《中国科学院烟台海岸带研究所在环境胁迫荧光探针研究中取得系统性进展》

  • 来源专题:中国科学院文献情报系统—海洋科技情报网
  • 编译者: liguiju
  • 发布时间:2022-03-11
  • 近日,中国科学院烟台海岸带研究所陈令新研究员团队在环境期刊Journal of Hazardous Materials上发表了题为“用于检测环境胁迫下生物分子变化的荧光探针”(Fluorescent probes for biomolecule detection under environmental stress, Journal of Hazardous Materials, 2022, 431, 128527)的观点论文。基于自身的研究探索和积累,结合国内外的发展现状及趋势,该文首次、全面总结了用于检测环境胁迫下活性分子浓度变化的荧光探针(图1),文章插图22幅,涉及大约110余种荧光探针;有利于促进荧光探针在环境科学等领域的进一步发展和有效应用,丰富环境成像研究的科学内涵。

    近年来,荧光探针在可视化实时动态检测各种生物分子的浓度变化和迁移方面取得了蓬勃发展。环境因素影响着生物活性分子在有机体的各生命过程中的分布和浓度变化。该文介绍了荧光探针的设计策略以及其应用于不同环境刺激下(例如:缺氧胁迫、缺血再灌注过程、高温/低温刺激、有机/无机化学品暴露、氧化/还原压力胁迫、高血糖刺激和药物治疗引起的毒性等)的活性分子(主要包括:活性氧物种、活性氮物种、活性硫物种、活性硒物种、金属离子以及酶等)的体内外检测。生物体生存受各种环境因素,包括非生物因素(例如:温度、盐度、光照、pH以及氧气浓度)和生物因素(例如:细菌、病毒感染等)的影响。外界环境因素改变造成的胁迫,会传递给有机体,细胞膜上受体接收到刺激信号,从而触发第二信使的产生和传递,其中包括具有不同生理特性的各种生物活性分子(例如:气体、自由基、离子、核苷酸、脂质和脂质衍生物等)。监测环境胁迫下细胞应激反应过程中生物(活性)分子水平的变化对于分子机制的研究、分子靶向治疗的发展和药物的发现提供巨大的潜力,并最终有利于揭示环境、健康和疾病之间的关系。

    针对典型环境因素胁迫下,生物内源活性物种变化的分析监测难题,陈令新研究员团队注重设计合成新型荧光探针,在细胞、组织和活体水平上,实现典型环境胁迫下生物内源活性分子的原位、实时、可视化分析监测。力图阐明典型污染物在生命体内的分布、转运以及与内源物种相互作用的规律,为解决“污染与健康”的深层次问题、及为探明环境胁迫下细胞信号转导和生理功能通路等提供强有力的理论和技术支撑。相关工作已在Chemical Society Reviews, Analytical Chemistry, Advanced Functional Materials, Biomaterials, Chemical Communications, Chemical Science, Journal of Hazardous Materials等期刊发表论文80余篇,授权发明专利10余项。

    原文链接见:https://doi.org/10.1016/j.jhazmat.2022.128527

  • 原文来源:http://www.yic.cas.cn/ky/kydt/202203/t20220309_6386824.html
相关报告
  • 《中国科学院烟台海岸带研究所在大气沉降对近海水体碳和营养盐循环影响方面取得系列研究进展》

