2020年4月，《自然》出版集团发布2020年最新“自然指数”（Nature Index）排名，中国机构领跑上升最快机构，上科大在多个排名中均榜上有名。
自然指数有两种计算排名的方式，分别为论文数量（Count, 即Article Count, AC）和分摊计数（Share, 即Fraction Count, FC）。Count指不论一篇文章有一个还是多个作者，每位作者所在的国家或机构都获得1个Count分值，Count值在一定程度上代表了一家医院的论文发布数量。Share指将一篇论文的所有作者视为贡献相同，一篇文章的Share总分值为1.0，由所有作者平等共享，分别计入其隶属机构或国家/地区，Share值在一定程度上考虑了每位论文作者的相对贡献。
上科大在Top 500 Institutes中进入全球第290位、中国第56位，但这个排位以及各个学科的总排名受机构体量很大影响。鉴于上科大属于小规模的新建学校，自然指数上升情况能从另一个侧面反映其变化。在“自然指数上升最快机构”（top rising institutes）方面，上科大有突出表现：
在全球“Top rising institute”（2015-2019）中，按Share值的上升幅度排位，上科大位居第4位，从2015年的5.7上升到53.02，升幅827.5%。
在“Top rising institute in chemistry”(2015-2019)中，按Share值的上升幅度排位，上科大位居第5位，从2015年的2.1上升到31.2，升幅1357.1%。
在“Top rising institute in life sciences”(2015-2019)中，按Share值的上升幅度排位，上科大位居第3位，从2015年的1.85上升到13.78，升幅646.8%。
在“Top rising institute in physical sciences”（2015-2019）中，按Share值的上升幅度排位，上科大位居第7位，从2015年的2.36上升到16.42，升幅596.3%。
详见附件：20200506 Nature Index 2020 概况
附件：Nature index 2020年数据
