RNA病毒编码的RNA依赖性RNA聚合酶(RdRP)是一类独特的核酸聚合酶。每个病毒RdRP都包含一个500-600残留催化模块,其手掌,手指和拇指域形成一个环绕的人类右手结构。七个聚合酶催化基序位于RdRP棕榈和指状结构域中,包括RdRP的最保守部分,并负责催化中仅RNA的特异性。通常发现功能区与RdRP催化模块融合,导致RdRP全局结构和调节机制的高度多样性。在这篇综述中,我们调查了国际病毒分类学委员会(ICTV)2018b收集中列出的正链RNA病毒的所有46种RdRP序列可用病毒家族,并选择了49种RdRP作为代表。通过在RdRP催化基序中定位标志性残基,并参考文献中的结构和功能信息,我们能够估算这些RdRP中催化模块的N和C端边界,从而可以作为参考点来预测其他催化模块以外的功能区域。有趣的是,大量病毒家族可能具有与RdRP N末端融合的其他区域,而只有少数病毒家族在RdRP的C端具有此类区域。关于这些附加区域的当前知识,无论是三维(3D)结构还是功能方面,都非常有限。在正链RNA病毒中有五个RdRP结构可用的病毒家族中,只有黄病毒科具有针对此类区域的3D结构信息。因此,有必要进一步努力解决包含这些区域的全长RdRP结构并剖析它们的功能性贡献,以提高对作为进化整合基团的RdRP蛋白的整体理解,我们的分析可作为选择的指南。这些研究中的代表性RdRP系统。