2023年10月4日,安进子公司deCODE Genetics在Nature上发表了题为Large-scale plasma proteomics comparisons through genetics and disease associations的文章。高通量蛋白质组学平台测量血浆中数千种蛋白质,结合基因组和表型信息,有能力弥合基因组和疾病之间的差距。该研究对英国生物银行制药蛋白质组学项目生成的Olink Explore 3072数据进行了关联研究,这些数据来自5万多名英国生物银行参与者的血浆样本,具有表型和基因型数据,按英国或爱尔兰、非洲和南亚血统分层。
研究人员将结果与SomaScan v4对36000名冰岛人血浆的研究结果进行了比较,其中1514人的Olink数据也可用。研究人员发现两个平台之间存在适度的相关性。虽然在两个平台上检测到的顺式蛋白数量性状位点的绝对数量相似(在Olink上为2101个,而在SomaScan上为2120个),但在Olink平台上具有此类分析性能支持证据的分析比例更高(72%对43%)。相当多的蛋白质具有不同平台之间的基因组关联。该研究提供了一些例子,说明平台之间的差异可能会影响从蛋白质水平与疾病研究的整合中得出的结论。研究人员展示了如何利用英国生物银行参与者的不同血统来帮助检测新的关联和完善基因组定位。该研究结果显示了两种最常用的高通量蛋白质组学平台提供的信息的价值,并展示了它们之间的差异,这些差异有时提供了有用的互补性。
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