《中国科学院海洋研究所在建立深海环境影响评估标准化实验流程体系方面取得系列进展》

  • 来源专题:中国科学院文献情报系统—海洋科技情报网
  • 编译者: 熊萍
  • 发布时间:2024-10-14
  • 在全球变化和人类活动日益加剧的背景下,深海作为地球上最后的未知领域,其生态系统的保护与合理利用显得尤为重要。中国科学院海洋研究所深海研究中心李超伦团队通过自主研发的深海大型生物常压培养平台、高压培养平台和原位实验平台,在建立深海环境影响评估标准化实验流程体系方面以及解析全球变化和人类活动对深海生物的双重影响方面取得了一系列进展,相关成果国际学术期刊Journal of Hazardous Materials和Science of The Total Environment等发表。

    在深海生物对重金属响应研究方面:多金属硫化物是深海化能生态系统重要的伴生矿产,理解其开发导致的重金属释放对于深海生物群落具有何种影响是深海资源可持续开采的重要保障。团队率先开展深海原位实验,探讨深海生物如何响应重金属释放,评估其毒理学效应,并构建生态环境评价的关键指标和方法体系。研究结果表明,生物在深海原位环境对重金属具有更高的敏感性,揭示了利用深海原位实验平台开展毒理评价的必要性。此外,团队还利用深海大型生物常压培养平台,开展了深海贻贝在矿区常见金属铜的暴露实验,深入阐明了深海贻贝在铜胁迫下的响应策略。结果显示,铜胁迫会显著影响深海贻贝的免疫功能、细胞凋亡和信号转导过程,并影响其碳水化合物代谢、无氧代谢、氨基酸代谢和脂质代谢过程。利用多组学联用方法,挖掘出多个关键基因和代谢物,这些基因和代谢物有望作为评估深海开采对生物影响的关键标志物,为评估深海采矿活动对深海生物的影响提供了新的见解。

    在静水压对贻贝的影响研究方面:贻贝科物种具有广泛的深度分布范围,是深海化能生态系统和近海潮间带生态系统的代表性物种,同时也是探讨静水压力对生物分布影响的重要模式类群。为了研究不同深度分布的贻贝科物种对压力环境变化的响应机制,团队利用自主研发的高压实验平台,对比了深海贻贝和浅水贻贝在不同静水压(1 个大气压 和 110 个大气压)下的基因表达变化。结果表明,面对压力变化,深海贻贝主要通过调节脂质代谢基因来响应压力变化,而浅水贻贝则通过下调与免疫相关的基因功能进行应对。这项研究揭示了两种贻贝在应对高压时的不同适应策略。

    以上深海实验平台的搭建和应用为揭示深海生物的极端环境适应机制提供了重要支撑,研究成果不仅丰富了对深海生物在不同环境压力下生理响应的理解,也为深海资源的可持续开发和环境保护提供了科学依据。

    相关文献:

    1. Zhou L#, Lian C#, He Y#, Chi X, Chen H, Zhong Z, Wang M, Cao L, Wang H, Zhang H, Li C*. Toxicology assessment of deep-sea mining impacts on Gigantidas platifrons: A comparative in situ and laboratory metal exposure study. Science of The Total Environment. 2024 Jul 10;933:173184.

    2. He Y#, Zhou L#*, Wang M, Zhong Z, Chen H, Lian C, Zhang H, Wang H, Cao L, Li C*. Integrated transcriptomic and metabolomic approaches reveal molecular response and potential biomarkers of the deep-sea mussel Gigantidas platifrons to copper exposure. Journal of Hazardous Materials. 2024 Jul 15;473:134612.

    3. Zhong Z#, Guo Y, Zhou L, Chen H, Lian C,Wang H, Zhang H, Cao L, Sun Y, Wang M*,? Li C* Transcriptomic responses and evolutionary insights of deep-sea and shallow-water mussels under high hydrostatic pressure condition. Science of The Total Environment. (Accepted on 2024 Jul 30).



