关于基因型多样性及其相互关系的信息对种质管理,作物改良和作物制种至关重要。在本次研究中,收集到包括亚洲栽培稻(Oryza sativa L)、非洲栽培水稻(O. glaberrima Steud)以及利用24个农业生态学和27个微卫星标记评估的种间杂交水稻(O. sativa×O. glaberrima)等36种的水稻品类。采集到的这些水稻品种主要是由改良品种和一些适应西非高地生态的地方品种组成,而且这些品种的香农多样性指数值(Shannon's diversity index)为0.23。其中,亚洲栽培稻品种(Oryza sativa L)(H'= 0.32)的遗传多样性最高;而非洲栽培稻品种(O. glaberrima)(H'= 0.18)遗传多样性最低;种间杂交水稻(O. sativa×O. glaberrima)遗传多样性居中,其上有321个等位基因,平均每个基因位有11.9个等位基因,而且平均主要等位基因频率为0.29个/基因位。此外,其香农多样性指数值--平均基因多样性值为0.81,多态信息含量为0.80 /基因位。从中可以发现,种间水稻(O. sativa×O. glaberrima)的多样性指数介于亚洲栽培稻品种(O. sativa)和非洲栽培稻品种(O. glaberrima)之间,但与亚洲栽培稻品种(O. sativa group Japonica)更接近。因此,由两个群体组成的种质相当于亚洲栽培稻(Oryza sativa L)、非洲栽培水稻(O. glaberrima Steud),而种间水稻(O. sativa×O. glaberrima)种质分散在两组之间。