2024年1月18日,美国Bethesda国家癌症研究所Mary Carrington团队在Science发表题为Impact of HLA class I functional divergence on HIV control的文章。该研究开发了一种称为“功能分歧”(”functional divergence”)的新指标,用于量化HLA等位基因对之间肽结合谱的互补性。该方法成功地根据其预测的抗原呈递广度对HLA基因型组合进行了排名。
对一个seroconverter队列的分析验证了以前的发现,即HLA-A和-B的同源性与AIDS的快速进展相关。然而,遗传距离度量未能解释这种效应。相反,对于HLA-A和HLA-B,低功能分歧与CD4迅速下降强烈相关。这两个基因座上分歧等位基因对的联合影响产生了最显著的保护作用。功能分歧的持续效应在精英控制者与非控制者以及具有纵向病毒载量数据的大队列中得到了确认。
功能分歧最初是使用从单个HLA等位基因中洗脱的自体肽计算的。然而,仅基于HIV衍生肽或已知CTL表位的重新计算产生了类似的结果,表明自体肽方法有效地模拟了生理相关的结合。该研究为研究HLA基因型对传染病结果的影响提供了一种敏感的新工具。它还提示了通过免疫可见肽基围的扩展来实现杂合子优势的机制。在HIV感染中,功能分歧可能在预测疫苗应答和免疫疗法效果方面变得有价值。总体而言,这项工作是肽水平上的HLA疾病关联方面的一项重大进展。