    • 来源专题:中国科学院文献情报系统—海洋科技情报网
    • 编译者:liguiju
    • 发布时间:2023-05-04
    • 大气沉降是海洋生态系统中碳和营养盐等生源要素的主要来源之一,对海洋生物地球化学循环过程具有显著影响。中国科学院烟台海岸带研究所环境灾害监测评估团队以山东半岛北部养马岛海域为代表性研究区域,在大气沉降对近海水体碳和营养盐循环影响研究中取得系列重要进展。该海区是北黄海重要的扇贝养殖区,近年来在全球变暖大背景以及区域性人类活动的影响下,该海域夏季水体缺氧和酸化现象频发,妨碍了扇贝养殖产业的健康发展。研究团队基于对大气总悬浮颗粒物(TSP)及降水样品中碳和营养盐的分析,报道了养马岛附近海域大气颗粒物中水可溶性有机质、营养盐和颗粒有机质及降水中溶解有机质、营养盐和颗粒有机质的季节变化规律,量化了大气干湿沉降输入的有机碳和营养盐对于该海域海水中碳收支的贡献,证实了大气干湿沉降过程是该海域海水中碳的重要来源,探讨了大气沉降过程与区域海水体碳循环和夏季水体低氧现象之间的联系,有助于深入认识大气干湿沉降输入对近海生态系统的综合影响。相关成果相继在Science of the Total Environment和Marine Pollution Bulletin发表论文6篇。 结果表明,干沉降输入的颗粒有机碳(POC)年通量约为水可溶性有机碳(WSOC)的4.1倍;对于湿沉降,POC的年通量约为溶解有机碳(DOC)的46.7%;因此,大气中的POC主要通过干沉降过程输入到海水中,其贡献为71.1%,而水可溶性有机碳和溶解有机碳的情况则相反;如果将大气沉降对海水中有机碳的间接输入也考虑在内,即干湿沉降的养分输入所支持的新生产力贡献的有机碳,大气沉积对研究海域的总有机碳输入达12.0 gC/m2/a,表明大气沉降在近海生态系统碳循环中具有重要作用(Xie et al., STOTEN 2023, 876: 162715)。不同季节TSP中总有机碳(TOC)的来源组成具有显著差异,而总氮(TN)在不同季节具有相似的来源组成;生物质源为TSP和TN的主要来源,其贡献分别为55.5±10.8%和57.3±11.7%;化石燃料燃烧是TOC主要来源,其贡献为47.7±3.4%;春季、夏季和秋季大气沉降对于表层海水悬浮颗粒物(SPM)的贡献分别为17.2±6.7%、10.2±2.0%和18.0±11.0%,表明大气TSP是表层海水SPM的重要来源之一;对于表层海水中的POC而言,春季、夏季和秋季大气沉降的贡献分别为35.2±3.5%、19.2±7.4%和25.5±7.9%,证实大气沉降过程对于近海颗粒碳循环具有重要的影响(Xie et al., STOTEN 2023, 854: 158540)。 TSP中WSOC、有色溶解性有机质(CDOM)和荧光溶解性有机质(FDOM)的含量在冬春季要明显高于夏秋季,主要与不同季节WSOM的来源差异及大气老化过程有关;WSOC的年干沉降通量可以将表层海水的DOC浓度提高10.2 μmol/L,从而对于维持表层水体的次级生产力有重要贡献,在一定程度上影响了研究海域内的碳循环过程;此外,由干沉降进入表层海水的WSOC中生物可利用部分在好氧分解的条件下可导致水体溶解氧(DO)浓度降低~4.8 μmol/L(Xie et al., STOTEN 2022, 818: 151772)。秋季湿沉降中DOC的浓度显著高于其他季节,而冬季湿沉降中有色溶解有机质(CDOM)及类腐殖质组分的荧光溶解有机质(FDOM)浓度最高,主要与不同季节溶解有机质的来源差异及降水的稀释效应有关;通过湿沉降过程向该海域输入的DOC通量为6.31×108 gC/a,约占研究海域海水中DOC储量的4.0%;单次降水事件可使该海域表层水体中生物可利用性DOC的浓度提高0.57±0.54 μmol/L,占异养细菌次级生产每日所需有机碳的12.1±11.4%;5月至8月期间,湿沉降输入的DOC中生物可利用性部分在好氧分解条件下可使表层海水DO浓度降低5.3-8.5 μmol/L/month(Xie et al., STOTEN 2022, 844: 157130)。 降水中营养盐N和Si的浓度在秋季较高、夏季较低,而P的浓度在冬季和春季较高,溶解无机氮(DIN)的湿沉降通量为69.2 mmol/m2/a,占水体DIN外源输入通量的比例为34.4%;大气湿沉降中N/P比显著高于海水中N/P比及Redfield比值,可能会加剧水体中溶解态无机氮磷比的不平衡,促进海水中浮游植物优势种群由硅藻向甲藻的转变,从而不利于区域内海湾扇贝的生长;受强降水过程的影响,夏季DIN和水溶性有机氮(DON)的湿沉降通量高达30.1和4.98 mmol/m2,可支持水体19.3%的新生产力,该部分新生产力占区域内扇贝所摄食颗粒有机碳总量的比例为16.4%(Xie et al., MPB 2022, 182: 114036)。人为活动是TSP中水可溶性无机氮和有机氮(WSDIN和WSDON)的主要来源,沙尘是水可溶性无机磷(WSDIP)和硅酸盐(WSDSi)的主要来源,而水可溶性有机磷(WSDOP)可能来源于海洋生物活动;WSDIN、WSDON、WSDIP、WSDOP和WSDSi的大气干沉降通量分别为21.8、2.7、0.10、0.30和0.73 mmol/m2/a;总体而言,冬季通过大气干沉降获得的生物可利用氮支持的海水新生产力达9.14 mgC/m2/d;大气干沉降输入的DIN/DIP摩尔比的年平均值为216±123(Xie et al., MPB 2021, 172: 112866)。 