《Nature丨CD4结合HIV-1 Env异源三聚体的中间构象》

  • 来源专题:战略生物资源
  • 编译者: 李康音
  • 发布时间:2023-11-25
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    2023年11月22日,加州理工学院的研究人员在Nature发表了题为Intermediate conformations of CD4-bound HIV-1 Env heterotrimers的文章。该研究为HIV-1包膜(Env)蛋白在结合不同数量的CD4受体时所采取的中间构象提供了宝贵的见解。

    研究人员工程化了只能结合一个或两个CD4分子的Env异源三聚体,并确定了这些异源三聚体与CD4结合的冷冻电镜结构。研究人员发现,一个CD4受体的结合主要导致Env维持闭合的融合前构象。相比之下,两个CD4分子的结合导致了部分打开的、非对称的构象,其中两个gp120亚基采用CD4结合打开的构象,第三个gp120处于外翻但V1V2没有移位的隐蔽打开状态。值得注意的是,gp41构象与相应的gp120只有部分一致,这表明gp120和gp41的构象变化并非严格耦合的。

    总之,这项研究拓宽了我们对Env在与CD4初期接触过程中构象动力学的视角,指出一个受体的结合一般不足以触发大规模Env重排。两个CD4分子结合的非对称中间态增进了对于gp120和gp41水平上的进入机制理解。稳定不同的构象中间体的能力为结构引导的干预和功能含义的审视提供了新的机会,增进了我们在结构水平上对HIV感染和病毒膜融合早期事件的理解。

  • 原文来源:https://www.nature.com/articles/s41586-023-06639-8
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    • 本文内容转载自“生命科学前沿”微信公众号。原文链接: https://mp.weixin.qq.com/s/h0ZuXDEsyHxGOPzIR9TRuQ 2023年11月22日,耶鲁大学Walther Mothes团队在Nature杂志在线发表了题为HIV-1 Env trimers asymmetrically engage CD4 receptors in membranes的文章。 研究人员利用冷冻电镜断层成像(cryo-electron tomography, cryo-ET)技术捕捉艾滋病毒刺突蛋白Env与细胞受体CD4在膜间的相互作用,并首次观察到了完整全长的两者在病毒颗粒与细胞膜泡之间的结合。但受限于细胞膜泡的制备以及cryo-ET对样品大小的限制(<500纳米),所观察到的Env-CD4复合体不足以提供更多的结构细节。为克服这些限制,研究人员创造性地用另一种病毒颗粒MLV(murine leukemia virus)展示细胞受体CD4。相比于细胞膜泡,病毒颗粒形状相对规则,大小相对均一,并且制备相对简单,是cyro-ET技术的理想样品。 这项研究揭示了艾滋病毒刺突蛋白如何与细胞受体CD4在膜间相互作用。为Env-CD4复合物在膜-膜界面的富集与重排提供了直接证据。更展示了两种从未被报道过的中间结构,三聚体刺突蛋白仅结合一个或者两个CD4分子。即便结合三个CD4分子,由于膜上的空间位阻,刺突蛋白仍然远离辅助受体。这些现象都是此前可溶解蛋白结构研究中未能观察到的。
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    • 编译者:hujm
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    • 在发现HIV病毒近40年后,它已经杀死了3630万人,但迄今为止仍然没有有效的疫苗问世。不过,在一项新的研究中,来自美国威斯达研究所的研究人员在开发HIV疫苗的方向上迈出了充满希望的一步。他们首次证实了使用一种独特的天然样env三聚体(native-like trimer,即类似于天然env三聚体的三聚体)在小鼠中产生对对抗HIV非常重要的Tier-2中和抗体的前景。相关研究结果于2022年2月4日发表在Nature Communications期刊上,论文标题为“Induction of tier-2 neutralizing antibodies in mice with a DNA-encoded HIV envelope native like trimer”。 以前,使用候选疫苗激发这些类型的抗体需要在大型动物模型中进行漫长而昂贵的实验,这对HIV-1疫苗的开发造成了重大瓶颈。论文通讯作者、威斯达研究所疫苗与免疫治疗中心副教授Daniel Kulp博士说,“有了我们的新发现,我们在一种能够产生Tier-2中和抗体的模型中打开了快速、迭代疫苗学的大门,使更先进的HIV疫苗概念的开发成为可能。” 这些作者将这种天然样env三聚体编码到DNA中,以便递送到小鼠体内。这有一个实际的好处,就是把宿主的身体变成了“抗原工厂”,而不是需要一个复杂的疫苗制造过程。他们随后比较了给予DNA编码的天然样env三聚体的小鼠和接受标准蛋白免疫的小鼠的结果。只有那些接受了DNA编码的本天然样env三聚体的小鼠产生了Tier-2中和抗体。 一旦他们验证了他们的免疫方案产生了Tier-2中和抗体,Kulp和他的同事们从这些小鼠身上分离出单克隆抗体,并使用低温电镜来确定一种Tier-2中和单克隆抗体的原子结构。他们发现,该抗体与一个名为C3V5的表位结合。在标准HIV疫苗模型(非人类灵长类动物)中,先前的研究已表明与C3V5结合的抗体可以保护这些动物免受SHIV感染,其中SHIV感染非人类灵长类动物,是HIV的近亲。 Kulp说,“这种结构让我们对这种抗体如何能够中和这种病毒有了难以置信的了解。我们首次可以就如何设计能够产生针对C3V5表位的广泛中和抗体反应的新疫苗制定策略。” 论文共同作者、威斯达研究所疫苗与免疫治疗中心主任David B. Weiner博士强调了他们的发现的有用性。“我们所做的是让经过结构设计的免疫原在体内直接自组装,这些免疫原用核酸技术设计和递送到动物体内。我们的数据表明,诱导自体Tier 2中和说明了这种方法作为一种工具的价值,它可以通过定制免疫来对抗一种很难根除的病原体(比如HIV)的脆弱位点。” 参考资料: Ziyang Xu et al. Induction of Tier-2 Neutralizing Antibodies in Mice with a DNA-encoded HIV Envelope Native Like Trimer. Nature Communications, 2022, doi:10.1038/s41467-022-28363-z.