《使用合成基因组学平台快速重建SARS-CoV-2》

  • 来源专题:新发突发疾病(新型冠状病毒肺炎)
  • 编译者: 蒋君
  • 发布时间:2020-03-06
  • 逆向遗传学已经成为必不可少的工具,彻底改变了我们对病毒发病机理和疫苗开发的见解。大型RNA病毒基因组(例如冠状病毒),由于大小和偶尔的不稳定性,很难在大肠杆菌宿主中进行克隆和操纵,因此,RNA病毒的另一种快速而强大的反向遗传学平台将使研究界受益。在这里,我们展示了基于酵母的合成基因组学平台的完整功能,可用于多种RNA病毒的基因重建,包括冠状病毒科、黄病毒科和副粘病毒科的成员。使用病毒分离物,克隆的病毒DNA、临床样品或合成DNA生成病毒亚基因组片段,并使用转化相关重组(TAR)克隆在酿酒酵母中一步组装,以将基因组维持为酵母人工染色体(YAC)。 T7-RNA聚合酶已被用于产生传染性RNA,然后被用于拯救活病毒。基于该平台,我们能够在收到合成DNA片段后仅一周的时间内,对最近流行的SARS-CoV-2的化学合成克隆进行工程改造和复活。我们在此描述的技术进步可对爆发的病毒快速做出反应,因为它可以在爆发期间实时实时生成不断发展的RNA病毒变体并对其功能进行表征。

  • 原文来源:;https://www.biorxiv.org/content/biorxiv/early/2020/02/21/2020.02.21.959817.full.pdf
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    • 编译者:xuwenwhlib
    • 发布时间:2020-05-05
    • 信息名称:瑞士科学家利用合成基因组学平台快速重建SARS-CoV-2 1.时间:2020年5月4日 2.机构或团队:瑞士伯尔尼大学病毒学与免疫学研究所 3.事件概要: 瑞士伯尔尼大学病毒学与免疫学研究所在Nature发表论文“Rapid reconstruction of SARS-CoV-2 using a synthetic genomics platform”。反向遗传学是研究病毒的发病机制和疫苗的发展的有效工具。文章展示了一个基于酵母的合成基因组学平台可以对多种RNA病毒进行重新构建,包括冠状病毒科、黄病毒科和副粘病毒科成员。通过使用病毒分离株、克隆病毒DNA、临床样品或合成DNA片段构建病毒亚基因组片段,利用转化相关重组克隆在酿酒酵母中进行一步重组,以保持基因组为酵母人工染色体(YAC)。T7 RNA聚合酶已被用于产生感染性的RNA以替代活病毒。基于该平台,能够在收到合成的DNA片段后仅一周的时间内,对SARS-CoV-2进行人工改造和复活。文章描述的新技术可以快速响应新兴病毒,因为它可以对RNA病毒变体进行实时功能表征。 4.附件: 原文链接:https://www.nature.com/articles/s41586-020-2294-9
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