MicroRNAs (miRNAs)在植物生殖中起重要作用。然而，关于同源四倍体水稻microRNAome分析的研究相当有限。此处在二倍体和多倍体水稻花粉发育时采用高通量测序技术分析microRNAomes。与二倍体水稻相比，同源四倍体水稻中共检测出172种差异表达的miRNAs（DEM），57种miRNAs在同源四倍体水稻中特异性表达。在这172种DEM中，115种miRNAs上调，61种miRNAs下调。上调DEM的靶基因本体分析表明，它们富集在减数分裂前间期的膜运输、减数分裂繁殖和单小孢子阶段的核苷酸结合中。osa-miR5788和osa-miR1432-5p_R+1在减数分裂中上调，它们的靶基因揭示了减数分裂相关基因的相互作用，它们可能参与染色体行为相关的基因调控。在同源四倍体水稻的花粉发育中发现了丰富的与转座因子相关的24 nt siRNA，但是它们在二倍体水稻中的含量明显下降，这表明24 nt siRNA在花粉发育中可能发挥作用。对于多倍体在花粉发育中对小分子RNA表达模式的影响并导致同源四倍体水稻花粉不育，这些发现提供了认识的基础。
