蕨类植物是一种神秘裸子植物谱系，包括三属，分别为买麻藤属、百岁叶属和麻黄属，形态不同于其他所有的种子植物。它们的独特性引发了许多关于种子植物的起源、进化和系统定位的争论。为增加我们对蕨类植物进化的理解，以及他们与其他种子植物的关系，我们在这里报告一个买麻藤的高质量基因组序列草图，第一种蕨类植物。通过使用一种新的基因组装配策略应对高水平的杂合性，我们组装> 4 GB的序列编码27491个蛋白编码基因。比较分析买麻藤与其他裸子植物基因组，揭示出一些引人注目的和独特的基因组特征，反转录转座子的不同组合，有证据表明消除频率高于累积频率，内含子结构存在显著差异，包括（反向）转座因子的长度分布和比例，以及功能蛋白结构域增殖的独特模式。此外，几个基因家族显示了麻藤属特异复制数量的扩展（例如纤维素合酶）或缩减（例如，晚期胚胎丰富蛋白），这可能与买麻藤独特的形态创新，以适应温暖、中生环境有关。总的来说，买麻藤基因组能够更好地分辨种子植物中的祖先基因组特征，以及鉴定基因组特征以区别买麻藤和其它裸子植物。
