《成都生物所在蛇类高海拔环境的适应机制研究中获进展》

  • 来源专题:长江流域资源与环境知识资源中心 | 领域情报网
  • 编译者: changjiang
  • 发布时间:2018-08-02
  • 大多数生物 通常 都对其生存环境有一定要求,超出 适宜的范围 就 难以 存活;但有一些生物却可以在强辐射 、 缺氧等极端环境中 繁衍生息 ,这类生物被称为极端环境生物。由于其独特的生活环境, 长期的适应性进化使得这些生物 在基因结构组成 、 酶特性及代谢功能等方面均不同于其它生物。

    温泉蛇属 Thermophis 隶属于游蛇科,该属目前包括三个物种:温泉蛇 Thermophis baileyi 、四川温泉蛇 Thermophis zhaoermii 和香格里拉温泉蛇 Thermophis shangrila , 它们 为中国特有的珍稀保护物种,是世界上分布海拔最高的蛇类之一。 它们 均生活于青藏高原海拔 范围为 3500 ~4400 米 的地区, 主要 栖息在温泉附近的石堆、水边 和 沼泽草甸中 。 温泉蛇的起源和演化与青藏高原的形成和隆起有着密切的联系。

    目前,全世界已知蛇类约有 3600 种,主要分布在热带、亚热带和温带地区,少数在寒带地区。从垂直分布来看,沿海、沿湖低地到海拔 1000 米上下的种类最多,有一部分种类分布在海拔 2000~3000 米的地方。早在 1907 年,温泉蛇作为唯一一种生活在青藏高原海拔 4000 米以上的蛇被英国人 Frank Wall 首次发现时,就已经“颠覆”了人们对当时现有蛇类的认知。同时 , 青藏高原寒冷、氧分压低、紫外线辐射强烈的特点 , 造成其许多地区不适合人类居住甚至是生命禁区 , 是亚洲人口最稀少的地区。 前期的许多研究都集中在恒温动物对高原的适应,如高原人类、高原牦牛等。缺乏对高原变温动物适应高原环境遗传机制的研究,而温泉蛇正好为我们揭开变温动物高海拔适应之谜提供了良好的动物模型。

    中国科学院成都生物研究所李家堂等研究团组对温泉蛇进行了全基因测序,将得到的全基因组序列和同属物种及亲缘关系较近 的 低海拔物种全基因组进行重测序,融合已发表的 9 个低海拔物种全基因组序列,利用比较基因组学分析,在高海拔温泉蛇属三个物种中发现了 27 个不同蛋白中的 27 个共有氨基酸替换。这些突变多与免疫 、 低氧适应应答和 DNA 修复等功能相关。分子功能实验验证的结果表明,与 DNA 修复相关的 FEN1 (瓣状核酸内切酶 -1 )基因的突变型相对于野生型(低海拔物种基因类型)在紫外照射下具有更强的稳定性,推测突变有助于温泉蛇属物种在高海拔环境中对紫外线的抵抗。与西藏人相似,作为高原物种,温泉蛇 EPAS1 (内皮 PAS 结构域包含蛋白 -1 )基因的突变减弱了其调节下游基因红细胞生成素表达的能力,进而导致温泉蛇血红蛋白浓度处于较低水平,是温泉蛇适应高海拔低氧条件的重要原因。

    该研究成果以题为 “Comparative genomic investigation of high-elevation adaptation in ectothermic snakes” (比较基因组学研究解析变温动物蛇类对高海拔环境的适应) ,于 北京时间 2018 年 8 月 1 日凌晨在线发表在国际学术期刊 PNAS (《美国科学院院刊》) 。 本研究得到了中国科学院战略性先导科技专项和前沿局重点项目,国家自然科学基金和中国科学院青促会项目等经费资助。

