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《新研究发现新冠病毒破坏肺部原因》

  • 来源专题：新发突发疾病（新型冠状病毒肺炎）
  • 编译者： 蒋君
  • 发布时间：2021-06-11

  • 美国能源部布鲁克海文国家实验室的科学家在《自然·通讯》杂志上发表了首个详细的新冠病毒包膜蛋白的原子级模型，该蛋白与维持肺部黏膜所必需的一种名为PALS1的人类肺细胞连接蛋白结合，该模型展示了这两种蛋白质是如何相互作用的，有助于解释病毒如何在特别脆弱的新冠肺炎患者中造成广泛的肺损伤，并从肺部逃逸感染其他器官。这一发现可能会加快治疗该疾病相关药物的研究。

  • 原文来源：;https://finance.ifeng.com/c/86vVVQHSUUK
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相关报告

  • 《Nature：新研究发现9种新的冠状病毒》
    • 来源专题：生物安全知识资源中心—领域情报网
    • 编译者：hujm
    • 发布时间：2022-02-20
    • 在一项新的研究中，来自加拿大、法国、俄罗斯、西班牙、美国和德国的研究人员重新分析了所有公开的RNA测序数据，发现了比以前已知的RNA病毒多出近10倍的病毒，包括在一些意想不到的地方发现的几种新的冠状病毒。这个全球规模的RNA病毒数据库可以帮助快速识别病毒外溢到人类，以及那些影响牲畜、作物和濒危物种的病毒。相关研究结果于2022年1月26日在线发表在Nature期刊上，论文标题为“Petabase-scale sequence alignment catalyses viral discovery”。论文通讯作者为加拿大独立研究员Artem Babaian博士。 Babaian博士是Serratus项目合作的幕后推手。Babaian说，与云创新中心（加拿大英属哥伦比亚大学和亚马逊网络服务之间的公共/私人合作）合作，Serratus项目能够在亚马逊网络服务上建立一台“极其强大”的超级计算机，其功率相当于22500个CPU。 这台超级计算机读取了来自世界各地570万个生物样本的2000万GB（gigabyte, 千兆字节）的公开基因序列数据，寻找表明存在RNA病毒的特定基因。这些样本已经收集了13年，并在世界研究界内自由分享，包括从冰芯样本到动物粪便的一切样本。 Serratus项目的研究人员发现了132000种RNA病毒（以前只知道15000种）和9种新的冠状病毒。Babaian估计，如果没有云创新中心和亚马逊网络服务，传统的超级计算机需要花费一年多的时间和几十万美元来完成这项分析所需的2000年的CPU时间。Serratus项目在11天内花费24000美元完成了这一任务。 Babaian说，“我们正在进入一个了解自然界中病毒的遗传和空间多样性的新时代，以及各种各样的动物如何与这些病毒接触。我们希望是如果像SARS-CoV-2---导致COVID-19的冠状病毒---之类的病毒再次出现，我们不会措手不及。这些病毒可以更容易地被识别，并且可以更快地找到它们的天然病毒库。真正的目标是这些感染被及早识别，以至于它们永远不会成为大流行病。如果一名病人出现不明原因的发烧，一旦对血液进行测序，你如今可以将人类中的未知病毒与现有病毒的更大数据库联系起来。例如，如果一名病人在圣路易斯市出现了来源不明的病毒感染，你如今可以在大约两分钟内通过这种数据库进行搜索，并将这种病毒与例如2012年在撒哈拉以南非洲取样的一只骆驼联系起来。” 32岁的Babaian之前一直在加拿大英属哥伦比亚省癌症研究中心进行癌症基因研究，当COVID-19大流行病发生时，他转换了研究方向。Babaian说，这项新的研究是作为一个“有趣的副业”开始的，始于2020年3月3日，当时他和他的登山伙伴朋友---英属哥伦比亚大学工程系学生Jeff Taylor---“在一张餐巾纸的背面”勾勒出了这个想法。他指出，“我应该保留那张餐巾纸。” Babaian不久后向英属哥伦比亚大学的云创新中心（Cloud Innovation Centre）寻求帮助。