  • 原文来源:https://qdio.cas.cn/2019Ver/News/kyjz/202409/t20240918_7365721.html
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    • 发布时间:2024-01-28
    • 我国海洋药物与生物制品产业拥有全球最丰富的原料基础,是海洋新兴产业中最具发展潜力的领域之一,但仍然存在低端产品占比高、加工工艺落后、新兴市场培育缓慢、低价出口高价转内销等普遍问题。标准体系不健全是制约我国海洋药物和生物制品产业发展的主要瓶颈。 针对微藻和海岸带生物活性物质产业中存在的加工工艺不规范、产品质量不稳定、产品质量等级区分度不够等瓶颈问题,以规模化培养经济微藻(螺旋藻、雨生红球藻和小球藻)和典型海岸带生物活性物质(胶原蛋白、壳聚糖和藻蓝蛋白)为对象,聚焦食品安全和质量控制两方面,中国科学院烟台海岸带研究所秦松团队组织研究所优势科研力量,以及联合中国标准研究院、中国藻业协会微藻分会和青岛微藻产业学会制定并实施5项国家标准和5项团体标准,并有系列各类标准正在推进中。 螺旋藻是我国微藻产业中养殖规模与生物量最大的种类,目前年产约1.5万吨生物质(干品),具有良好的市场基础。针对螺旋藻粉的质量保障与分级,修订了1项国家标准《食用螺旋藻粉质量通则》,并制定了1项团体标准《食用螺旋藻粉分级标准》;针对螺旋藻规模化培养的重金属防控问题,制定了2项团体标准《螺旋藻养殖过程中重金属防控技术规范》和《螺旋藻养殖技术规范》;针对鲜食螺旋藻新型产品的开发,制定了1项团体标准《鲜食螺旋藻》;针对螺旋藻典型活性成分(藻蓝)制备及产品开发,制定了1项国家标准《食品添加剂藻蓝》和1项团体标准《螺旋藻藻蓝蛋白制备技术规范》;针对我国螺旋藻规模化养殖存在的品种混杂不清的问题,正在进行1项国家标准《螺旋藻种质资源鉴定评价技术规范》的制定。 雨生红球藻在我国微藻产业中经济价值最高的种类,目前年产约600吨生物质(干品),是生产天然虾青素这一活性物质的主要原料,具有旺盛的市场需求。针对虾青素检测方法存在缺陷的问题,制定了1项国家标准《虾青素旋光异构体含量的测定液相色谱法》;针对雨生红球藻粉质量分级事宜,一方面积极参与1项国家标准《雨生红球藻粉》的修订,同时针对其存在的缺陷,开展了1项团体标准《雨生红球藻粉分级》的制定工作。 小球藻是我国微藻产业规模化养殖的典型代表,目前年产约2000吨生物质(干品),具有良好的市场基础,蛋白核小球藻已被加入我国新资源食品目录。针对普通小球藻和蛋白核小球藻名称问题,组织产学研联合小组多次研讨名称修改问题,与全国发酵食品标准化中心合作,正在开展1项行业标准《食用发酵微藻第1部分:蛋白核小球藻》制定工作。 胶原蛋白是生物中含量最丰富、分布最广泛的蛋白质种类之一,以其优良的生物相容性,和促进机体细胞生长、迁移和增生的特性而被广泛应用于生物医用材料、医学组织工程和医学美容领域。针对胶原三股螺旋完整性构象的检测方法普遍存在局限性问题,制定了1项国家标准《动物源性I型胶原蛋白成分测定聚丙烯酷胺凝胶电泳法》。 壳聚糖是除纤维素外,自然界含量最大的天然有机高分子化合物,在自然界中广泛存在于昆虫壳、虾蟹壳、软体动物的骨骼以及真菌的细胞壁中。针对壳聚糖检测精度不高、设备要求严格和成本较高等问题,制定了1项国家标准《壳聚糖含量测定高效液相色谱法》。 通过上述标准体系建设系列成果初步形成了海岸带特色生物产业的标准体系,从而为海洋生物医药与生物制品传统产业转型升级和新兴产业的培育提供了有力支撑。 相关标准信息如下: (1)国家标准:《食品添加剂藻蓝》,GB 1886.309-2020; (2)国家标准:《虾青素旋光异构体含量的测定液相色谱法》,GB/T 38478-2021; (3)国家标准:《动物源性I型胶原蛋白成分测定聚丙烯酷胺凝胶电泳法》,GB/T 38482-2021; (4)国家标准:《壳聚糖含量测定高效液相色谱法》,GB/T 38479-2021; (5)国家标准:《食用螺旋藻粉质量通则》,GB/T 16919-2022; (6)团体标准:《螺旋藻养殖技术规范》,T/CAIAS 001-2023; (7)团体标准:《鲜食螺旋藻》,T/QMIS 002-2022; (8)团体标准:《食用螺旋藻粉分级标准》,T/QMIS 005-2023; (9)团体标准:《螺旋藻养殖过程中重金属防控技术规范》,T/QMIS 006-2023; (10)团体标准:《螺旋藻藻蓝蛋白制备技术规范》,T/QMIS 008-2023。
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    • 中国科学院海洋研究所贝类研发团队承担的中国科学院战略性先导科技专项 “美丽中国生态文明建设科技工程”——“服务于‘美丽海洋’的生物调控技术与示范”子课题,在牡蛎适应性机制解析及抗性提升技术研发领域取得了阶段性新进展,相关成果近期发表于环境科学领域期刊Science of the Total Environment、Marine biotechnology等。 在全球气候变化加剧和极端天气频发的背景下,海洋生物面临着严峻的生存考验。在海洋生物资源保护与利用领域,生物适应潜力预测与适应性提升一直是学术界和产业界共同关注的热点问题。