《Mol Cell | 上海药物所合作发现细胞能量感受器AMPKγ全新作用机制》

  • 来源专题:生物安全知识资源中心—领域情报网
  • 编译者: hujm
  • 发布时间:2022-11-17
  •   AMPK是细胞内重要的生物能量代谢调节分子。AMPK能够感受细胞内ATP/AMP/ADP水平,在低能量供给条件下,磷酸化下游特异性底物,减少ATP的消耗,促进ATP的合成。AMPK由催化亚基AMPKα、支架蛋白AMPKβ和调节亚基AMPKγ组成。AMPKγ的CBS结构域能够结合ATP、AMP、ADP,并根据其比例不同而改变构象,从而调节AMPKα活性。
      2022年11月15日,浙江大学生命科学研究院赵斌教授团队和冯新华教授团队、中国科学院上海药物研究所谭敏佳研究员团队合作在Molecular Cell上在线发表题为Energy sensor AMPK gamma regulates translation via phosphatase PPP6C independent of AMPK alpha 的研究论文。这一研究通过比较AMPKγ和AMPKα敲除细胞中底物磷酸化水平、采用串联亲和纯化以及磷酸化蛋白质组学分析等方法,揭示了AMPKγ可独立于经典的催化亚基AMPKα,调控磷酸酶PPP6C,进而调节其下游底物(例如eEF2)的磷酸化,从而介导了细胞能量水平对蛋白质合成的调控。

      该研究通过对比葡萄糖饥饿处理后AMPKγ和AMPKα敲除细胞内经典下游底物的磷酸化水平差异,发现被认为间接受AMPKα激酶调控的eEF2蛋白的磷酸化在AMPKγ敲除后下降,但在AMPKα敲除后反而上升。进一步研究表明,AMPKγ能够参与调控eEF2的去磷酸化。通过AMPKγ互作蛋白质谱鉴定以及磷酸酶文库筛选,发现PPP6C的敲减明显导致eEF2磷酸化上升,并且能被葡萄糖饥饿调控。体外和体内结果显示,能量水平可以调控AMPKγ和PPP6C的结合,进而调控PPP6C与eEF2的结合。结果表明AMPKγ能够独立于AMPKα,与PPP6C形成复合物,感受能量变化,调控蛋白的去磷酸化。结合细胞内稳定同位素标记培养技术(SILAC)的定量磷酸化修饰组学策略对野生型和PPP6C敲低细胞在能量应激状态下磷酸化修饰组进行定量分析显示,除eEF2外,还有多个磷酸化位点被相似的机制调控。进一步验证表明,葡萄糖饥饿同样可以通过AMPKγ-PPP6C调控HSPB1(S82)和PCM1(S93)的磷酸化。
      综上,该研究第一次提出AMPKγ可以独立于AMPKα,与其他效应分子(如PPP6C),参与能量平衡的调控。AMPKγ-PPP6C调控的蛋白质去磷酸化可能在能量应激失调相关疾病中也发挥重要作用。
      浙江大学生命科学研究院赵斌课题组周琦、中国科学院上海药物研究所谭敏佳课题组郝兵兵为本文的共同第一作者。赵斌教授、谭敏佳研究员和冯新华教授为共同通讯作者。该工作还得到了陈帅、叶存奇等合作实验室的大力支持。
    全文链接:https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1097276522010589

     

