《根据SARS-CoV免疫学研究,初步鉴定了COVID-19冠状病毒(SARS-CoV-2)的潜在疫苗靶标》

  • 来源专题:中国科学院病毒学领域知识资源中心
  • 编译者: malili
  • 发布时间:2020-03-09
  • 2020年初开始出现2019年新型冠状病毒(2019-nCoV)爆发。自从在中国武汉市首次报告该病例以来,2019-nCoV已传播到中国其他城市以及四大洲的多个国家。迫切需要更好地了解这种新型病毒并开发控制其传播的方法。考虑到2019-nCoV与严重急性呼吸系统综合症冠状病毒(SARS-CoV)之间的高度遗传相似性,并利用SARS-CoV的现有免疫学研究,香港科技大学的研究人员探索了针对2019-nCoV的疫苗设计。通过在SARS-CoV免疫原性结构蛋白中筛选实验所确定的SARS-CoV来源B细胞和T细胞表位,研究人员鉴定了一组来自突刺(S)和核衣壳(N)(这些蛋白与2019-nCoV蛋白相似)的B细胞和T细胞表位。由于在可用的2019-nCoV序列中(截至2020年1月29日)未在这些已确定的表位中观察到突变,因此这些表位的免疫靶向可能会提供针对2019-nCoV的保护作用。对于T细胞表位,研究人员对相关的MHC等位基因进行了人群覆盖率分析,并提出了一组表位,据估计这些表位将在全球以及中国提供广泛的覆盖范围。这项发现提供了一组筛选表位,可帮助指导针对开发靶向2019-nCoV疫苗的实验工作。

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    • 编译者:hujm
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    • bioRxiv预印平台于3月23日发表了密西根大学的题为“COVID-19 coronavirus vaccine design using reverse vaccinology and machine learning”的文章。 文章显示,为了最终与正在出现的COVID-19大流行作斗争,需要开发一种有效且安全的疫苗,以应对由SARS-CoV-2冠状病毒引起的这种高度传染性疾病。该团队经过文献和临床试验调查表明,整个病毒以及刺突(S)蛋白,核衣壳(N)蛋白和膜(M)蛋白均已针对SARS和MERS疫苗开发进行了测试。但是,这些候选疫苗可能缺乏诱导完全保护的功能,并且存在安全隐患。然后,该团队应用了Vaxign反向疫苗学工具和新开发的Vaxign-ML机器学习工具来预测COVID-19候选疫苗。通过研究SARS-CoV-2的整个蛋白质组,预测包括S蛋白和5个非结构蛋白(nsp3、3CL-pro和nsp8-10)在内的6种蛋白是粘附素,它们对病毒的粘附和宿主入侵至关重要。Vaxign-ML还预测了S,nsp3和nsp8蛋白会诱导高保护性抗原性。除了常用的S蛋白外,nsp3蛋白还没有在任何冠状病毒疫苗研究中进行过测试,因此被选择作进一步研究。研究人员发现nsp3在SARS-CoV-2,SARS-CoV和MERS-CoV中比在15种感染人类和其他动物的冠状病毒中更保守。还预测该蛋白质包含混杂的MHC-I和MHC-II T细胞表位,以及位于该蛋白特定位置和功能域中的线性B细胞表位。通过应用反向疫苗学和机器学习,该团队预测了有效和安全的COVID-19疫苗开发的潜在疫苗目标。 然后,提出包含结构蛋白(Sp)和非结构蛋白(Nsp)的“ Sp / Nsp鸡尾酒疫苗”将刺激有效的互补免疫应答。 *注,本文为预印本论文手稿,是未经同行评审的初步报告,其观点仅供科研同行交流,并不是结论性内容,请使用者谨慎使用。