山羊为全球粮食安全和工业做出了重大贡献。它们是埃及和全世界大部分人的肉类和牛奶的主要供应商。布鲁氏菌病是一种人畜共患传染病，在动物生产中造成重大经济损失。使用动物的感染状态作为表型进行病例对照全基因组关联分析（GWAS）。在妊娠最后三分之一期间显示流产，且玫瑰平板试验和血清管凝集试验均呈阳性的被视为病例组。否则，它们被视为对照。所有动物都使用Illumina 65KSNP BeadChip进行了基因分型。此外，使用16S rDNA V4区域的PCR-amplicone测序研究了病例和对照组中阴道和粪便微生物群的多样性和组成。在应用质量控制标准后，GWAS测试有35,818个标记和66个标记。此外，14个基因组区域占所有基因组窗口所解释的变异的0.1%以上。相应的标记位于几个候选基因内或附近，如ARRB1、RELT、ATG16L2、IGSF21、UBR4、ULK1、DCN、MAPB1、NAIP、CD26、IFIH1、NDFIP2、DOK4、MAF、IL2RB、USP18、ARID5A、ZAP70、CNTN5、PIK3AP1、DNTT、BLNK和NHLRC3。这些基因在通过几种生物途径调节感染的免疫反应方面发挥着重要作用。在病例组和对照组中都观察到类似的阴道细菌群落，而各组之间的粪便细菌组成和多样性不同（P < 0.05）。与病例组相比，对照组的粪便确实显示芽孢子门的相对丰度更高（P <0.05），而后者显示更多的Firicutes、Spirochaetota、Planctomycetota和Proteobacteria。对照组确实表现出更高的Rikenellaceae RC9肠道组和Christensenellaceae R-7组（P < 0.05），而感染者确实显示出更高的细菌、Alistipes和Prevotellaceae UCG-003（P <0.05）。这些信息增加了我们对山羊布鲁氏菌易感性遗传学的了解，并可能有助于旨在控制牲畜疾病的繁殖计划和选择计划。
