“ miRNA大肠癌”(https://mirna-coadread.omics.si/)是一个免费的web应用程序,用于研究microRNA和mRNA的表达及其在大肠癌中的相关性。据我们所知,“ miRNA大肠癌”基于来自相同数据源的最大可用样本量,拥有大肠癌中miRNA靶基因表达和相关性的最大知识库。分析了来自The Cancer Genome Atlas的295例结肠和直肠腺癌样品的高通量分子分析数据,并将其整合到我们的知识库中。开发此web应用程序的目的是帮助研究人员发现miRNA-靶基因相互作用在结肠直肠癌中的行为和作用。为此,可以通过网络表格获得在我们的知识库中收集的miRNA和mRNA数据的差异表达和相关性分析结果。为了通过实验验证我们的知识库,我们选择了基因FN1、TGFB2、RND3、ZEB1和ZEB2以及miRNA hsa-miR-200a/b/c-3p,hsa-miR-141-3p和hsa-miR-429。两种方法都揭示了miRNA hsa-miR-200b/c-3p与目标基因FN1之间以及hsa-miR-200a-3p与目标TGFB2之间负相关,从而支持了已开发知识库的有用性。