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《7月13日_斯克利普斯研究所等解析针对SARS-CoV-2的共有抗体应答的结构基础》

  • 来源专题：COVID-19科研动态监测
  • 编译者： zhangmin
  • 发布时间：2020-07-28

  • Science期刊于7月13日发表了美国斯克利普斯研究所、加州大学圣地亚哥分校、国际艾滋病疫苗倡议组织（IAVI）、哈佛-麻省理工-麻省总医院拉贡研究所的文章“Structural basis of a shared antibody response to SARS-CoV-2”。

    文章指出，中和抗体对SARS-CoV-2的反应的分子理解可加速疫苗设计和药物开发。该文章中，研究人员分析了294种针对SARS-CoV-2的抗体，发现IGHV3-53是最常用于靶向刺突蛋白受体结合域（RBD）的IGHV（重链可变区）基因。 带有或不带有Fab CR3022的两种IGHV3-53中和抗体与RBD在分辨率为2.33至3.20Å下的共结晶结构，表明种系编码的残基主导了ACE2结合位点的识别。这种结合模式将IGHV3-53抗体限制在较短的CDR H3环上，但可适应轻链多样性。这些IGHV3-53抗体显示出最小的亲和力成熟度和高效力，这对疫苗设计很有希望。文章表示，这些结构基序和结合模式的知识可能有助于引发这种中和反应类型的抗原的设计。

    原文链接：https://science.sciencemag.org/content/early/2020/07/10/science.abd2321

  • 原文来源：https://science.sciencemag.org/content/early/2020/07/10/science.abd2321
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    • 编译者：zhangmin
    • 发布时间：2020-06-11
    • 1.时间：2020年6月9日 2.机构或团队：斯克里普斯研究所、加利福尼亚大学、国际艾滋病疫苗行动组织、哈佛大学 3.事件概要 斯克里普斯研究所、加利福尼亚大学、国际艾滋病疫苗行动组织和哈佛大学的科研人员在bioRxiv预印本平台发表题为“Structural basis of a public antibody response to SARS-CoV-2”的文章。 文章指出，从分子水平上理解人类中和抗体对SARS-CoV-2的反应可以加速疫苗设计和促进药物发现。研究人员分析了294种SARS-CoV-2抗体，发现IGHV3-53是针对刺突蛋白的受体结合域（RBD）最常用的IGHV基因。研究人员测定了两种IGHV3-53中和抗体（+/- Fab CR3022）的晶体结构，其分辨率在2.33- 3.11埃之间。IGHV3-53的谱系编码残基在和ACE2表位结合中占主导地位，不与CR3022表位重叠。此外，IGHV3-53用于和非常短的CDR H3结合以及和不同的轻链结合。总的来说，IGHV3-53是中和SARS-CoV-2的多功能抗体VH，其特定的谱系特征和最小的亲和力成熟为疫苗设计和评估结果提供了重要的见解。 *注，本文为预印本论文手稿，是未经同行评审的初步报告，其观点仅供科研同行交流，并不是结论性内容，请使用者谨慎使用。 4.附件： 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.06.08.141267v1
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  • 《美国斯克利普斯研究所等讨论SARS-CoV-2的起源》
    • 来源专题：生物安全知识资源中心 | 领域情报网
    • 编译者：hujm
    • 发布时间：2020-03-27
    • 3月17日，Nature Medicine期刊发表了来自美国斯克利普斯研究所、英国爱丁堡大学等研究团队的题为“The proximal origin of SARS-CoV-2”的文章。 自湖北省武汉市首次报道COVID-19以来，科学界对SARS-CoV-2的起源进行了大量的讨论。本文通过对基因组数据的比较分析，对SARS-CoV-2的起源作了综述。从分析SARS-CoV-2基因组的显著特征的视角，讨论了它们可能出现的情景。文章的分析结果清楚地表明，SARS-CoV-2不是一种实验室合成或人为构建的病毒。 作者通过对α-和β-冠状病毒的比较确定了SARS-CoV-2的两个显著的基因组特征：（1）在结构研究和生化实验的基础上，SARS-CoV-2与人受体ACE2高亲和力似乎是自然选择的结果；（2）SARS-CoV-2的刺突（S）蛋白在S1和S2亚基之间存在12个核苷酸的插入，形成了多碱基（弗林）切割位点，进而造成了这附近多了3个氧-连接聚糖。 关于SARS-CoV-2的起源理论，文章认为SARS-CoV-2不太可能是通过实验室操作一种相关的SARS-CoV样冠状病毒而出现的。相关基因数据分析无可辩驳地表明，SARS-CoV-2并不是从以前任何一种病毒主干中衍生出来的。相反，文章提出了两种可能的情况来解释SARS-CoV-2的起源：（1）在传播给人类之前动物宿主中的自然选择；（2）在人畜共患病转移之后在人体中进行的自然选择。然后，文章还讨论了病毒在细胞和生物体中的培养和传代科学研究过程中的选择是否会导致SARS-CoV-2出现，但也排除了实验室泄漏造成病毒出现的可能。 文章最后给出结论，认为在全球COVID-19爆发并成为全球突发公共卫生事件中，研究病毒的起源很重要。但需要更多的科学数据和证据来得出正确结论。获得相关的动物源病毒序列将是揭示病毒起源的最确定方法，以研究新插入的多碱基切割位点和氧原子连接的多糖的生理作用。不管SARS-CoV-2通过自然选择产生的确切机制是什么，对人类和其他动物肺炎的持续监测显然是至关重要的。
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