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《南加州大学呼吁破解T细胞受体的所有组成部分以解开COVID-19之谜》

  • 来源专题：生物安全知识资源中心 | 领域情报网
  • 编译者： hujm
  • 发布时间：2020-06-19

  • 南加州大学的科研人员在Trends in Pharmacological Sciences期刊在线发表题为“Deciphering the TCR repertoire to solve the COVID-19 mystery”的文章。
    文章指出，到目前为止，SARS-CoV-2已在全世界感染了数百万人，并导致25万多人死亡。一些重要的问题仍然没有得到解答，例如为什么一些患者会发展成严重的疾病，而另一些却没有？遗传变异在个体对病毒感染的免疫反应中起什么作用？文章讨论了在COVID-19的发病机理中，T细胞在协调抗病毒反应中发挥的关键作用。研究人员强调了在COVID-19中进行全面和纵向T细胞受体（TCR）分析的科学依据，以及分析COVID-19患者的TCR库将揭示重要发现的原因，这些发现可能解释了在COVID-19患者中观察到的结果差异。最后，研究人员提供了一个框架，介绍了在获得有用的TCR所有组成部分的数据以推进COVID-19的防控工作中所涉及的不同策略、优势和挑战。

  • 原文来源：https://www.cell.com/trends/pharmacological-sciences/fulltext/S0165-6147(20)30130-9
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    • 编译者：zhangmin
    • 发布时间：2020-06-06
    • 1.时间：2020年6月3日 2.机构或团队：南加州大学 3.事件概要： 南加州大学的科研人员在Trends in Pharmacological Sciences期刊在线发表题为“Deciphering the TCR repertoire to solve the COVID-19 mystery”的文章。 文章指出，到目前为止，SARS-CoV-2已在全世界感染了数百万人，并导致25万多人死亡。一些重要的问题仍然没有得到解答，例如为什么一些患者会发展成严重的疾病，而另一些却没有？遗传变异在个体对病毒感染的免疫反应中起什么作用？文章讨论了在COVID-19的发病机理中，T细胞在协调抗病毒反应中发挥的关键作用。研究人员强调了在COVID-19中进行全面和纵向T细胞受体（TCR）分析的科学依据，以及分析COVID-19患者的TCR库将揭示重要发现的原因，这些发现可能解释了在COVID-19患者中观察到的结果差异。最后，研究人员提供了一个框架，介绍了在获得有用的TCR所有组成部分的数据以推进COVID-19的防控工作中所涉及的不同策略、优势和挑战。 4.附件： 原文链接：https://www.cell.com/trends/pharmacological-sciences/fulltext/S0165-6147(20)30130-9
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    • 编译者：yanyf@mail.las.ac.cn
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    • 理查德·基特尼（Richard Kitney）教授讨论了疫苗，对抗原和抗体的有效测试，对疾病各个阶段的有效诊断以及用于监视人群的应用程序。 对于我们所有人来说，这仍然是一个奇怪的时刻。当然，在英国，我们目前已被锁定，这一期限已延长至5月7日。英国政府每天发布有关冠状病毒的死亡统计数据-目前每天约800。查看统计数据并进行推断，似乎要把英国带到5月中下旬才能使每天的死亡人数降至100以下。就锁定的放松而言，这将触发阶段性响应。尽管正在进行大量工作，但令人十分沮丧的是，目前我们无法进行湿实验室工作。 我的经验是，网上工作已经花了很多时间。