《从不同临床 COVID-19 患者中分离出的 SARS-CoV-2 的 RdRp 基因分型》

  • 来源专题:新发突发传染病
  • 编译者: 张玢
  • 发布时间:2024-03-15
  • 自从抗击COVID-19开始以来,人们就观察到了SARS-CoV-2的演变,一些突变可能是病毒潜在危险变种的标志。然而,SARS-CoV-2的遗传变体与COVID-19的严重程度之间并没有明确的联系。我们的目的是分析RdRp的遗传变异性与COVID-19不同病程之间的相关性。

    这项前瞻性研究包括了77个从门诊患者(一级严重程度)和住院患者(二级、三级和四级严重程度)中分离出的SARS-CoV-2样本。回顾性分析包括在GISAID数据库中存储的15,898,266例SARS-CoV-2基因组序列。基于SARS-CoV-2的四个测序扩增论文,确定了单核苷酸变体。使用合适的统计方法对结果进行了分析,p值小于0.05被认为具有统计学意义。此外,还进行了逻辑回归分析,以预测观察到的关系中最强的决定因素。突变数量与COVID-19的严重程度呈正相关,以及在年长的男性患者中。我们检测到四个显著增加COVID-19患者住院风险的突变(14676C>T, 14697C>T, 15096T>C, 和15279C>T),而在门诊患者中分离出的菌株中常见的是15240C>T突变。在GISAID数据库中全球搜索所选突变,其存在与COVID-19的严重程度相关。

    已识别的突变有潜力用于评估COVID-19阳性患者住院风险的增加。需要开展实验研究和广泛的流行病学数据调查,以研究单个突变与COVID-19严重程度之间的关联。

  • 原文来源:https://bmcinfectdis.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12879-024-09146-x
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