  • 原文来源:http://www.simm.ac.cn/web/xwzx/kydt/202211/t20221117_6549576.html
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    • 编译者:hujm
    • 发布时间:2021-03-04
    • 2021年2月16日,中国科学院上海药物研究所李佳研究员和臧奕研究员共同在国际知名期刊Cell Reports杂志上在线发表了题为“AMPK-Mediated Phosphorylation on 53BP1 Promotes c-NHEJ”的研究成果。该项研究首次深入阐明了AMPK促进DNA双链损伤修复的作用方式以及具体机制,发现了AMPK通过对新底物53BP1的磷酸化修饰促进c-NHEJ修复,从而维持基因组的稳定性。   单磷酸腺苷激活的蛋白激酶AMPK是细胞中重要的能量感受器和调节器,在调控糖脂代谢、细胞生长、细胞极性、细胞有丝分裂和细胞凋亡等多种生命活动中发挥着重要作用。近年来,陆续有报道指出AMPK可能参与DNA损伤修复这一重要的生命过程,但具体作用机制不明。 DNA双链断裂(DSB,DNA double-strand break)是所有DNA损伤类型中最为严重的损伤,能引起细胞凋亡与染色体结构变化。DNA双链断裂损伤修复(DSBR,DNA double-strand break repair)的调控与肿瘤发展、肿瘤化疗与耐受息息相关。在本项研究中,科研人员在此修复类型中对AMPK的生物学功能进行了进一步细致的考察。   研究团队发现,在DSB发生时,AMPKα2催化亚基会被迅速招募到损伤位点,且AMPKα1/α2双催化亚基的敲除会引起DSB修复效率下降以及细胞电离辐射敏感性增高,进一步确证了AMPK参与DSBR。深入研究其参与的具体修复方式,科研人员发现AMPKα催化亚基的缺失会导致非同源末端连接(c-NHEJ)修复活性下降,以及在B细胞成熟过程中的依赖于c-NHEJ的抗体类别转换重组(CSR)的缺陷。在进一步的机制研究中,科研人员发现,AMPK可通过磷酸化调控DSB损伤修复中的关键蛋白53BP1,促进其在损伤修饰位点H4K20me2的稳定聚集,以及招募下游效应蛋白RIF1启动通路,该磷酸化调控在促进修复完成和维持基因组稳定性中发挥重要作用。 本研究不仅揭示了AMPK参与DNA损伤修复调控的新机制,并且丰富了AMPK的下游调控网络和53BP1的上游修饰调控,激励着科研团队进一步探索AMPK在能量代谢和DNA损伤修复之间的联系。   上海药物所的博士研究生江越菁、董莹为本文的共同第一作者。上海药物所是本研究的第一完成单位。该项工作得到了中国科学院生物化学与细胞生物学研究所孟飞龙研究员,上海药物所谭敏佳研究员、黄敏研究员以及浙江大学黄俊教授的帮助。该研究获得了国家自然科学基金、国家相关人才计划、上海市“科技创新行动计划”和中国科学院王宽诚人才奖的资助。
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    • 来源专题:生物安全知识资源中心—领域情报网
    • 编译者:hujm
    • 发布时间:2022-04-19
    • 心血管疾病是目前全球第一大疾病死亡原因,而高胆固醇引起的血脂异常是导致心血管疾病死亡的重大风险之一。他汀类药物是高血脂的一线治疗药物,但是15%的患者存在他汀不耐受或者他汀降脂效果不佳等临床缺陷。因此,开发高效安全的高血脂治疗药物具有重要的研究意义。 2022年4月14日,中国科学院上海药物研究所柳红课题组和黄河课题组合作在Cell Metabolism上发表了文章“Identification and evaluation of a lipid-lowering small compound in preclinical models and in a Phase I trial”,在发现降血脂候选药物并开展作用机制和新靶点发现研究方面取得重要进展。 柳红课题组、王逸平课题组和蒋华良课题组合作,前期通过多轮结构改造和成药性优化,开发获得具有我国自主知识产权的降脂候选药物DC371739(一类新药)。候选药物DC371739可剂量依赖地降低金黄地鼠血清中TC、LDL-C和TG水平,起效剂量仅为10 mg/kg;在自发性高血脂恒河猴动物模型中,DC371739可剂量依赖地降低血清中TC和LDL-C水平,起效剂量仅为3 mg/kg。基于DC371739良好的体内外降脂作用和优良的药代动力学特性和安全性,该项目于2020年7月获得临床批件。2020年9月入组首例病人,开展I期临床研究。I期临床研究结果表明,DC371739在健康受试者和高血脂患者体内均具有良好的安全性、耐受性和药代动力学特性。高血脂患者临床研究结果表明,DC371739口服给予40毫克剂量组可降低高血脂患者体内的TC和LDL-C水平。   柳红课题组和黄河课题组合作开展了候选药物DC371739的降脂作用机制研究。相关研究结果表明,候选药物DC371739与天然产物小檗碱、单克隆抗体类PCSK9抑制剂的作用机制截然不同,并不直接作用于PCSK9,对LDLR的mRNA也无影响,而是通过抑制转录因子HNF-1α,剂量依赖地降低PCSK9和ANGPTL3的mRNA水平。研究人员通过设计化学探针和定点突变实验,明确了DC371739与HNF-1α的结合位点和作用模式。DC371739通过与HNF-1α结合抑制其转录功能,降低PCSK9和ANGPTL3的转录水平,下调了PCSK9蛋白和ANGPTL3蛋白表达,进而增加了LDLR蛋白表达和LPL活性,促进循环中LDL-C和TG的清除,从而发挥降脂作用。   他汀类药物在临床使用过程中会增加PCSK9蛋白表达影响其降脂活性。基于DC371739独特的降脂作用机制,研究人员设计了DC371739与阿托伐他汀钙进行联合用药的治疗方案。研究结果表明,候选药物DC371739可下调由阿托伐他汀钙诱导增加的HepG2细胞中PCSK9蛋白表达,进一步增加LDLR蛋白表达水平。DC371739与阿托伐他汀钙联合用药,可进一步降低高血脂大鼠的TC、TG和LDL-C水平。 研究人员首次发现高血脂治疗潜在新靶标HNF-1α,并揭示了降脂候选药物DC371739独特的作用新机制,发现了其临床疗效监控生物标志物PCSK9和ANGPTL3,为高血脂症个性化临床研究奠定基础。另外,研究人员根据其独特的降脂作用机制提出DC371739与阿托伐他汀钙联合用药方案,为他汀不耐受或者他汀治疗效果不佳的患者提供了治疗的潜在新策略。   上海药物所的王江、严聪和席聪以及南京中医药大学的赵晶为该研究论文共同第一作者。上海药物所柳红研究员和黄河研究员为该研究论文的共同通讯作者。该研究获得了国家自然科学基金、临港实验室重点项目、上海市科委基金以及广州嘉越医药科技有限公司的资助。 原文链接:https://www.cell.com/cell-metabolism/fulltext/S1550-4131(22)00094-8