但是，由于除了短途步行之外我们无法外出，因此可以阅读更多内容。我一直在阅读（再阅读）的一件事是理查德·韦斯特弗勒（Richard Westfall）的出色传记艾萨克·牛顿（Isaac Newton）。 Westfall描述了牛顿在1666年鼠疫之年-剑桥大学关闭期间如何退回到叔叔的农场，伍尔索普庄园，位于林肯郡格兰瑟姆附近。那一年，他进行了许多著名的光学和光实验，并制定了《万有引力定律》。令人惊讶的是，今天有某些相似之处。在1665年和1666年的瘟疫岁月中，伦敦有30,000多人死亡，然而，正如牛顿所证明的那样，科学发现仍在继续。伦敦目前的冠状病毒死亡人数已接近4000，而克服冠状病毒危机的国际科学活动空前。 现在很明显，该解决方案包含多个组件。其中包括治疗药物，疫苗，有效测试抗原和抗体，有效诊断疾病各个阶段以及监测人群的应用程序。关于疫苗，有一些有希望的发展。例如，牛津大学的萨拉·吉尔伯特（Sarah Gilbert）教授的工作，他希望在本周或下周在最初的人体临床试验中使用疫苗，并有可能在今年秋天大量生产该疫苗。帝国理工学院的罗伯特·沙托克（Robert Shattock）教授正在开发一种基于RNA的疫苗，该疫苗将于今年年底准备就绪。而且，位于波士顿的生物技术公司Moderna的COVID-19疫苗已于3月中旬进入临床试验。在所有这些情况下，建立安全性和有效性将非常重要。一旦成功试验了疫苗，下一个主要问题就是生产足够数量的疫苗。 在以前的博客中，我曾谈到过加拿大的Medicago公司，该公司使用基于烟草植物的方法来生产疫苗。在《华尔街日报》最近发表的一篇有趣的文章中，Saabira Chaudhuri和Denise Roland也描述了英美烟草公司(BAT)是如何在肯塔基州的生物加工子公司采取类似的策略来生产Medicago的。正如这些作者所指出的那样，英美烟草公司在种植烟草方面有大量的专业知识，烟草种植成本低，而且由于其以农业为基础，有潜力迅速生产大量疫苗。当然，在Medicago的案例中，他们的方法是基于合成体(机器人和自动化的使用将大大提高可靠性和再现性)。 那么，对抗原和抗体的有效检测又如何呢?合成生物学(工程生物学)能发挥重要作用吗?合成生物学方法的核心是DNA (RNA)测序和合成，这在某些疫苗开发方法中无疑是重要的——例如Robin Shattuck的方法。然而，另外，合成生物学的整个设计、构建、测试和学习(DBTL)方法直接适用于系统生物设计和基于计算机的工作流程。这进而导致了实验室自动化的广泛应用和生物制品的发展。在检测冠状病毒抗原方面，可以认为，使用人体操作人员进行检测可能很慢，可能不可靠，而且容易出错。然而，基于合成生物学的自动化测试的优点是它有潜力变得更加可靠。一个有趣的例子是在我们的中心，伦敦帝国学院的SynbiCITE进行的工作。这是由我的直接同事Paul Freemont教授领导的。已知PCR方法对COVID-19的抗原检测非常敏感。SynbiCITE的方法是基于PCR，使用96孔的方法和Felix机器人。该机器人被编制了一个系统的工作流程，可以根据不同的条件进行优化。帝国理工学院的两家医院(圣玛丽医院和查林十字医院)正在测试这种方法。初步试验结果表明，该方法具有较高的可靠性和较低的误差率。一个机器人每天可以进行大约1000次单独的测试，并且可以连续运行。此外，多个机器人可以使用相同的工作流程并行运行——并且方法是试剂制造商不可知的。在我看来，这种方法的另一个主要优点是可以直接在医院内进行检测和分析，而不需要将样本运送到可能很远的主要中心。 在我的下一篇博客中，我将回到我清单上的其他项目:额外的抗原和抗体测试方法、疾病不同阶段的有效诊断以及监测人群的应用程序等。 最后是关于SynbiTECH 2020的介绍。会议定于7月6日和7日在伦敦市中心的QEII会议中心举行。由于冠状病毒封锁，不得不推迟。我高兴地告诉大家，会议将于10月26日至27日在QEII中心举行。我们还计划在7月6日举办为期半天的网络研讨会(虚拟会议)，作为10月份主要会议的前奏。
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