《2016年荷兰作为高致病性禽流感A(H5N8)病毒流行原因的多重复合病毒》

  • 来源专题:新发突发疾病(新型冠状病毒肺炎)
  • 编译者: 张玢
  • 发布时间:2017-11-14
  • 2016年,荷兰高致病性甲型H5N8禽流感疫情造成野生鸟类大量死亡,数家商业养禽场和圈养鸟类受到影响。研究人员进行了全基因组测序,以研究野鸟和家禽病毒之间的关系。系统发育分析表明,该病毒与2016年5月在俄罗斯检测到的H5进化枝2.3.4.4病毒有关,但含有聚合酶碱性2和核蛋白基因片段以及聚合酶酸性片段的2种不同变体。分子测年表明,重配事件最有可能发生在俄罗斯或蒙古的野生鸟类。此外,在荷兰的野生鸟类中检测到2种遗传上不同的H5N5重配病毒。该研究为快速和持续地重配H5进化枝2.3.4.4病毒提供了证据,这可能导致病毒特征(如致病性,传染性,传播和人畜共患病潜力)的快速变化。

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    • 编译者:梁晓贺
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    • 2016年12月15日,日本农·食品产业技术综合研究机构国家动物卫生研究所(National Institute of Animal Health NARO)发现了高致病性禽流感(highly pathogenic avian influenza , HPAI)病毒的亚型病毒 。这种病毒是从11月28日发现的青森(Aomori)和新潟(Niigata)禽流感病毒中分离出来的。随后,研究人员进一步开展全基因组技术分析,从基因层面研究该病毒的起源和致病性,及其对人可能感染的风险进行评估。 研究发现,分别在青森市和新潟市分离出的HAPI致病病毒(青森菌株和新潟菌株)是H5N6亚型高致病性禽流感病毒。通过下一代测序技术对青森病毒株99.5%的核苷酸序列和新潟病毒株100%的核苷酸序列进行测序后发现,两种病毒的核苷酸序列在全部8个RNA片段中表现出了99.2%以上的同源性。此外,这两株病毒和从鹿儿岛出水市白头鹤栖息地的水里分离出的一种病毒有99.3%以上的同源性。进一步对这8个RNA片段和公共基因数据库中的流感病毒基因做对比发现,青森、新潟的病毒株和H5N6亚型高致病性禽流感病毒(即韩国病毒株)在所有片段上有97.4%的同源性。此外,8个基因片段中的7段以及剩下一段分别与2015年流行的H5N6亚型高致病性禽流感病毒以及其它禽流感病毒有97%以上的同源性。 但是,此项研究结果无法直接指明病毒起源。根据对比测量过的核苷酸序列,日本动物卫生研究所的研究人员对氨基酸排列顺序进行了推测,并基于此评估了人类感染的风险大小。由于青森、新潟的病毒株均没有发生氨基酸突变,而氨基酸突变是人类感染的条件之一,所以研究人员认为该病毒直接感染人类的可能性很低。 (编译 梁晓贺)