中东呼吸综合征（MERS）冠状病毒（MERS-CoV）是一种引起全球公共卫生关注的人畜共患病。单峰骆驼是人畜共患病的传染源。2016年至2018年期间，阿拉伯半岛人类感染共有80个MERS-CoV全长基因组序列，其中所有人畜共患病，但只有30个来自单峰骆驼的序列可用，这突出了对当代单峰骆驼MERS-CoV序列数据的需要。2015年11月至2018年6月期间，从沙特阿拉伯东部省哈萨的屠宰场和骆驼市场综合体屠宰的单峰骆驼采集鼻拭子和直肠拭子标本。
总之，我们的研究表明，在沙特阿拉伯东部的骆驼中，多重谱系的5分支B病毒仍然占主导地位。从苏丹和索马里进口的骆驼也有证据表明MERS-CoV-B系5种病毒在阿拉伯半岛流行，而不是已知在非洲骆驼中存在的C类病毒。这些数据表明，进口骆驼很可能在抵达沙特阿拉伯后获得MERS-CoV病毒，5系病毒具有更大的进化适应能力，似乎比其他病毒谱系更具竞争力，这与最近报道的其他数据一致。我们检测到的MERS-CoV的高比率和病毒系统发育表明，MERS-CoV可能在骆驼市场和屠宰场进行交叉传播，即使是在进口动物中。
