发表机构：北京大学，重庆医科大学
作 者：张泽民（通讯作者）
在人体组织器官中，细胞通过有序协作维持结构与功能，但细胞在组织层面的协同机制仍不明确，这限制了对组织稳态和癌症等疾病的理解。
该研究整合35种人体组织的单细胞转录组数据，构建跨组织单细胞图谱，用CoVarNet鉴定出12个细胞模块。这些模块分布有组织特异性，如CM04-CM09主要含免疫细胞，富集于免疫器官和外周血；CM02、CM03多见于泌尿系统和胃肠道；CM07、CM12偏好生殖系统等。
将细胞模块映射到空间转录组数据，发现CM05在小肠派氏结富集，可能是黏膜免疫诱导部位；CM02、CM03分布于肠黏膜，参与黏膜免疫效应环节，且两者细胞组成有差异。
分析细胞模块内部调控发现，富含淋巴细胞的模块空间聚集性高，信号分子种类有限，细胞因子起关键调控作用，如效应记忆CD8+T细胞对TNF-α的响应因模块而异。
细胞模块与个体表型关联分析显示，脾脏中CM05和CM06随年龄增长呈相反动态趋势，CM05中17个转录因子活性增强；依托乳腺CM12构建的更年期进展轨迹，显示两类成纤维细胞频率下降、炎症特征减弱。
在肿瘤研究中，整合泛癌种单细胞图谱发现，组织特异性健康细胞模块在肿瘤进展中减弱，跨癌种共享的肿瘤相关模块cCM02增强，其由耗竭性T细胞等构成。据此提出肿瘤进展模型：癌变时组织特异性结构瓦解，建立跨癌种趋同的肿瘤微环境模式。
该研究系统描绘了健康与疾病状态下的多细胞协同模式，提供了新理论框架和分析工具，构建的图谱是重要数据资源，为相关研究开辟了新视角。
发表日期：2025-05-28
