本发明提供了一种自麦考酚酸菌株制备麦考酚钠的方法，包括：取麦考酚酸菌株产生菌孢子悬浮液，接种于种子培养基上在26～28℃下培养2～4天；种子培养基接种于发酵罐内并添加发酵培养基，26～28℃下发酵9～11天；向发酵液中添加酸使发酵液的pH呈3～4，然后向发酵液中添加氢氧化钠溶液使发酵液的pH呈8～9，脱色重结晶后得到麦考酚酸；将麦考酚酸与氢氧化钠或甲醇钠于醇类溶剂中合成麦考酚钠。在本发明中，将麦考芬酸菌株经过培养后得到的发酵液经过酸碱处理，并用氢氧化钠或者甲醇钠合成生成麦考酚钠，具有制备路线短，操作程序简单，制造成本较低的优点；同时，避免使用酮类有机溶剂，降低了对环境及人体的危害。
