《PNAS:新研究揭示出5种HIV潜伏促进剂,为功能性治愈HIV奠定基础》

  • 来源专题:生物安全知识资源中心 | 领域情报网
  • 编译者: hujm
  • 发布时间:2021-04-02
  • 在感染人体后,人类免疫缺陷病毒(HIV,俗称艾滋病病毒)会进入一种长时间的不活跃的潜伏状态,在免疫细胞中形成一种潜伏的病毒库。这种潜伏状态可能会持续到基因表达的随机波动(或者说噪音),或者活化细胞因子或抗原的存在会触发这种病毒的重新激活。感染者需要终身服用抗逆转录病毒药物(ART)来控制这种病毒。

    在治疗停止后,潜伏感染的T细胞中的HIV自发重新激活仍然是治愈HIV的主要障碍。重新激活和清除这种潜伏病毒库的疗法仅部分有效,而用于抑制重新激活和稳定化这种潜伏状态的潜伏促进剂(latency-promoting agent, LPA)仍未得到充分研究,它们的作用机制也缺乏多样性。

    在一项新的研究中,来自美国伊利诺伊大学香槟分校的研究人员扩展了以前报道的基于流式细胞仪的HIV LTR启动子药物筛选,并利用自动时间推移荧光显微镜,能够测量最小HIV正向自调节基因回路上的噪声幅度(CV2)和噪声自律半衰期(τ1/2)。他们筛选了能够调控CV2和τ1/2的化合物。接下来,调节噪声的化合物在潜伏感染的全长HIV构建体上用流式细胞仪进行测试,以衡量它们在促进HIV潜伏的潜力。相关研究结果近期发表在PNAS期刊上,论文标题为“Screening for gene expression fluctuations reveals latency-promoting agents of HIV”。

    他们发现了三种LPA,其中的两种已被证明与抑制硫氧还蛋白/硫氧还蛋白还原酶(Trx/TrxR)氧化还原途径有关。然后,他们测试了多种抑制Trx/TrxR途径的化合物,并发现了另外两种LPA候选物。他们总共提出了五种抑制HIV的化合物,从而扩大了供研究界使用的LPA数量。在发现的五种LPA中,有一种获得美国食品药品管理局(FDA)批准,并且可以在市场上买到。

    越来越多的高通量显微镜技术能够捕捉具有精细的时间分辨率的图像,这可能会加快利用基因表达动态变化和τ1/2作为筛选标准,发现针对HIV或其他疾病的药物。CV2和τ1/2代表平均基因表达水平变化的正交轴(图1)。因此,基于单细胞动态变化的噪声药物筛选产生的化合物在研究平均基因表达水平和群体平均值的传统筛选中会被忽略掉。虽然τ1/2无法预测药物是否为LPA,但这种噪声药物筛选仍然将1805种药物缩小到115种噪声调节剂,并大大减少了潜伏逆转实验所需的研究工作。

    这些作者从调查的115种噪声调节剂中发现了3种LPA。在发现的3种LPA中,有两种与抑制Trx/TrxR途径有关:NSC 401005(D75)与已被证明能抑制TrxR的pleurotine在结构上表现出高度的相似性;NSC 400938(D35)已被证明能抑制硫氧还蛋白谷胱甘肽还原酶,即一种在曼氏血吸虫中发现的具有TrxR活性结构域的融合蛋白。这进一步导致了在Trx/TrxR抑制剂家族中又发现了两种LPA:PX12和tiopronin(图3)。

