如今，人们对结核分枝杆菌（Mtb）的全球谱系和亚谱系给予了极大的关注。 NEW-1（SIT 127）和CAS1-Delhi（SIT 26）菌株被认为是正在生长和循环的Mtb基因型，尤其是在亚洲国家。开发或增强Mtb基因分型方法对于这些谱系更准确和简单的区分至关重要。我们使用24位置分枝杆菌散布的重复单位可变数目串联重复序列（MIRU-VNTR）进行基因分型217 Mtb分离株。为了选择最佳的MIRU-VNTR基因座，我们计算了不同基因型组（NEW-1和non-NEW-1）之间以及菌株之间的Hunter-Gaston鉴别指数（HGDI），等位基因多样性和百分比差异（APDs）的累积。最后，构建最小生成树来进行聚类分析。在NEW-1种群中，发现APD> 60％的基因座具有较高的区分能力。 APD> 50％的VNTR基因座对CAS群体具有较高的区分能力。我们的发现表明，APD对于选择VNTR基因座集很有价值，它可以提高MIRU-VNTR分型的鉴别能力，以鉴定特定区域的Mtb基因型。