相关报告
  • 《成都生物所在基因流下物种界限维持机制研究中获进展》

    • 来源专题:生物科技领域知识集成服务
    • 编译者:陈方
    • 发布时间:2021-03-08
    • 成都生物所在基因流下物种界限维持机制研究中获进展 物种形成及物种界限(Speciation and Species boundary)的问题,是Science在2005年提出的125个重要科学问题之一,近年来受到广泛关注。生物学家认为,由于生殖隔离的存在,不同物种之间无法进行基因交流,以此维持物种的界限。随着DNA测序技术的不断发展,越来越多的证据表明分类学上界定的不同物种之间存在基因交流。 为研究在广泛存在的基因流背景下,物种如何维持自己的身份(identity)、并保持与其他物种的界限问题,中国科学院成都生物研究所生物多样性与生态功能服务领域植物标本馆针对滇西北地区高海拔分布的百合属植物,选择了由沿海拔梯度分布的3种豹子花植物组成的杂交区(hybrid zone),通过群体遗传学建立谱系结构、生态位模拟揭示适应性差异及开花物候差异统计花粉流方向等方面的研究,表明该杂交区内存在沿坡度向下的不对称基因流(asymmetry gene flow)。但三个物种形态差异较大、且不存在大量中间过渡形态,表明在基因流背景下物种的界限得到了较好的维持。该研究表明,物种的开花物候、种子传播方式决定基因流的方向;生态位之间的差异导致的环境过滤(environment filtering)对适宜分布区外的物种及其杂交后代的剔除效应是物种界限维持的机制。百合属植物较大的染色体及由此导致的低重组率可能是物种维持“关键基因”不被交换的原因。这些结果显示,物种是动态的、变化的,自然环境(自然选择)与基因重组的相互作用是物种进化的动力之一。相关研究成果于2020年12月07日发表到Frontiers in Plant Science上。 宋琪 摘编自http://www.cas.cn/syky/202012/t20201206_4769551.shtml 原文标题:成都生物所在持续基因流下物种界限维持机制研究中获进展
  • 《成都生物所在特异性根系分泌物组分所驱动的土壤C-N循环过程及其作用机制研究中获进展》

    • 来源专题:长江流域资源与环境知识资源中心 | 领域情报网
    • 编译者:changjiang
    • 发布时间:2018-03-13
    • 森林根系分泌物输入在森林土壤生物地球化学循环过程中的重要作用已获得了广泛的认可和极大的关注。然而,目前有关森林根系分泌物生态学效应研究主要聚焦了根系C源输入,而有关根系分泌物不同组分对土壤C-N养分循环过程的特异性影响研究甚少,一定程度上限制了对森林根系-土壤-微生物互作过程及其生态重要性的深入认识。 基于此,中国科学院成都生物研究所袁远爽博士在刘庆研究员和尹华军研究员的指导下,利用本研究团队自制的根际模拟装置(该技术装置已获得国家专利授权,专利号: 201720602562.2 ),针对性地选取了两种不同能量特性的根系分泌物组分(葡萄糖和草酸,前者能量远高于后者),研究了两种模拟根系分泌物组分输入对西南亚高山森林土壤 C-N 养分转化过程的影响效应与作用机理差异。前期研究表明,相比于能量较高的葡萄糖而言,能量较低的草酸诱导了明显的土壤正 C 激发效应而显著降低了土壤总 C 含量( Yuan et al.,2017; Plant and Soil ) 。进一步研究表明,两种根系分泌物组分通过调控了不同的非生物作用过程而驱动了差异化的土壤 N 转化过程。具体而言,草酸添加后打破了金属 / 矿物 - 有机复合体界面稳定性(降低了铁铝金属有机复合体 (MOCs) 和铁铝短程有序态 (SROs) 的含量),将被金属 / 矿物保护的有机质释放出来供土壤微生物和胞外酶分解利用,从而间接地促进土壤微生物对 SOM 分解,增加土壤 N 素的有效性。相反地, 葡萄糖添加却显著增加了土壤中铁铝金属 / 矿物 - 有机质复合体的形成,使得保护态的 SOM 很难被土壤微生物和胞外 N 转化酶直接分解利用,从而诱导了相对较小的 N 转化速率。该研究丰富了森林根系分泌物介导的生物地球化学循环过程及其作用机理的新认识。 研究结果近期以题为 Impacts of oxalic acid and glucose additions on N transformation in microcosms via artificial roots 发表在国际土壤类期刊《 Soil Biology and Biochemistry 》上。该研究得到了国家重点研发计划项目,中国科学院拔尖青年人才项目和国家自然科学基金等项目的资助。