《敏感纳米孔的氨基酸识别:基于机器学习的预测。》

  • 来源专题:纳米科技
  • 编译者: 郭文姣
  • 发布时间:2018-05-31
  • 蛋白质检测在确定单点突变中起着关键作用,而单点突变可导致多种疾病。纳米孔测序提供了一种无标签、单碱基、快速、长时间的阅读平台,使其适合于个性化医疗。纳米技术面临的一个挑战是离子电流的噪声。在此,我们证明了一种纳米孔单层二硫化钼(MoS2)可以检测到多肽链(16个单位)中的单个氨基酸,具有较高的准确度和可分辨性。使用广泛的分子动力学模拟(总总66µs)的模拟时间和机器学习技术,我们featurize和集群离子电流和停留时间的20种氨基酸和指纹识别的信号。利用logistic回归、最近的邻居和随机森林分类器,预测传感器读数的准确度分别为72.45、94.55和99.6%。此外,利用先进的ML分类技术,我们理论上可以预测超过280万个假设的传感器读数的氨基酸类型。

    ——文章发布于2018年5月24日

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