潮间带海域是海洋与陆地的交汇区,受来自海洋、陆地和大气中多种环境因素以及人类活动的直接与间接影响,其环境具有高变异性;牡蛎作为经济与生态价值兼备的潮间带优势种,与潮间带环境共同构成了研究海洋生物与环境互作效应的理想研究体系。 人们经常会关注到,潮间带牡蛎的体型比潮下带牡蛎要小很多,与市场售卖的养殖牡蛎相比,形态更是千差万别。其实这些外型截然不同的牡蛎很可能是一个物种,造成这种差异的原因主要是牡蛎所处的环境不同。科学家把这种同一基因型的个体在不同环境中表现出不同表型的现象称之为表型可塑性,这是包括牡蛎在内的海洋生物重要适应机制。 海洋所贝类研发团队以“牡蛎-潮间带环境”为研究体系,经过系统的比较检测发现,潮间带牡蛎与潮下带牡蛎不仅在生长指标、营养物质组成和含量上不同,其对高温、干露等胁迫环境的抗性也存在显著差异,特别是在高温条件下,潮间带牡蛎要比潮下带牡蛎具有更强的响应弹性和抗性。研究团队对潮间带牡蛎与潮下带牡蛎进行了基因组结构变异的检测,结果并未发现两者基因组结构有明显差异,表明潮间带与潮下带牡蛎的表型差异主要来源于环境引起的表型可塑性;继续研究发现,以DNA甲基化为代表的表观遗传修饰是介导这一表型可塑性的重要机制。在此基础上,团队成员进一步探究了潮间带环境对牡蛎后代的影响,解析了跨代可塑性(transgenerational plasticity)介导的“环境记忆”是否存在及其内在分子机制问题,并基于环境调控进行了适应性提升技术的研发与应用。 研究人员对野生潮下带和潮间带牡蛎群体进行了连续两代的人工繁育得到F1和F2代并于潮下带环境中同质养殖。对这三代牡蛎进行比较研究发现,在能量代谢状态和机体抗氧化能力相关表型中,三代潮间带牡蛎群体均与潮下带牡蛎群体存在显著差异;在高温条件下,三代潮间带牡蛎表现出相似的高温反应范式,其应激响应模式与潮下带牡蛎存在差异,即潮间带环境诱导的抗性相关表型的跨代可塑性是存在的。DNA甲基化测序结果显示,三代潮间带牡蛎群体均与潮下带牡蛎存在基因组甲基化分化,在亲本潮间带潮下带甲基化差异基因中,有43%(1655个)可连续遗传至F2;在高温应激实验中,有14%(320个)的高温响应基因能从亲本连续遗传两代,后续也通过抑制基因组DNA甲基化的方法反向证实了甲基化在调控高温适应中发挥积极作用。总之,潮间带环境诱导的适应性相关的表型可塑性可至少遗传两代,且DNA甲基化是介导跨代可塑性的重要机制。 相关成果首次从表观遗传学的角度揭示了牡蛎环境诱导性表型变异的跨代遗传现象及其机制,不仅为海洋生物适应性性状的形成和适应潜力的预测提供了新见解,丰富了海洋生物适应性理论,更为基于环境调控提升牡蛎适应性的相关技术研发提供了新的思路。基于该原理,研究团队已申报了多件牡蛎适应性提升技术与牡蛎礁构建相关的专利,并在牡蛎修复性养殖与牡蛎礁生态系统重构中获得应用。 中国科学院海洋所博士后王新星为文章第一作者,李莉研究员为通讯作者。本研究除得到中国科学院战略性先导科技专项支持外,还得到了国家贝类产业技术体系等项目的共同资助。 相关论文: [1] Wang Xinxing; Cong Rihao; Li Ao; Wang Wei; Zhang Guofan; Li Li; Transgenerational effects of intertidal environment on physiological phenotypes and DNA methylation in Pacific oysters, Science of The Total Environment, 2023. https://doi.org/10.1016/j.scitotenv.2023.162112     [2] Wang Xinxing; Cong Rihao; Li Ao; Wang Wei; Zhang Guofan; Li Li; Experimental DNA demethylation reduces expression plasticity and thermal tolerance in Pacific oysters. Marine biotechnology. 2023.  https://doi.org/10.1007/s10126-023-10208-5     [3] Wang Xinxing; Li Ao; Wang Wei; Zhang Guofan; Li Li; Direct and heritable effects of natural tidal environments on DNA methylation in Pacific oysters (Crassostrea gigas), Environmental Research, 2021.  https://doi.org/10.1016/j.envres.2021.111058     [4] Wang Xinxing; Li Ao; Wang Wei; Que Huayong; Zhang Guofan; Li Li; DNA methylation mediates differentiation in thermal responses of Pacific oyster (Crassostrea gigas) derived from different tidal levels, Heredity, 2021.  https://doi.org/10.1038/s41437-020-0351-7