    值得注意的是,并不是所有Trx/TrxR抑制剂都能抑制潜伏HIV的重新激活,但是这些作者在这项研究中提出了一些HIV抑制剂,以促使进一步研究。Trx/TrxR抑制剂在最近的研究中也被提出具有治疗HIV的潜力。就目前而言,发现的LPA是否能在表观遗传学上和在停用ART药物后抑制HIV的表达仍是未知数。除了3种LPA之外,34种噪声调节剂与TNF-α协同发挥作用,促进潜伏的HIV重新激活(图2A)。这些化合物可能扩展了目前已知的用于“激活并杀死(shock and kill)”治疗策略的LRA和LRA-LRA协同剂混合物的数量,但还需开展进一步的研究,以证实它们在原代细胞模型中的功效。此外,作为对照,非噪声调节剂在促进HIV潜伏中表现出活性大幅降低,这表明CV2和τ1/2是适合药物筛选工作的指标,因为在药物筛选工作中,噪声调节剂与LRA协同剂和LPA富集。

    由此可见,这项研究总共发现了5种LPA,即NSC 400938、NSC 401005、NSC 155703和两种属于Trx/TrxR抑制剂的药物,即PX12和tiopronin,以扩大目前的LPA分子库。值得注意的是,NSC 401005显示出与Trx/TrxR抑制剂的结构相似性,NSC 400938显示出与Trx/TrxR抑制剂的功能相似性。NSC 155703已被证明能抑制IL1β的分泌,其中IL1β是一种促炎因子,它的产生已被证明因HIV感染而增强。Trx/TrxR家族中的一些抑制剂,包括tiopronin和auranofin,已获FDA批准并可在市场上买到。它们已被广泛应用,从皮肤护理到抗癌治疗,从而使得对它们进行深入的研究具有吸引力。TrxR抑制剂化合物已被充分研究,而且氧化还原失衡与HIV疾病的进展直接相关。

    此外,氧化应激与HIV感染有关,最近的研究支持靶向Trx/TrxR轴来抑制HIV重新激活的潜力。Trx/TrxR抑制剂在长期ART治疗的患者样本中作为LPA的表现如何还有待观察。尽管较高的预优化治疗浓度导致细胞死亡(图2和3),LPA联合治疗具有进一步降低抑制HIV重新激活所需浓度的潜力(图4)。相对于ART药物的给送和/或停用,“激活并杀死”治疗策略将需要优化治疗浓度、时间选择和持续时间。

    有趣的是,这项研究中所研究的两种Trx/TrxR抑制剂,即PX12和tiopronin,连同NSC 401005和NSC 400938,当与TNF-α一起添加时,在百分比重新激活方面表现出剂量依赖性反应。这些化合物在较低浓度时与TNF-α协同作用,而在较高浓度时则抑制TNF-α重新激活。Trx/TrxR氧化还原途径控制还原的NF-κB和氧化的Tat水平,这两者都影响HIV LTR启动子的转录效率。在Trx与TrxR结合的亲和力高于Tat的假设下,这些作者提出了一个理论模型来解释这种剂量依赖性行为。因此,这些Trx/TrxR氧化还原抑制剂可能为旨在控制潜伏前病毒(provirus)稳定性的HIV研究提供新的目标和机会。

    目前严格抑制HIV表达的主要化合物是dCA(didehydro-Cortistatin A),它通过阻断Tat-TAR相互作用和抑制Tat正反馈发挥作用。虽然ART和dCA的联合使用可以大幅延缓和减少患者样本中ART治疗停用后的病毒反弹,但是已经发现能够在dCA治疗下保持强健表达的抵抗性HIV突变毒株。鉴于这项研究报道的LPA并不具有相同的作用机制,测试这些LPA与dCA联合使用是否能增强抑制作用以进一步改善“激活并杀死”治疗策略将是有趣的。总之,这项研究的发现及其对用于“激活并杀死”治疗策略的化合物的扩展,可能最终为HIV感染者提供有效、安全和可扩展的功能性治愈。