Serratus项目，以英属哥伦比亚省Tantalus山脉的Serratus山命名，他和Taylor在2020年的一次攀登中看到了这座山，于是发起了这个项目。 Babaian回忆说，当第一批研究结果开始在他的笔记本电脑上闪现时，他正坐在他妻子的护理椅上，这表明Serratus项目不仅在工作，而且以几乎难以理解的速度产生数据。 他说，“这可能是我生命中最激动人心的科学时期。有两种类型的乐趣。第一类是微笑和开玩笑。第二类是当你在做这件事的时候很痛苦，但记忆却很闪亮，就像攀岩。在许多方面，Serratus项目是第二类乐趣。你只需要相信它会成功。” Babaian说，如果没有英属哥伦比亚大学云创新中心的支持，他不可能完成这项研究。他说，“云创新中心确实在那里为我们打开了大门。我们有一个想法，他们从他们的网络中带来了专家，使其成为现实。如今，全球社会可以从所有这些以前未被利用的研究中受益。” 英属哥伦比亚大学云创新中心主任Marianne Schroeder说，“Babaian带着一个创新的愿景找到了我们。英属哥伦比亚大学云创新中心的力量在于，我们将英属哥伦比亚大学的内部创新和技术团队与亚马逊网络服务的团队配对。我们非常荣幸能够支持这一愿景的实现；协助为复杂问题找到技术解决方案是我们的工作。” 参考资料： Robert C. Edgar et al. Petabase-scale sequence alignment catalyses viral discovery. Nature, 2022, doi:10.1038/s41586-021-04332-2.
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  • 《猫狗身上发现新冠病毒变异株B.1.1.7》
    • 来源专题：生物安全知识资源中心 | 领域情报网
    • 编译者：hujm
    • 发布时间：2021-03-23
    • 据美国《科学》杂志19日报道，美国和法国研究人员近日发布两份报告称，他们首次发现了狗和猫感染新冠病毒变异株B.1.1.7的证据，这是科学家首次在人体之外发现这种变异株。 　　自2020年12月以来，全球各地冒出多个新冠病毒变异株，这些变异株似乎更易传播或能逃避某些免疫反应。如英国新增新冠肺炎感染病例中，有95%的病例感染了B.1.1.7。 　　到目前为止，这些变异株对宠物有何影响还是未知数。尽管全世界已有超过1.2亿人感染新冠病毒，但只有少数宠物病毒检测结果呈阳性，当然有可能因为没有人对它们开展检测。不过，这种情况可能会改变。 　　在一项研究中，法国国家可持续发展研究所专门研究人畜共患疾病的病毒学家埃里克·勒罗伊和同事分析了英国伦敦郊区拉尔夫兽医转诊中心心脏科收治的宠物的患病情况，发现罹患心肌炎的狗和猫的数量急剧上升：从2020年12月到2021年2月，这种疾病的发病率从1.4%上升到12.8%。就在同一时间，英国人感染B.1.1.7变异株的数量激增。 　　他们观察了8只猫和3只狗。这些动物没有心脏病病史，但都出现了嗜睡、食欲不振、呼吸急促和晕厥等症状。此外，实验室检查显示其心脏异常，心跳不规则，肺部也有积液，实际上，人类感染新冠病毒也有类似症状。 　　研究小组在预印本服务器bioRxiv上报告说，他们对7只动物进行了聚合酶链反应检测，其中3只动物的新冠病毒抗体呈阳性，它们都携带B.1.1.7变异株。对另外4只动物进行新冠病毒抗体检测后，他们发现了其中两只曾经感染过B.1.1.7的证据。此前，美国德州农工大学的研究人员在该州布拉佐斯县的一只猫和一只狗身上发现了B.1.1.7变异株。 　　勒罗伊说，目前还不清楚B.1.1.7在人和动物之间的传播能力是否强于原始株。 　　美国宾夕法尼亚大学兽医学院的微生物学家雪莱·兰金指出，研究人员只显示了罹患心肌炎可能与感染B.1.1.7有关，但也没有排除其他可能性。 　　加拿大圭尔夫大学安大略兽医学院的兽医斯科特·韦斯也认为，这两项研究的结果都不能说明宠物可能将病毒传播给人类，“宠物成为感染源的风险仍然很低。”不过，他也表示，科学家和兽医应该研究新冠病毒及其变异株在宠物罹患心肌炎中的作用。
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