV-2的演变，一些突变可能是病毒潜在危险变种的标志。然而，SARS-CoV-2的遗传变体与COVID-19的严重程度之间并没有明确的联系。我们的目的是分析RdRp的遗传变异性与COVID-19不同病程之间的相关性。

    这项前瞻性研究包括了77个从门诊患者（一级严重程度）和住院患者（二级、三级和四级严重程度）中分离出的SARS-CoV-2样本。回顾性分析包括在GISAID数据库中存储的15,898,266例SARS-CoV-2基因组序列。基于SARS-CoV-2的四个测序扩增论文，确定了单核苷酸变体。使用合适的统计方法对结果进行了分析，p值小于0.05被认为具有统计学意义。此外，还进行了逻辑回归分析，以预测观察到的关系中最强的决定因素。突变数量与COVID-19的严重程度呈正相关，以及在年长的男性患者中。我们检测到四个显著增加COVID-19患者住院风险的突变（14676C>T, 14697C>T, 15096T>C, 和15279C>T），而在门诊患者中分离出的菌株中常见的是15240C>T突变。在GISAID数据库中全球搜索所选突变，其存在与COVID-19的严重程度相关。

    已识别的突变有潜力用于评估COVID-19阳性患者住院风险的增加。需要开展实验研究和广泛的流行病学数据调查，以研究单个突变与COVID-19严重程度之间的关联。

  • 原文来源：https://bmcinfectdis.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12879-024-09146-x
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  • 《澳门地区10例COVID-19患者的临床特征及SARS-CoV-2 RNA排出的评估》
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    • 编译者：蒋君
    • 发布时间：2020-05-06
    • 作为一个以旅游闻名的城市，澳门特别行政区的公共医疗体系在2019年冠状病毒病（COVID-19）爆发期间一直承受着巨大压力。在这项研究中，我们报告了2020年1月21日至2月16日在圣胡安里奥医院中心（CHCSJ）招募的10例COVID-19患者的临床和微生物学特征。所有患者的临床样本包括鼻咽拭子（NPS）/痰收集尿液和粪便，以通过标准qRT-PCR分析进行连续病毒RNA检测。总共有7例是进口病例，3例是本地病例。澳门入境至进口个案的中位时间为3天。四名患者需要氧气治疗，但没有一个需要手法通气。没有发现致命病例。最常见的症状是发烧（80％）和腹泻（80％）。与“轻度至中度”组相比，“严重”组中的老年患者（p = 0.045），乳酸脱氢酶水平较高（p = 0.002）和C反应蛋白水平高得多（p <0.001） 。所有患者的NPS和粪便样本中SARS-CoV-2 RNA信号均为阳性，而所有尿液样本均为阴性。根据我们关于粪便中SARS-CoV-2 RNA脱落的数据以及NPS标本中病毒检测滞后的可能性，建议对粪便和呼吸道标本进行评估，以增强诊断敏感性，并有助于在出院前做出出院决定。阐明了病毒RNA在粪便中的脱落作用。
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