《Cell:首次利用噬菌体成功治疗抗生素耐药性分枝杆菌肺部感染》

  • 来源专题:生物安全知识资源中心—领域情报网
  • 编译者: hujm
  • 发布时间:2022-05-15
  • 在一项新的研究中,来自美国国立犹太医学中心、匹兹堡大学和科罗拉多大学的研究人员首次成功使用噬菌体---杀死细菌的病毒---来治疗抗生素耐药性的分枝杆菌肺部感染,这就为国立犹太医学中心的一名患有囊性纤维化的年轻患者接受挽救生命的肺部移植扫清了道路。这项病例研究报告指出,这些作者成功使用噬菌体来治疗这名患者(即下文的Jarrod Johnson)的脓肿分枝杆菌(Mycobacterium abscessus)肺部感染。相关研究结果于2022年5月13日在线发表在Cell期刊上,论文标题为“Host and pathogen response to bacteriophage engineered against Mycobacterium abscessus lung infection”。

    论文第一作者兼论文共同通讯作者、美国国立犹太医学中心成人囊性纤维化项目主任Jerry Nick博士说,“我们多年来一直试图用多种抗生素清除这种分枝杆菌感染,但没有成功。当我们使用这种细菌自身的天敌(即噬菌体)时,我们能够清除这种感染,这导致了成功的肺部移植。”

    肺部移植受者Jarrod Johnson说,“我非常感谢所有参与我的治疗的人的努力、坚持和创造力。我以为我将会死去。他们真地拯救了我的生命。”

    囊性纤维化是一种遗传性疾病,会导致肺部堆积厚厚的粘液,导致反复的细菌感染,从而损害肺部并可能导致呼吸衰竭。尽管新的治疗方法已经极大地改善了囊性纤维化患者的预后,但这些患者的预期寿命仍然显著降低。

    分枝杆菌是一种常见而广泛存在的细菌属,可引起结核病、麻风病和非结核分枝杆菌(nontuberculous mycobacterial, NTM)感染。脓肿分枝杆菌是一种特别具有侵袭性和挑战性的NTM感染。多种抗生素的组合使用和延长一年或更长时间的治疗往往是不成功的。美国国立犹太医学中心拥有美国最大的成人囊性纤维化项目,是一个治疗NTM感染的领先中心。

    Johnson是一名26岁的囊性纤维化患者,在他的一生中反复遭受肺部感染。小时候,他每年都要在不同的医院住院数次。成年后,在六年的时间里,他经历了持续的脓肿分枝杆菌感染后,他的肺部功能迅速下降,并接受了多次不成功的治疗。到2020年,他的肺部功能已经下降到了30%以下。如果不进行肺部移植,医生认为他很可能在短短几年内死亡。

    Johnson曾被三个移植中心拒绝进行肺部移植,主要是因为他的分枝杆菌感染。分枝杆菌可以从肺部扩散到皮肤和其他组织,这可能会使接受肺部移植的患者在接受免疫抑制药物治疗时陷入困境。Nick博士和他的团队考虑将噬菌体作为一种潜在的治疗方案。Johnson曾在位于美国丹佛市的圣约瑟夫医院(Saint Joseph Hospital)住院,在接受噬菌体治疗之前的一年里,他在那里度过了200多天。

    噬菌体是攻击细菌的病毒。近年来,随着越来越多的细菌对抗生素产生耐药性,人们对用它们来治疗细菌感染的兴趣也越来越大。论文共同通讯作者、匹兹堡大学生物科学教授Graham Hatfull博士是发现和使用噬菌体来治疗分枝杆菌感染的领导者,并提供了用于治疗Johnson的噬菌体。

    噬菌体通常只对少数类型的细菌具有特异性。2016年,Nick博士和他的同事们提供了来自Johnson肺部的脓肿分枝杆菌样本,旨在寻找一种能够杀死这种分枝杆菌的噬菌体。Hatfull博士和他的团队筛选了几十种候选噬菌体,并确定了两种能有效杀死感染Johnson肺部的脓肿分枝杆菌的噬菌体。他们对这两种噬菌体进行了基因改造,以优化它们的治疗潜力。

    Nick博士说,“这项新的研究可以作为未来使用噬菌体治疗严重脓肿分枝杆菌肺部感染患者和拯救生命的路线图。”

    美国国立犹太医学中心的医生们获得了美国食品药品管理局(FDA)的授权,可以同情地使用这种实验性治疗。Johnson在2020年9月接受了他的第一次噬菌体输注,随后500天内每天输注两次。在两个月内,多种基因组、细胞培养和临床标志物表明,该疗法正在取得成功。噬菌体治疗开始后仅一年多,Johnson的肺部感染似乎已被清除了。

