《分子植物卓越中心解析愈伤组织中多能干细胞的发育轨迹》

  • 来源专题:转基因生物新品种培育
  • 编译者: 姜丽华
  • 发布时间:2023-02-18
  • 利用组织培养技术进行器官再生是植物营养繁殖和基因编辑等现代农业分子育种技术应用的基础。在经典的两步法组织培养技术中,人们首先在愈伤组织诱导培养基上利用高浓度生长素使外植体产生愈伤组织,再在含有高浓度细胞分裂素的芽诱导培养基上诱导愈伤组织再生为芽,或在含有低浓度生长素的根诱导培养基上诱导愈伤组织再生为根。在模式植物拟南芥中发现,愈伤组织类似于根尖分生组织(Dev Cell, 18: 463-471, 2010)。愈伤组织可以大致分为外、中、内三个细胞层,其中愈伤中层细胞尤为关键,是根和芽再生的核心细胞层(Nat Plants, 7:1453-1460, 2021)。愈伤中层细胞如何发育而来?其分子调控机制是什么?这些是了解组织培养中植物器官再生的基础问题。

      2月10日,中国科学院分子植物科学卓越创新中心研究员徐麟团队以Developmental trajectory of pluripotent stem cell establishment in Arabidopsis callus guided by a quiescent center-related gene network为题在Development上发表研究,解析了拟南芥下胚轴外植体产生的愈伤组织各层细胞的发育轨迹,提出愈伤中层细胞具有多能干细胞属性。

      研究人员利用荧光报告基因,在愈伤组织诱导培养基上观察了愈伤组织发育过程,并将其划分为四个发育阶段。第一阶段为引导(priming),从再生潜能细胞(即中柱鞘、形成层等能够分裂为愈伤的细胞)命运转变为愈伤创始细胞。此时细胞体积扩张但并未分裂。WOX11、LBD16、SHR等基因开始在愈伤创始细胞中表达。第二阶段为起始(initiation),从愈伤创始细胞垂周分裂为愈伤原基。此时WOX11退出表达,LBD16、SCR、SHR、WOX5/7、PLT1/2、JKD等基因表达于愈伤原基中。第三阶段为模化(patterning),愈伤原基细胞进行平周分裂产生三个细胞层,形成成熟的愈伤组织。愈伤外层细胞类似于根尖的表皮和根冠,表达AtML1等特征基因;愈伤中层细胞具有根尖静止中心(quiescent center,QC)的特征,SCR、WOX5/7、PLT1/2、JKD等QC相关基因网络在中层细胞中高表达;内层细胞类似于根尖的维管初始细胞,表达WOL等特征基因。SHR的mRNA表达在愈伤内层,其编码的核定位蛋白会从内层移动到中层。第四阶段为维持(maintenance),即成熟愈伤组织不断进行细胞分裂和长大的过程。此时三个细胞层的属性能够在愈伤组织中维持。PLT3基因在愈伤组织发生的各个时期都有表达。

      研究人员观察了引导和起始过程中,细胞周期和细胞命运如何协同进行。通过细胞周期S期抑制剂的施加实验发现,WOX11和LBD16的表达不依赖于S期,而SCR、WOX5、PLT1的表达依赖于细胞进入S期。通过细胞周期M期抑制剂的施加实验发现,上述基因的表达都不依赖于细胞进入M期。因此,愈伤创始细胞顺利通过S期是诱导愈伤原基特征基因出现的重要步骤。

      研究人员分析了QC相关分子网络在愈伤中层细胞中的功能。QC相关分子网络中的基因突变后,都会导致愈伤组织再生芽和根的缺陷。SCR和SHR突变后会导致愈伤组织细胞分裂异常及中层QC-like属性的部分丧失。WOX5/7不仅维持了中层QC-like属性,也抑制VND基因的表达从而防止愈伤组织分化为维管。PLT1/2可以直接激活JKD转录因子基因的表达,维持愈伤中层的再生能力。总体来说,SCR-SHR-WOX5/7-PLT1/2-JKD这套QC相关分子网络,对于控制愈伤组织中层的多能干细胞属性和器官再生能力至关重要。