  • 原文来源:https://www.pnas.org/content/118/11/e2012191118
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    • 编译者:hujm
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    • 通常情况下,HIV感染者侵入被称作CD4 T细胞的免疫细胞,并将它们转化为能够产生更多病毒的工厂。但是出于一些神秘的原因,这些被感染细胞中的一小部分(大约每100万个CD4 T细胞中有一个细胞)进入潜伏状态而不会产生病毒。找到这些“潜伏”的HIV感染细胞是极具挑战性的。 这些HIV潜伏感染的免疫细胞在遭受某些导致它们开始产生病毒颗粒的刺激之前,能够潜伏几十年。当前的抗逆转录病毒治疗药物(ART)并不能杀死这些潜伏感染的细胞,也不能阻止它们重新激活。ART最多能够控制这种病毒,但是一旦患者停止服用这些药物,它通常会反弹。 来自美国加州大学旧金山分校格拉斯通研究所的研究人员之前已开发出一种能够追踪实验室克隆的CD4 T细胞内的HIV的设备,从而允许他们详细研究HIV感染的全部过程,包括潜伏阶段。但是,鉴于实验室系统并不一定展现人体内真正发生的事情,加州大学旧金山分校医学副教授Steven A. Yukl博士及其团队着手研究从19名HIV感染者体内获取的细胞。 此前,人们认为潜伏期源于CD4 T细胞无法将HIV DNA转化为病毒RNA。据认为,一些未知的细胞机制阻止了这种DNA到RNA转化过程(被称作转录)的开始,这意味着虽然病毒DNA持续存在,但它从未被翻译成会触发人体免疫系统产生免疫反应的病毒蛋白。 在一项新的研究中,Yukl和他的同事们发现事实并非如此。通过针对HIV病毒RNA的不同片段开展一系列测试(基于一种被称作液滴数字PCR的扩增和定量方法),他们检测到多种HIV病毒RNA片段,这意味着将HIV病毒DNA转化为HIV RNA的过程至少在这些潜伏感染的免疫细胞中就已开始。相关研究结果发表在2018年2月28日的Science Translational Medicine期刊上,论文标题为“HIV latency in isolated patient CD4+ T cells may be due to blocks in HIV transcriptional elongation, completion, and splicing”。 然而,这些RNA片段几乎全部是短的或非全长的,这意味着这种转录过程在不同的感染阶段就已停止。这些被HIV感染的免疫细胞不能制造更长、全长的或经过剪接的病毒RNA,并且这种转录过程从未完成。然而,当研究人员激活这些被感染的T细胞时,这些转录方面存在的问题都遭受逆转了。 Yukl说,“这不是说这些细胞不会制造病毒RNA,而是产生病毒RNA的转录过程没有完成。”他补充道,为了激活这些潜伏感染的免疫细胞,这种完整的病毒转录过程需要发生,但是目前没有任何一种药物能够有效地完成这一过程。“如今,我们能够开始开发让它们完成病毒RNA转录的药物,随后能够让产生的病毒RNA翻译为病毒蛋白以至于人体能够识别并杀死这些被感染的免疫细胞。” 人们已利用各种“潜伏逆转(latency-reversing)”试剂开展实验,不过迄今为止,它们尚未用于临床。在这项新研究中,这些研究人员发现在这些试剂中,没有一种试剂有助这些CD4 T细胞在不同的感染过程中制造病毒RNA,因此,对它们进行组合使用可能是完全激活这些潜伏感染的细胞所必需的。
  • 《Nat Med:开发出靶向HIV病毒库的Dual-CAR-T细胞,为治愈HIV感染奠定基础》