    论文共同作者、科罗拉多大学肺移植项目医学主任Alice L. Gray博士认为,Johnson的肺部移植目前是安全的,并将他列入了联系人名单。Johnson于2021年10月在科罗拉多大学医院(UCHealth)移植中心接受了新肺移植,并与Gray博士合作,在整个手术过程和康复期间一直使用噬菌体疗法。一系列标志物表明Johnson在肺部移植后没有感染的迹象。Johnson如今已经停止了对脓肿分枝杆菌的所有治疗,并过上了正常的生活。

    匹兹堡大学的Hatfull博士及其团队已经报告了另外两例严重分枝杆菌感染病例成功地对噬菌体疗法产生反应。这两例病例主要与皮肤感染有关。在这些成功病例研究的指导下,使用噬菌体治疗更广泛的患者将有助于确定抗体和噬菌体抵抗性的作用。

    参考资料:

    1. Jerry A. Nick et al. Host and pathogen response to bacteriophage engineered against Mycobacterium abscessus lung infection. Cell, 2022, doi:10.1016/j.cell.2022.04.024.

    2. First successful treatment of antibiotic-resistant mycobacterial lung infection with bacteriophages
    https://medicalxpress.com/news/2022-05-successful-treatment-antibiotic-resistant-mycobacterial-lung.html

  • 原文来源:https://news.bioon.com/article/a5aee26871ca.html
相关报告
  • 《Nat Commun:利用噬菌体成功治疗一名感染耐药性细菌的患者》

    • 来源专题:生物安全知识资源中心—领域情报网
    • 编译者:hujm
    • 发布时间:2022-02-10
    • 在一项新的研究中,来自比利时伊拉斯谟医院等机构的研究人员利用噬菌体疗法和抗生素的组合,成功地治疗了一名感染了耐药性细菌的成年女性。他们描述了使用这种疗法的原因以及它在其他情况下可能使用的方式。相关研究结果于2022年1月18日发表在Nature Communications期刊上,论文标题为“Combination of pre-adapted bacteriophage therapy and antibiotics for treatment of fracture-related infection due to pandrug-resistant Klebsiella pneumoniae”。 噬菌体是能够感染和杀死细菌的病毒。涉及它们在人类患者身上使用的研究已经进行了几十年,但它们仍然没有被用于治疗患者。在这项新的研究中,这些作者获得了一个独特的机会,不仅可以治疗一名需要帮助的患者,而且还可以了解更多关于可能使用病毒来治疗感染了对传统抗生素产生耐药性的细菌的患者。 在这个病例中,这名女性患者被恐怖分子的炸弹严重炸伤---她遭受了多重伤害,包括腿部的损伤。为她治疗的医生不得不切除一些骨头,这导致了细菌感染。对这名女性患者来说,不幸的是,这种细菌是肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneumoniae)。众所周知,这种细菌对抗生素有耐药性,而且它还能形成薄薄的使抗生素难以到达感染区域的生物膜。在几年的时间里,这些作者尝试了多种方法来去除这名患者的感染,但都没有效果。她的医疗团队发现没有其他选择,于是选择了噬菌体疗法。为此,他们向格鲁吉亚叶利亚瓦研究所的一个多年来一直在研究噬菌体疗法的团队寻求帮助。 要使用噬菌体,必须找到一种能够攻击感染背后的确切细菌菌株的病毒。这些作者进行了详尽的搜索和测试,直到最终在下水道的水样本中发现了一种称为M1的噬菌体。这种噬菌体在体外进行培养,然后混合到一种液体溶液中,并直接将混合后的溶液涂抹在这名患者腿上的感染部位。他们还使用了大量的抗生素。这名患者终于开始从感染中恢复,在三年的时间里,她恢复到了不仅没有细菌感染,而且能够再次行走。 这些作者建议,噬菌体疗法是一种可行的细菌感染治疗方法,不过他们指出,在考虑将它作为遭受细菌感染的患者的替代疗法之前,必须找到更好的寻找噬菌体的方法。 参考资料: Anaïs Eskenazi et al. Combination of pre-adapted bacteriophage therapy and antibiotics for treatment of fracture-related infection due to pandrug-resistant Klebsiella pneumoniae. Nature Communications, 2022, doi:10.1038/s41467-021-27656-z.
  • 《Clin Infect Dis:迄今为止最大的噬菌体治疗病例研究显示,利用噬菌体治疗分枝杆菌感染的成功率超过50%》