      通过上述研究,研究人员提出愈伤组织中层细胞具有多能干细胞属性。在动物中,多能干细胞指的是既能自我更新和维持、又能分化为成体所需所有细胞类型的一类干细胞。在植物种,愈伤组织中层细胞能够在愈伤组织诱导培养基中自我维持,又可以在芽诱导培养基或根诱导培养基中再生为芽或根的干细胞龛,进而发育为完整成体植物。因此,愈伤中层细胞具有类似于动物多能干细胞的能力,而这种能力与其QC-like属性密切相关。

  • 原文来源:https://www.cas.cn/syky/202302/t20230213_4874807.shtml
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  • 《分子植物卓越中心揭示植物激素茉莉酸跨膜转运分子机制?》

    • 来源专题:生物育种
    • 编译者:季雪婧
    • 发布时间:2024-11-07
    •      11月4日,《自然-植物》(Nature Plants)在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心张鹏研究组完成的题为Cryo-EM structure and molecular mechanism of the jasmonic acid transporter ABCG16的研究论文。该研究揭示了ABC(ATP-binding cassette)家族转运蛋白ABCG16特异识别和跨膜转运植物激素茉莉酸的分子机制。     作为植物激素,茉莉酸在植物对生物及非生物胁迫的防御反应中发挥作用,参与调节植物的生长发育。茉莉酸合成起始于植物叶绿体,在过氧化物酶体、液泡等细胞器中完成合成、修饰与代谢,进而被运输到细胞核以发挥生理作用。而跨膜转运蛋白在茉莉酸及前体和衍生物的跨膜运输过程中发挥作用。在拟南芥中,ABCG16/JAT1是质膜及核膜定位的ABC家族转运蛋白。有研究发现AtABCG16可以介导茉莉酸的跨膜转运,亦有研究显示AtABCG16可以参与脱落酸的跨膜转运。然而,关于茉莉酸在跨膜运输过程中如何被转运蛋白特异识别及转运的分子过程尚不明晰。     该研究利用非洲爪蟾卵母细胞转运体系检测发现,AtABCG16可以介导茉莉酸的外向转运,但不转运脱落酸。通过异源表达、纯化蛋白并结合不同的ATP类似物,研究在体外重构了AtABCG16跨膜转运过程的不同状态,并利用单颗粒冷冻电镜技术解析了AtABCG16处于不同构象状态的三维结构,包括朝向细胞内的apo构象、结合底物茉莉酸的构象、封闭构象及朝向细胞外的后转运构象。     三维结构分析揭示了AtABCG16的同源二聚体结构、茉莉酸的结合位点以及决定底物特异性结合的关键氨基酸。同时,研究利用非洲爪蟾卵母细胞转运体系和拟南芥胁迫处理实验证实了氨基酸在茉莉酸结合与转运中的作用。进一步,研究分析发现了AtABCG16的底物结合口袋无法容纳脱落酸的结合,进而明晰了AtABCG16无法介导脱落酸转运的原因。 该研究通过比较AtABCG16的不同构象发现,AtABCG16在胞质侧具有两个独立的底物入口,分别通往各自的底物结合口袋,并与二聚体组成的跨膜转运通道相连。同时,两个芳香族氨基酸Y494与F608位于底物入口和跨膜转运通道中,分别控制二者的开闭。这一结构特征决定了AtABCG16转运蛋白的跨膜转运机制与已知的ABC转运蛋白不同。基于结构和生化分析,研究提出了AtABCG16介导的茉莉酸跨膜转运的工作模型。 该研究揭示了AtABCG16特异识别并跨膜转运茉莉酸的分子机理,解释了AtABCG16在转运底物上的争议,并丰富了ABC转运蛋白的跨膜转运机制。     研究工作得到国家自然科学基金委员会和中国科学院的支持。