    • 来源专题:生物安全知识资源中心 | 领域情报网
    • 编译者:hujm
    • 发布时间:2020-09-02
    • 在一项新的研究中,来自美国拉根研究所、宾夕法尼亚大学和麻省总医院的研究人员描述了一种新型双CAR-T(Dual CAR T cell, Dual-CAR-T)细胞免疫疗法可以帮助对抗HIV感染。相关研究结果于2020年8月31日在线发表在Nature Medicine期刊上,论文标题为“Dual CD4-based CAR T cells with distinct costimulatory domains mitigate HIV pathogenesis in vivo”。论文通讯作者为拉根研究所的Todd Allen博士和宾夕法尼亚大学佩雷尔曼医学院微生物学教授Jim Riley博士。论文第一作者为宾夕法尼亚大学佩雷尔曼医学院研究生Colby Maldini和拉根研究所研究员Daniel Claiborne博士。 关于受HIV感染的T细胞的扫描电镜图,图片来自NIAID。 Riley说,“这项研究强调了对T细胞改造方式的相对直接的改变如何导致它们的效力和持久性发生巨大变化。这一发现对使用T细胞来对抗HIV和癌症具有重要意义。” 全球HIV流行影响着全世界3500多万人。抗逆转录病毒疗法(ART)是一种日常治疗方法,可以控制但不能治愈HIV感染。然而,对于许多HIV感染者来说,获得和终生坚持每日疗程是一个重大挑战。HIV治愈的一个主要障碍是病毒库,即隐藏在受感染细胞基因组中的HIV拷贝。如果停止ART治疗,这种病毒能够迅速制造新的HIV拷贝,最终导致艾滋病(AIDS)的发生。 CAR-T细胞是一种强大的免疫疗法,目前应用于癌症治疗:将患者自身的免疫T细胞进行基因改造,使之表达嵌合抗原受体(CAR)。所表达的CAR对T细胞进行重编程,使得它们识别和消除特定的患病或感染细胞,如癌细胞或潜在的HIV感染细胞。 Allen和Riley的研究团队共同设计了一种新的HIV特异性CAR-T细胞。他们需要设计的CAR-T细胞能够靶向并快速消除HIV感染的细胞,并且一旦在体内存活和增殖,就能够抵抗HIV本身的感染,这是因为HIV的主要靶标就是这些T细胞。 Allen说,“通过采用循序渐进的方法解决每一个出现的问题,我们开发出受保护的Dual-CAR-T细胞,它能针对HIV感染产生强大、持久的反应,同时对这种病毒本身具有抵抗力。” 作为一种新型的CAR-T细胞,这种Dual-CAR-T细胞是通过对T细胞进行基因改造使得同一个T细胞表达两种CAR。每种CAR都携带一个CD4蛋白,使得它能够靶向HIV感染细胞,而且每种CAR还有一个共刺激结构域,用于向CAR-T细胞发出信号,增加这些T细胞的免疫功能。第一种CAR含有4-1BB共刺激结构域,可刺激细胞增殖和持久性,而第二种CAR具有CD28共刺激结构域,可增加这些T细胞杀伤HIV感染细胞的能力。 由于HIV经常感染T细胞,他们还添加了一种叫做C34-CXCR4的蛋白,这种蛋白是在宾夕法尼亚大学佩雷尔曼医学院血液肿瘤科教授James Hoxie博士的实验室中开发出的。C34-CXCR4可以防止HIV附着在T细胞上,因而也就阻止这种病毒感染它们。最终产生的Dual-CAR-T细胞寿命长,在应对HIV感染时进行复制,有效杀灭被感染的细胞,并对HIV感染形成部分抵抗力。 当将受保护的Dual-CAR-T细胞给送到HIV感染的小鼠体内时,这些研究人员观察到HIV复制速度变得较慢,而且相比于未给送Dual-CAR-T细胞的小鼠,它们具有更少的HIV感染细胞。他们还观察到这些小鼠血液中的HIV病毒数量减少,CD4+T细胞得以保存下来。此外,当他们在HIV感染的小鼠中组合使用Dual-CAR-细胞细胞和ART时,这种病毒被更快地抑制,这就导致HIV病毒库比仅接受ART治疗的小鼠更小。 Allen说,“这些受保护的Dual-CAR-T细胞能够减少各种组织和细胞类型中的HIV载量,包括长寿命的记忆CD4+T细胞。我们认为这会支持使用CAR-T细胞疗法作为一种新的靶向HIV病毒库的工具,以便实现对HIV感染的功能性治愈。”