    • 来源专题:生物安全知识资源中心—领域情报网
    • 编译者:hujm
    • 发布时间:2022-06-26
    • 使用噬菌体治疗致命的分枝杆菌感染的报告病例数量上升了5倍。在一项新的研究中,来自匹兹堡大学和加州大学圣地亚哥分校等研究机构的研究人员报告了20项关于使用这种实验性治疗的新病例研究,显示该疗法在一半以上的患者中获得了成功。这是有史以来公布的最大的一组使用被称为噬菌体的杀菌病毒进行治疗的病例研究,提供了它们用于治疗严重感染的前所未有的细节,同时为未来的临床试验奠定了基础。相关研究结果于2022年6月9日在线发表在Clinical Infectious Diseases期刊上,论文标题为“Phage Therapy of Mycobacterium Infections: Compassionate-use of Phages in Twenty Patients with Drug-Resistant Mycobacterial Disease”。 论文共同通讯作者、匹兹堡大学文理学院生物技术教授Graham Hatfull说,“其中一些取得惊人的结果,另一些则很复杂。但当我们分析20例病例后,噬菌体对有利的结果做出了贡献变得更有说服力,毕竟是针对没有其他治疗选择的患者。” 病例研究中接受噬菌体治疗的每一位患者都感染了一种或多种分枝杆菌菌株,这类细菌在免疫系统受损或患有肺部疾病囊性纤维化的人身上会造成致命的、难治性的感染。2019年,Hatfull领导的一个研究团队展示了首次成功使用噬菌体来治疗分枝杆菌感染。 Hatfull说,“对于临床医生来说,这类感染真地是一场噩梦:它们不像其他一些类型的感染那样常见,但它们属于最难用抗生素治疗的一些疾病。特别是当你长期服用这些抗生素时,它们具有毒副作用性或耐受性不太好。” 2022年5月,Hatfull团队参与了两项新的病例研究,与美国国家犹太卫生局和哈佛大学的同事们合作,成功地治疗了患者。不过,这些报告的病例只是该团队在幕后参与的病例的一小部分。自2019年以来,Hatfull和他的实验室已经处理了200多名希望为患者寻找治疗方法的临床医生的请求,并与他们一起寻找可以有效对付感染每名患者的特定菌株的噬菌体。 这篇新的论文极大地扩大关于噬菌体疗法有效性的公开证据。Hatfull说,“这些医生非常勇敢,他们努力进行实验治疗,试图帮助那些别无选择的患者。每一项合作都是推动该领域向前发展的标志。” 通过观察患者的健康状况,以及患者的样本是否仍然显示分枝杆菌感染的迹象,这些作者发现,在这20例病例中,治疗成功的有11例。无患者出现任何不良反应。 另有5名患者的治疗结果不确定,有4名患者没有表现出改善。根据Hatfull的说法,即使是这些明显的失败,也是让更多患者获得该疗法的关键。他说,“在某些方面,这些是最令人关注的病例。了解他们为什么没有成功将是很重要的。” 这些病例研究中出现了几个意想不到的模式。在这11例病例中,这些作者无法找到一种以上可以杀死患者体内分枝杆菌感染的噬菌体,尽管标准做法是注射不同噬菌体的混合物,这样这些细菌就不太可能进化出抵抗性。 Hatfull说,“如果你在三年前问我这是不是个好主意,我会大发雷霆。但我们没有观察到抵抗性,即使只使用一种噬菌体,我们也没有看到因抵抗性而出现治疗失败。” 此外,这些作者看到一些患者的免疫系统攻击噬菌体,但只有在少数情况下,他们的免疫系统使噬菌体治疗失效。而在某些情况下,尽管有这样的免疫反应,这种治疗仍然是成功的。Hatfull说,这项新的研究为该疗法描绘了一幅令人鼓舞的图景,它为临床医生使用新的噬菌体疗法提供了可能性,以最大限度地提高该疗法的成功机会。 这项新的研究对遭受分枝杆菌感染的患者具有重要意义,也代表着更广泛的噬菌体治疗领域取得重大进展。一些担忧是,科学家们可能只发表噬菌体疗法成功的病例研究。 Hatfull说,“一系列连续的我们没有筛选的病例研究是一种更透明的方式来寻找什么有效,什么无效。这为这种疗法的安全性增加了相当大的砝码。” Hatfull实验室继续为更多的患者提供噬菌体疗法--与此同时进行研究以更大的人群,希望为更多没有其他治疗选择的患者提供治疗。 Hatfull说,“我们还没有找到或设计出能够感染这些患者体内所有细菌菌株的噬菌体。这代表着未来的主要挑战之一。” 参考资料: Rebekah M. Dedrick et al. Phage Therapy of Mycobacterium Infections: Compassionate-use of Phages in Twenty Patients with Drug-Resistant Mycobacterial Disease. Clinical Infectious Diseases, 2022, doi:10.1093/cid/ciac453.