上述论文为中国科学院战略性先导科技专项(A类)“‘美丽中国’生态文明科技工程专项”子课题“海洋生态环境灾害综合防控技术与示范”(XDA23050303)的研究成果之一,由烟台海岸带所2020级博士研究生谢磊为第一作者,高学鲁研究员为通讯作者。 相关论文详情: 1. Xie, L., Gao, X.*, Liu, Y., Zhao, J., Xing, Q., 2023. The joint effects of atmospheric dry and wet deposition on organic carbon cycling in a mariculture area in North China. Science of the Total Environment, 876: 162715. https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0048969723013311 2. Xie, L., Gao, X.*, Liu, Y., Yang, B., Yuan, H., Li, X., Song, J., Zhao, J., Xing, Q., 2023. Atmospheric deposition as a direct source of particulate organic carbon in region coastal surface seawater: Evidence from stable carbon and nitrogen isotope analysis. Science of the Total Environment, 854: 158540. https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S004896972205639X 3. Xie, L., Gao, X.*, Liu, Y., Yang, B., Wang, B., Zhao, J., Xing, Q., 2022. Biogeochemical properties and fate of dissolved organic matter in wet deposition: Insights from a mariculture area in North Yellow Sea. Science of the Total Environment, 844: 157130. https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0048969722042279 4. Xie, L., Gao, X.*, Liu, Y., Yang, B., Lv, X., Zhao, J., Xing, Q., 2022. Atmospheric dry deposition of water-soluble organic matter: An underestimated carbon source to the coastal waters in North China. Science of the Total Environment, 818: 151772. https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0048969721068480 5. Xie, L., Gao, X.*, Liu, Y., Yang, B., Wang, B., Zhao, J., Xing, Q., 2022. Atmospheric wet deposition serves as an important nutrient supply for coastal ecosystems and fishery resources: Insights from a mariculture area in North China. Marine Pollution Bulletin, 182: 114036. https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0025326X22007184 6. Xie, L., Gao, X.*, Liu, Y., Yang, B., Lv, X., Zhao, J., 2021. Perpetual atmospheric dry deposition exacerbates the unbalance of dissolved inorganic nitrogen and phosphorus in coastal waters: A case study on a mariculture site in North China. Marine Pollution Bulletin, 172: 112866. https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0025326X21009000
  • 《中国科学院烟台海岸带研究所在贝类寿命研究中取得进展》

