《通过宏基因搜索鉴定穿山甲是否与2019-nCoV样冠状病毒有关》

• 来源专题：新发突发疾病（新型冠状病毒肺炎）
• 编译者： 蒋君
• 发布时间：2020-02-28
• 原文来源：;https://www.biorxiv.org/content/biorxiv/early/2020/02/14/2020.02.08.939660.1.full.pdf

我们演示了一种元元基因组方法，在NCBI序列阅读档案库中的所有高通量测序数据中，通过关键词“ virome”检索与武汉冠状病毒2019-nCoV的密切相关的信息。2019-nCoV序列描述除了和蝙蝠冠状病毒的同源性外（2020，Nature，doi.org/10.1038/s41586-020-2008-3; P.2020， Nature，doi.org/10.1038/s41586-020-2012-7），我们注意到与Liu等人报道的从穿山甲的肺部生成的元病毒组数据集中的大量序列读数具有很强的同源性。 （病毒11:11，2019，http://doi.org/10.3390/v11110979）。研究通过广泛的宏基因组数据库搜索发现，与新型冠状病毒序列匹配上最多的是穿山甲肺组织来源的冠状病毒测序片段；我们的观察结果与对2019-nCoV的推论的讨论有关，并说明了元元基因组搜索工具有效且快速。