《9月18日_废水中SARS-CoV-2 RNA检测可追踪社区感染动态》

  • 来源专题:COVID-19科研动态监测
  • 编译者: zhangmin
  • 发布时间:2020-10-13
  • Nature Biotechnology于9月18日发布了耶鲁大学、康涅狄格州农业试验站的通讯文章“Measurement of SARS-CoV-2 RNA in wastewater tracks community infection dynamics”。该研究团队在春季COVID-19暴发期间,测量了美国康涅狄格州纽黑文市都会区主要污水污泥中的SARS-CoV-2 RNA浓度。研究人员在超过10周的研究中检测了SARS-CoV-2 RNA,并且对时滞进行调整后,追踪了SARS-CoV-2临床检测结果和当地COVID-19入院病例的上升和下降。相对于这些指标,按照标本采集日期,污泥中检测到SARS-CoV-2 RNA比SARS-CoV-2临床阳性检测结果提前0至2 天,比阳性检测百分比提前0至2天;按报告日期,污泥中检测到SARS-CoV-2 RNA比入院时间提前1至4天,比SARS-CoV-2临床阳性检测结果提前6至8天。文章称,该数据显示,监测在市政污水中的病毒性RNA对于在整个人群中监测SARS-CoV-2感染的实效性。在样本采集和测试结果报告之间存在延迟的社区中,立即产生的废水结果可以提前告知感染动态。
    原文链接:https://www.nature.com/articles/s41587-020-0684-z

  • 原文来源:https://www.nature.com/articles/s41587-020-0684-z
相关报告
  • 《5月26日_FFPE样本中SARS-CoV-2感染的分子检测及SARS-CoV-2致命病例的组织病理学发现》

    • 来源专题:COVID-19科研动态监测
    • 编译者:zhangmin
    • 发布时间:2020-05-27
    • 1.时间:2020年5月26日 2.机构或团队:克利夫兰州立大学医学中心、凯斯西储大学医学院 3.事件概要: 5月26日,AJCP期刊发表了来自克利夫兰州立大学医学中心,凯斯西储大学医学院研究团队的题为“Molecular Detection of SARS-CoV-2 Infection in FFPE Samples and Histopathologic Findings in Fatal SARS-CoV-2 Cases”的文章。报告了2例SARS-CoV-2阳性个体的尸检方法和发现。 该文章指出,验尸检查是按照美国疾病预防控制中心的公共指南完成的。通过定量逆转录聚合酶链反应(qRT-PCR),调查了每个病例的福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)的组织中的SARS-CoV-2 RNA。SARS-CoV-2病毒基因组通过FFPE肺组织块的NGS测序进行了测序。 文章指出,验尸检查结果显示弥漫性肺泡损伤,未观察到病毒相关的肝、心脏或肾损伤。使用qRT-PCR检测方法,两病例均在肺、支气管、淋巴结和脾脏中检测到病毒RNA。在病例1中使用NGS进行RNA测序揭示了与带有ORF1a L3606F突变的西欧进化枝A2a最一致的突变。 该研究认为,可以从FFPE组织中进行SARS-CoV-2检测和病毒测序。SARS-CoV-2的检测和测序以及死后组织检查的形态学发现可以帮助更好地了解该病毒对人体健康的病理生理影响。 4.附件: 原文链接:https://academic.oup.com/ajcp/advance-article/doi/10.1093/ajcp/aqaa091/5843897?searchresult=1
  • 《9月18日_SARS-CoV-2可在航空旅行中传播》

    • 来源专题:COVID-19科研动态监测
    • 编译者:zhangmin
    • 发布时间:2020-10-13
    • 9月18日,Emerging Infectious Diseases期刊发表题为“In-Flight Transmission of Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2”的文章。文章指出,四名重症SARS-CoV-2感染者曾乘坐同一航班从美国马萨诸塞州波士顿飞往中国香港。作者指出,这四名患者的SARS-CoV-2基因序列是相同并且比较独特,属于香港以前没有发现的进化枝,这有力地表明了该病毒可以在航空旅行中传播。 作者指出,目前还没有发现与该航班相关的其他COVID-19病例。由于并非所有乘客都接受了检测,无法量化该航班的病毒攻击率。之前关于SARS-CoV-2可能在飞机上传播的报告缺乏遗传学证据。2020年1月至3月期间,国际航空运输协会收到了3份疑似飞机上传播的报告。对2名从中国飞往加拿大的乘客进行接触追踪,没有发现该航班有二次感染的迹象。然而,数百名乘务员和飞行员的SARS-CoV-2检测结果呈阳性;至少有2人死亡。作者称,该结果表明SARS-CoV-2可以在飞机上传播。为了防止旅行期间病毒传播,必须继续采取感染控制措施。 原文链接:https://wwwnc.cdc.gov/eid/article/26/11/20-3254_article