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    •     近年来,病虫害频繁爆发造成作物减产和品质下降。而大量使用化学农药控制农作物病虫害,破坏生态环境,威胁人类健康。培育广谱抗病品种是保障粮食安全、发展绿色农业、维护生态环境的重要举措之一。发掘广谱持久抗病基因,揭示植物免疫激活调控广谱抗病的分子机制,是农作物抗病育种的重要理论基础。     11月8日,《科学》(Science)以“背靠背”形式在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心两项重要科研成果。中国科学院院士、分子植物卓越中心研究员何祖华团队与研究员张余团队,联合复旦大学研究员高明君团队、浙江大学教授邓一文团队完成了题为A canonical protein complex controls immune homeostasis and multipathogen resistance的研究成果。分子植物卓越中心万里团队完成了题为Activation of a helper NLR by plant and bacterial TIR immune signaling的研究论文。     植物免疫的本质是识别“非我”。植物免疫系统通过识别病原微生物进而激活自身的免疫反应。该系统由两道防线组成。一是通过植物细胞表面感受器识别病原菌后产生的基础抗病性(PTI),而PTI相对温和且易被病原菌分泌的毒性蛋白突破。二是在进化中植物产生第二道防线即植物细胞内感受器NLR蛋白识别病原菌分泌的毒性蛋白后引起的专化性抗性(ETI),而该防线反应强烈且能够赋予植物强抗病性。植物ETI免疫反应依赖于植物特定的NLR感受器蛋白识别特定病原菌分泌的特定毒性蛋白。当前,由于ETI的特异性,植物抗病育种和病虫害防治缺乏有效方法激活植物ETI。如何克服ETI对病原菌的特异性以及实现有效的多病原广谱抗病性成为植物免疫研究的重要课题。 前期,何祖华及合作团队发现了水稻免疫抑制基因ROD1。该基因突变引起活性氧积累,产生免疫自激活表型,提高水稻对多个病原菌如稻瘟病、白叶枯病和纹枯病的抗性。而对于ROD1抑制免疫激活的信号网络尚不清楚。该团队采用EMS化学诱变和γ射线物理诱变筛选rod1抑制子的策略,经过大规模的田间表型鉴定筛选,获得18个rod1抑制子株系。基因克隆和全基因组测序分析显示,这些抑制子分别是OsTIR、OsEDS1、OsPAD4和OsADR1基因突变。研究显示,禾本科作物的细胞内感受器OsTIR蛋白具有产生免疫小分子pRib-AMP的功能,而小分子pRib-AMP能够激活水稻OsEDS1、OsPAD4和OsADR1蛋白形成免疫复合体EPA以激发免疫反应。进一步,研究发现,水稻免疫抑制蛋白ROD1与OsTIR互作,影响OsTIR的酶活,从而抑制小分子pRib-AMP的生成,避免EPA复合体激发免疫反应,维持免疫的稳态。当病原菌侵染时,ROD1被降解,OsTIR蛋白被释放后生成小分子激活免疫复合体EPA,产生对多种病原菌的广谱抗性。该研究揭示了五组分的信号网络调控植物免疫稳态的分子机制,为培育广谱抗多种病原菌的作物新品种奠定了理论基础,提供了靶标基因。     无独有偶的是,万里团队发现了植物细胞内感受器的TIR蛋白可生成小分子2’cADPR。这类小分子作为前体在植物体内可以被转化生成pRib-AMP,从而激活EPA免疫复合体,提高植物抗病性。利用2’cADPR处理植物即可诱导类似于ETI的强抗病性,实现了在没有特定病原菌侵染的情况下人为可控地激活植物强ETI免疫反应。相对于pRib-AMP,2’cADPR性质更稳定,更适合开发为植物免疫激活剂。这为发展绿色农业提供了可以激发农作物广谱抗病性的新型“生物农药”,并能够替代化学农药,减少对生态环境的负面影响。同时,一些细菌的TIR蛋白可以产生2’cADPR并激活植物的ETI免疫反应,进而该团队揭示了植物和细菌免疫通路交互的分子机理。     植物细胞内感受器TIR蛋白介导的ETI抗性是农作物抗病育种的重要靶标。因此,研究植物免疫受体及其工作机理,实现对植物免疫受体的人工定向改造,能够解决植物病害问题。上述两项成果共同揭示了在不同植物中保守的由小分子pRib-AMP和蛋白复合体EPA介导的免疫激活新机制,为植物病害防控提供了新型“生物农药”靶标。