随着世界第六次大规模灭绝的继续，大型动物的消失对生物多样性和生态系统进程产生了广泛的影响。在草原、沼泽、森林和珊瑚礁等完全不同的系统中进行的研究表明，即使在微生物的范围内，群落消失的影响也很明显，会影响微生物群落、微生物驱动过程和宿主与微生物的相互作用。基础物种的微生物群落，如珊瑚、树木和草类，似乎特别容易失去大量的消耗者，这往往导致疾病、死亡和生态系统的变迁。我们使用级联的消耗者-猎物交互的概念，以及消费者在生态系统中自下而上的角色，来概述未来的研究如何填补该领域的空白。例如，消耗者的多样性和体型大小影响营养级联的强度，并可能决定了群落消失如何影响微生物群落。最后，我们认为，大型生物和微生物之间的联系可能很常见，但没有得到充分的重视，因为失去大量消耗者的影响会扩散到整个生态系统。
