弗吉尼亚大学经济学家Federico Ciliberto的最新研究结果表明，普遍采用转基因作物减少了杀虫剂的使用，但是增加了除草剂的用量，因为杂草的抗性增强了。
Ciliberto 作为首席科学家开展了至今最大规模的转基因作物和农药应用的研究，主要的经济学家还有堪萨斯州立大学的Edward D. Perry、密歇根州立大学的GianCarlo Moschini和爱荷华州立大学的David A. Hennessy。这四位经济学家研究了美国5000多大豆种植户和5000多玉米种植户的逐年数据，时间跨度为1998到2011年，远远超过了先前研究仅限于一到两年的数据。他们希望通过多年的数据能够了解农民什么时候采用转基因种子，以及对化学药品使用的变化。
自2008年以来，在美国80%以上玉米和大豆是转基因作物。玉米种子被转入两种基因：一种是能杀死吃籽粒后昆虫的基因；一种是抗草甘膦（一种常用除草剂）的基因。大豆则只转入了抗草甘膦基因。所以，采用转基因玉米的种植户比不采用的少使用杀虫剂，约11.2%。13年中，也少施用了1.3%的除草剂。另一方面，大豆除草剂的用量显著增加，转基因大豆比非转基因多用了约28%的除草剂，主要是由于抗草甘膦杂草的增生作用。昆虫的抗性没有进化，部分原因是联邦政府的规定需要农民有个转基因作物田地的“避风港”，昆虫在这里没有必要发展抗性。尽管降低了昆虫类农药的使用量，持续增长的除草剂的使用对环境产生了严重的影响，破坏了生物多样性、加重了水体和空气的污染。
Ciliberto和他的同事采用环境影响指数（EIQ）分析了转基因作物对环境的影响，涉及了化学对农田工作者、消费者和环境的影响，结果表明转基因大豆对环境产生负面影响，增加除草剂增加了当地生态环境的污染。
