5月17日,bioRxiv预印本平台发表了来自天津医科大学、国家癌症临床研究中心和国家超级计算机中心等机构的研究团队的题为“Computational Study of Ions and Water Permeation and Transportation Mechanisms of the SARS-CoV-2 Pentameric E Protein Channel”的文章。
文章指出,冠状病毒(包括SARS-CoV-2)编码一种包膜(E)蛋白,它是一种小的疏水膜蛋白。SARS-CoV-2的E蛋白与SARS-CoV具有高度同源性。该研究将结合计算机模拟方法,深入了解SARS-CoV-2 E蛋白通道的功能以及离子和水的渗透机制。文章指出,结果表明,五聚体E蛋白促进单价离子通过通道的渗透。分析潜在平均力(PMF)、孔半径和扩散系数的结果表明Leu10和Phe19是通道的疏水门。另外,在跨膜电压下,孔表现出明显的润湿/去润湿转变,具有单价阳离子选择性,这表明它是疏水性电压依赖性通道。
*注,本文为预印本论文手稿,是未经同行评审的初步报告,其观点仅供科研同行交流,并不是结论性内容,请使用者谨慎使用。