《SARS-CoV-2五聚体E蛋白通道的离子与水渗透和运输机理的计算研究》

  • 来源专题:生物安全知识资源中心 | 领域情报网
  • 编译者: hujm
  • 发布时间:2020-05-27
  • 5月17日,bioRxiv预印本平台发表了来自天津医科大学、国家癌症临床研究中心和国家超级计算机中心等机构的研究团队的题为“Computational Study of Ions and Water Permeation and Transportation Mechanisms of the SARS-CoV-2 Pentameric E Protein Channel”的文章。

    文章指出,冠状病毒(包括SARS-CoV-2)编码一种包膜(E)蛋白,它是一种小的疏水膜蛋白。SARS-CoV-2的E蛋白与SARS-CoV具有高度同源性。该研究将结合计算机模拟方法,深入了解SARS-CoV-2 E蛋白通道的功能以及离子和水的渗透机制。文章指出,结果表明,五聚体E蛋白促进单价离子通过通道的渗透。分析潜在平均力(PMF)、孔半径和扩散系数的结果表明Leu10和Phe19是通道的疏水门。另外,在跨膜电压下,孔表现出明显的润湿/去润湿转变,具有单价阳离子选择性,这表明它是疏水性电压依赖性通道。

    *注,本文为预印本论文手稿,是未经同行评审的初步报告,其观点仅供科研同行交流,并不是结论性内容,请使用者谨慎使用。

  • 原文来源:https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.05.17.099143v1
相关报告
  • 《5月17日_SARS-CoV-2五聚体E蛋白通道的离子与水渗透和运输机理的计算研究》

    • 来源专题:COVID-19科研动态监测
    • 编译者:zhangmin
    • 发布时间:2020-05-19
    • 1.时间:2020年5月17日 2.机构或团队:天津医科大学、国家癌症临床研究中心、国家超级计算机中心、南开大学附属医院、南开大学、重庆大学 3.事件概要: 5月17日,bioRxiv预印本平台发表了来自天津医科大学、国家癌症临床研究中心和国家超级计算机中心等机构的研究团队的题为“Computational Study of Ions and Water Permeation and Transportation Mechanisms of the SARS-CoV-2 Pentameric E Protein Channel”的文章。 文章指出,冠状病毒(包括SARS-CoV-2)编码一种包膜(E)蛋白,它是一种小的疏水膜蛋白。SARS-CoV-2的E蛋白与SARS-CoV具有高度同源性。该研究将结合计算机模拟方法,深入了解SARS-CoV-2 E蛋白通道的功能以及离子和水的渗透机制。文章指出,结果表明,五聚体E蛋白促进单价离子通过通道的渗透。分析潜在平均力(PMF)、孔半径和扩散系数的结果表明Leu10和Phe19是通道的疏水门。另外,在跨膜电压下,孔表现出明显的润湿/去润湿转变,具有单价阳离子选择性,这表明它是疏水性电压依赖性通道。 *注,本文为预印本论文手稿,是未经同行评审的初步报告,其观点仅供科研同行交流,并不是结论性内容,请使用者谨慎使用。 4.附件: 原文链接https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.05.17.099143v1
  • 《Nature:研究发现药物阻断SARS-CoV-2刺突蛋白诱导的合胞体》

    • 来源专题:生物安全知识资源中心 | 领域情报网
    • 编译者:hujm
    • 发布时间:2021-04-12
    • 上呼吸道和肺部组织是新冠病毒感染的主要部位,COVID-19病毒会引起有独特的病理特征,包括肺血栓形成、频繁腹泻、炎症反应异常激活以及肺功能迅速恶化。其中的病理基础仍然不明确。 近期英国伦敦国王学院Mauro Giacca团队和帝国理工学院、意大利的里雅斯特大学等团队在Nature上发表了题为"Drugs that inhibit TMEM16 proteins block SARS-CoV-2 Spike-induced syncytia"的论文。 研究团队发现,COVID-19病毒感染的患者的肺中含有形态异常、多核的受感染肺细胞。这些合胞体的产生是SARS-CoV-2刺突蛋白在细胞质膜水平激活的结果。 基于这些研究结果,研究团队进行了两次基于显微镜的高通量筛选,用3000多种批准的药物来寻找刺突蛋白驱动合胞体的抑制剂。研究团队集中鉴定了83种抑制刺突蛋白介导的细胞融合的药物。研究人员把注意力集中在有效的药物上,这些药物也能防止病毒复制和相关的细胞病变。最有效的分子之一是氯硝柳胺,它通过抑制TMEM16F/Anoctamin6(一种钙激活的离子通道和scramblase,负责细胞表面的磷脂酰丝氨酸暴露)的活性,显着减弱了刺突蛋白表达细胞中的钙振荡和膜传导。 这一研究结果提示了COVID-19疾病发病的潜在机制,并为氯硝柳胺用于治疗提供了依据。