    • 来源专题:中国科学院文献情报系统—海洋科技情报网
    • 编译者:liguiju
    • 发布时间:2022-10-18
    • 抗衰老机制一直是生命科学前沿热点问题,这个问题在人类和陆生模式生物中已进行了较为深入广泛的研究,但是鲜有关于海洋无脊椎动物寿命决定机制的研究报道。紫扇贝和海湾扇贝同为Argopecten属扇贝,但在长期进化的过程中演化出截然不同的寿命。海湾扇贝的寿命一般不超过14个月,而紫扇贝的寿命可长达7-10年,海湾扇贝与紫扇贝的种间杂交一代寿命比海湾扇贝显著延长,且表现出极其显著的生长优势,因此紫扇贝和海湾扇贝是研究自然条件下海洋动物寿命决定机制的理想模型。中国科学院烟台海岸带研究所王春德研究团队利用生物信息学和分子生物学技术开展系统研究,首次揭示了IIS通路核心基因的遗传变异在两种扇贝寿命决定中的重要作用。相关研究成果分别发表于Aquaculture和Frontiers in Physiology。 胰岛素/IGF-1信号(IIS)通路是陆生模式生物调控其衰老和寿命的保守途径,其中FoxO和PTEN作为重要调节器在该通路中起着关键的调控作用。团队利用前期完成的紫扇贝和海湾扇贝的高质量基因组,通过生物信息学分析发现FoxO和PTEN在进化过程中受到了选择,PTEN的特征基序HCxxGxxR邻近位点和FoxO蛋白邻近AKT磷酸化位点的氨基酸发生了变异。此外,两种扇贝的FoxO在转录激活结构域附近发生了变异,可能会导致不同的FoxO转录活性。因此,推测这些关键位点的变异可能导致FoxO和PTEN活性的改变。在陆生模式生物中,营养限制可导致IIS通路活性被抑制,提高FoxO和PTEN的活性,从而延长寿命。团队发现,营养限制导致两种扇贝的FoxO和PTEN表达均显著上调,但海湾扇贝对营养限制响应速度更快、幅度更大。电离辐射刺激后,紫扇贝的死亡率显著低于海湾扇贝,表现出更强的抗损伤和修复能力。辐照后FoxO的表达量在紫扇贝闭壳肌中显著升高,而在海湾扇贝中显著降低;PTEN的表达量在紫扇贝闭壳肌中显著升高,而在海湾扇贝中则无显著变化。敲降FoxO和PTEN基因的表达后,抗氧化酶SOD和CAT基因的表达量显著降低,同时老化标志酶β-半乳糖苷酶活性显著升高。这些研究结果表明,IIS通路的核心基因FoxO和PTEN可通过营养感受、DNA损伤修复、抗氧化等作用实现代谢保护、基因组稳定性维持以及有害自由基消除,从而证明IIS通路关键基因的遗传变异在海湾扇贝和紫扇贝的寿命决定中发挥重要作用。研究结果将为动物寿命决定机制的研究提供新思路,提升对动物衰老和寿命决定机制理论的认知,同时可为培育长寿命杂交扇贝提供理论基础,具有较高的理论意义和应用价值。 该研究获得国家自然科学基金、山东省农业良种工程项目、山东省贝类产业技术体系和烟台市科技计划项目的支持。中国科学院烟台海岸带研究所王媛(博士研究生)和许瀚之分别为两篇论文的第一作者,卢霞副研究员为两篇论文的通讯作者。 论文信息:Yuan Wang, Xia Lu*, Chunde Wang, Junhao Ning, Min Chen, Ke Yuan, 2022. Potential roles of FoxO in promoting longevity in larger Argopecten scallops. Aquaculture, 561: 738690. DOI: 10.1016/j.aquaculture.2022.738690. Hanzhi Xu, Xia Lu *, Chunde Wang, Junhao Ning, Min Chen, Yuan Wang, Ke Yuan, 2022. Potential roles of PTEN on longevity in two closely related Argopecten scallops with distinct lifespans. Frontiers in Physiology, 1386. DOI: 10.3389/fphys.2022.872562 论文链接: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0044848622008079 https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fphys.2022.872562/full?utm_source=dlvr.it&utm_medium=twitter