《科学家发现蓝藻代谢与环境适应的新途径》

  • 来源专题:中国科学院亮点监测
  • 编译者: yanyf@mail.las.ac.cn
  • 发布时间:2018-07-30
  •         4月9日,《自然-化学生物学》(Nature Chemical Biology)杂志在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所杨琛研究组题为The cyanobacterial ornithine-ammonia cycle involves an arginine dihydrolase 的研究论文。该研究利用动态代谢流量组与代谢组分析技术发现了一条新的代谢途径,并且揭示了该途径为蓝藻适应环境所必需及其重要的进化及生态学意义。

      生物在进化过程中形成适应外界营养环境变化的代谢系统及调控机制。例如,陆生动物进化出著名的鸟氨酸-尿素循环,用于处理食物中蛋白质分解代谢所产生的大量氨,而细菌和植物缺乏这一代谢途径。蓝藻(又名蓝细菌)是地球上最早出现的光合自养生物,它们利用水作为电子供体,利用太阳光能将CO2还原成有机碳化合物,并释放出自由氧,在地球生物圈形成和发展过程中起了关键作用。蓝藻广泛分布于自然界,包括各种水体和土壤中,对生物地球化学循环有非常重要的贡献。同时蓝藻在生物技术应用方面也极具潜力。尽管蓝藻在进化、生态、环境及生物技术等方面扮演着重要角色,但它们适应环境变化的细胞代谢动态调节机制仍不清楚。

      中国科学院合成生物学重点实验室杨琛研究组利用前期开发的动态代谢流量组与代谢组分析技术,研究了蓝藻对外界氮源扰动的代谢响应,发现细胞内鸟氨酸和精氨酸之间存在活跃的代谢循环。进而发现该循环包含一步新的生化反应,即精氨酸双水解酶催化精氨酸水解生成鸟氨酸和氨。研究表明在氮源充足条件下鸟氨酸-氨循环促使氮同化及存储以最大速率进行,而在氮源匮乏时该循环使得细胞中的氮储存迅速分解,从而满足细胞的生长需要。因此,鸟氨酸-氨循环具有氮存储和活化的功能,对于蓝藻适应环境氮源缺乏和变化极其重要。与动物体内的鸟氨酸-尿素循环相比,鸟氨酸-氨循环更为古老,它的存在提示不同物种为适应其生存环境可能进化出各种鸟氨酸循环。鸟氨酸-氨循环在蓝藻中广泛存在,包括许多海洋固氮蓝藻,因此这一代谢途径对于海洋氮固定乃至地球的氮循环具有重要贡献。专家评论这项工作将引起化学生物学和微生物学领域研究学者的广泛关注,并对海洋学和农业方面的研究产生影响,同时在代谢工程和合成生物学领域应用前景广阔。

      植生生态所博士研究生张昊为论文第一作者,研究员杨琛为通讯作者。该工作是与该所研究员、中国科学院院士赵国屏等合作完成的,得到了国家自然科学基金委、科技部和中国科学院等的项目资助。

相关报告
  • 《中国科学家发现增加水稻穗粒数的新途径》

    • 来源专题:转基因生物新品种培育
    • 编译者:zhangyi8606
    • 发布时间:2019-12-09
    • 1月24日,《植物生物技术》(Plant Biotechnology Journal)在线发表了中国水稻研究所种质创新团队最新成果,该成果解析了水稻小穗内小花数目的发育调控机制,为水稻高产分子设计育种奠定了基础。他们为增加每穗粒数提供了两条新的途径和观点,即通过常规杂交或者基因编辑手段培育“多花小穗”水稻品种从而实现水稻增产。 每穗粒数是水稻产量构成的重要三要素之一。论文通讯作者、中国水稻研究所研究员钱前说,目前,在水稻上通过常规途径增加穗粒数和穗密度实现增产的方法有一定难度,因此研究人员迫切需要寻找一种增加穗粒数的新途径。 论文第一作者、中国水稻研究所副研究员任德勇介绍,前期研究发现,每穗粒数的形成有一个重要的影响因素,即小穗内的小花数,正常水稻一个小穗内只包含1朵花,形成1粒种子。该团队鉴定了一个新等位突变体fon4-7,该突变体使小穗除了产生正常的顶生小花外,还形成一个额外的或者侧生的小花。该研究揭示了FON4调控小穗分生组织的确定性,其突变导致小穗内小花数目不确定,获得形成多花小穗的潜力,进而形成多个种子。 该研究得到了国家自然科学基金委和浙江省自然科学基金委资助。 论文相关信息:https://doi.org/10.1111/pbi.13083
  • 《科学家发现控制苹果质量的基因组》

    • 来源专题:农业科技前沿与政策咨询快报
    • 编译者:郝心宁
    • 发布时间:2017-11-28
    • 由法国农业科学院(INRA)领导的国际联盟,共涉及法国、意大利、德国、荷兰和南非5个国家的科学家,近期,他们结合最新的DNA测序技术与经典测绘方法,发现了控制苹果质量的基因组。该项研究成果为科学家们提供了前所未有的树种基因组成分和进化新观点,为创造新品种提供了新视角。成果发表在2017年6月5日的《自然遗传学》(Nature Genetics)期刊上。 苹果是世界上消费最多的水果之一,全球每年的苹果产量高达8,460万吨。新获取的高质量基因组可以帮助科研人员高效地选择新品种,基因学和表观遗传学研究对识别关键基因,例如水果大小、颜色或抗病性相关的基因,起到了重要作用。根据高密度标记的遗传图谱,可以在代表苹果17条染色体的17个模拟分子中组装拼接该基因组。该基因组组装在280个基因片段中,长度为649.3Mb,包含了42140个基因。 这个新的基因组可以帮助科学家识别2100万年前在苹果基因组中发生的重要基因重排现象。这些变化可能是由于哈萨克斯坦,苹果的起源地天山山脉的出现而产生。这些地质和环境事件可能促成了苹果和梨共同祖先的对比演变。 利用这一超高质量的基因组,科学家能够开展侧重独立DNA序列信息传递的表观遗传学研究,通过表观遗传学研究果实发育。该基因组将成为苹果育种研究人员的重要工具,帮助他们获取基因组进化与调控的知识。这也有助于加快筛选更具抗药性的新品种,减少农药使用,提高苹果质量或使这些品种适应特定环境和气候变化。 (编译 郝心宁)